The project is focused on the study of meningococcal populations by the whole genome sequencing (WGS) method. The WGS method enables a more accurate differentiation between Neisseria meningitidis isolates in comparison with the conventional sequencing methods and allows the study of virulence factors of this agent. WGS will be used to analyse selected isolates from healthy carriers, paired isolates from patients with invasive meningococcal disease (IMD) and their healthy contacts, paired isolates from different clinical specimens of the same IMD patients. WGS data will be analysed from the perspective of clonal characterisation of N. meningitidis populations, for the presence of virulence genes and for the possibility of coverage by meningococcal B vaccines. The results will improve our understanding of the role of the carriage of N. meningitidis and will provide information on the potential of new meningococcal B vaccines for reducing this carriage. The results of the project will be used as the basis for the recommendation for updating the vaccination strategy in the Czech Republic.

Projekt je zaměřen na studium populací meningokoků metodou sekvenace celého genomu (WGS). Tato nová sekvenační metoda dává možnost nejen přesnějšího odlišení izolátů Neisseria meningitidis ve srovnání s předchozími klasickými sekvenačními metodami, ale umožňuje i studium faktorů virulence tohoto agens. Pro studium metodou WGS budou vybrány izoláty od zdravých nosičů, párové izoláty od pacientů s invazivním meningokokovým onemocněním a jejich zdravých kontaktů a párové izoláty z různého klinického materiálu od pacientů s invazivním meningokokovým onemocněním. Data WGS získaná řešením projektu budou analyzována nejen z hlediska klonality populací N. meningitidis, ale i z hlediska přítomnosti genů virulence a možnosti pokrytí vakcínami proti N. meningitidis B. Výsledky řešení projektu prohloubí znalosti o faktorech virulence meningokoků, o úloze nosičství N. meningitidis v šíření invazivního meningokokového onemocnění, o možnosti redukování nosičství N. meningitidis novými vakcínami proti meningokoku B a budou podkladem doporučení pro aktualizaci vakcinační strategie v České republice.

Study of meningococcal population by the whole genome sequencing method - base for update of vaccination strategy

Doba řešení: 2019-2022

Obsahuje literaturu