Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Testování DHPLC analýzy pro detekci mutací u hemofilie A
[Evaluation of DHPLC analysis for mutation detection in haemophilia A]

David Habart, Z. Kleibl, I. Hrachovinová

. 2006 ; Roč. 145 (č. 6) : s. 484-487.

Jazyk čeština, angličtina Země Česko

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc06010119

Grantová podpora
NM7615 MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

Východisko. Hemofilie A je jednou z nejčastějších vrozených krvácivých poruch. Znalost molekulární příčiny onemocnění je využívána při genetickém poradenství a pomáhá odhadnout riziko závažné komplikace standardní léčby (inhibitor faktoru VIII). Deficit faktoru VIII je způsoben širokým spektrem mutací. Pouze inverze s místy zlomu v intronech 22, respektive 1 se vyskytují častěji. Ostatní mutace je nutno hledat v celém rozsahu 26 exonů kódujících 9 kb mRNA a v přilehlých nekódujících sekvencích. Cílem práce bylo metodicky zajistit urychlení genotypizace hemofilických rodin v České republice využitím analýzy amplikonů jednotlivých exonů genu faktoru VIII pomocí denaturační vysokotlaké kapalinové chromatografie. Metody a výsledky. Citlivost metody jsme ověřovali na panelu vzorků DNA se 49 dříve charakterizovanými různými sekvenčními variantami genu faktoru VIII, celkem ve 21 exonech. Všechny testované sekvenční změny byly snadno detekovány. Testování příbuzných ukázalo velmi dobrou reprodukovatelnost jednotlivých elučních profilů. Navíc se podařilo detekovat kauzální mutace u 4 z 5 zjevně nepříbuzných hemofilických rodin, u kterých nebyla předchozí analýza metodou multiplexní CSGE úspěšná. Závěry. Zavedená metoda významně urychlí genotypizaci rodin s hemofilií A v České republice.

Background. Haemophilia A is one of the most prevalent inherited bleeding disorders. Causal mutations in the factor VIII gene are detected to facilitate the genetic counselling and to estimate the risk of serious complication associated with standard treatment (factor VIII inhibitor). Wide range of mutations located across the entire length of the factor VIII gene underlies the factor VIII deficiency of variable severity. The only two common recurrent mutations in the factor VIII gene are intron 22 and intron 1 inversions. In the remaining cases it is necessary to screen all 26 exons encoding 9kb mRNA together with adjacent nonncoding sequences. In order to speed up genotyping in haemophilia A families in the Czech Republic we evaluated DHPLC-based screening technique. Methods and Results.We tested sensitivity of the analysis on a panel of DNA samples containing 49 different sequence variations distributed over 21 exons. All the genetic alterations were readily detected. Analysis of family members has shown good reproducibility of the respective elution patterns. DHPLC analysis detected mutations in 4 out of 5 samples from apparently unrelated haemophilia patients, where previously applied multiplex CSGE was not successful. Conclusions. Establishing of DHPLC analysis will substantially speed up the genotyping of haemophilia A families in the Czech Republic

Evaluation of DHPLC analysis for mutation detection in haemophilia A

Testování DHPLC analýzy pro detekci mutací u hemofilie A = Evaluation of DHPLC analysis for mutation detection in haemophilia A /

Bibliografie atd.

Lit. 25

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc06010119
003      
CZ-PrNML
005      
20130725102247.0
008      
061005s2006 xr u cze||
009      
AR
035    __
$a (PubMed)16836003
040    __
$a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a cze $a eng
044    __
$a xr
100    1_
$a Habart, David $4 aut $7 xx0035016
245    10
$a Testování DHPLC analýzy pro detekci mutací u hemofilie A = $b Evaluation of DHPLC analysis for mutation detection in haemophilia A / $c David Habart, Z. Kleibl, I. Hrachovinová
246    11
$a Evaluation of DHPLC analysis for mutation detection in haemophilia A
314    __
$a Ústav hematologie a krevní transfuze, Praha 2, CZ
504    __
$a Lit. 25
520    3_
$a Východisko. Hemofilie A je jednou z nejčastějších vrozených krvácivých poruch. Znalost molekulární příčiny onemocnění je využívána při genetickém poradenství a pomáhá odhadnout riziko závažné komplikace standardní léčby (inhibitor faktoru VIII). Deficit faktoru VIII je způsoben širokým spektrem mutací. Pouze inverze s místy zlomu v intronech 22, respektive 1 se vyskytují častěji. Ostatní mutace je nutno hledat v celém rozsahu 26 exonů kódujících 9 kb mRNA a v přilehlých nekódujících sekvencích. Cílem práce bylo metodicky zajistit urychlení genotypizace hemofilických rodin v České republice využitím analýzy amplikonů jednotlivých exonů genu faktoru VIII pomocí denaturační vysokotlaké kapalinové chromatografie. Metody a výsledky. Citlivost metody jsme ověřovali na panelu vzorků DNA se 49 dříve charakterizovanými různými sekvenčními variantami genu faktoru VIII, celkem ve 21 exonech. Všechny testované sekvenční změny byly snadno detekovány. Testování příbuzných ukázalo velmi dobrou reprodukovatelnost jednotlivých elučních profilů. Navíc se podařilo detekovat kauzální mutace u 4 z 5 zjevně nepříbuzných hemofilických rodin, u kterých nebyla předchozí analýza metodou multiplexní CSGE úspěšná. Závěry. Zavedená metoda významně urychlí genotypizaci rodin s hemofilií A v České republice.
520    9_
$a Background. Haemophilia A is one of the most prevalent inherited bleeding disorders. Causal mutations in the factor VIII gene are detected to facilitate the genetic counselling and to estimate the risk of serious complication associated with standard treatment (factor VIII inhibitor). Wide range of mutations located across the entire length of the factor VIII gene underlies the factor VIII deficiency of variable severity. The only two common recurrent mutations in the factor VIII gene are intron 22 and intron 1 inversions. In the remaining cases it is necessary to screen all 26 exons encoding 9kb mRNA together with adjacent nonncoding sequences. In order to speed up genotyping in haemophilia A families in the Czech Republic we evaluated DHPLC-based screening technique. Methods and Results.We tested sensitivity of the analysis on a panel of DNA samples containing 49 different sequence variations distributed over 21 exons. All the genetic alterations were readily detected. Analysis of family members has shown good reproducibility of the respective elution patterns. DHPLC analysis detected mutations in 4 out of 5 samples from apparently unrelated haemophilia patients, where previously applied multiplex CSGE was not successful. Conclusions. Establishing of DHPLC analysis will substantially speed up the genotyping of haemophilia A families in the Czech Republic
650    _2
$a hemofilie A $x genetika $7 D006467
650    _2
$a mutační analýza DNA $7 D004252
650    _2
$a vysokoúčinná kapalinová chromatografie $7 D002851
650    _2
$a denaturace nukleových kyselin $7 D009691
650    _2
$a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
650    _2
$a senzitivita a specificita $7 D012680
650    _2
$a faktor VIII $x genetika $7 D005169
650    _2
$a finanční podpora výzkumu jako téma $7 D012109
650    _2
$a lidé $7 D006801
700    1_
$a Kleibl, Zdeněk, $d 1969- $4 aut $7 jo2003183974
700    1_
$a Hrachovinová, Ingrid $4 aut $7 xx0059976
773    0_
$w MED00010976 $t Časopis lékařů českých $g Roč. 145, č. 6 (2006), s. 484-487 $x 0008-7335
856    41
$y plný text volně přístupný $u https://www.prolekare.cz/casopisy/casopis-lekaru-ceskych/2006-6/testovani-dhplc-analyzy-pro-detekci-mutaci-u-hemofilie-a-3100
910    __
$a ABA008 $b B 1 $c 1068 $y 0
913    __
$a CZ $b NH7615 Česko. Ministerstvo zdravotnictví. Interní grantová agentura
990    __
$a 20061011 $b ABA008
991    __
$a 20130725102738 $b ABA008
BAS    __
$a 3
BMC    __
$a 2006 $b Roč. 145 $c č. 6 $d s. 484-487 $i 0008-7335 $m Časopis lékařů českých $x MED00010976
GRA    __
$a NM7615 $p MZ0
LZP    __
$b přidání abstraktu

Najít záznam

Citační ukazatele

Pouze přihlášení uživatelé

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...