-
Something wrong with this record ?
Hmotově-spektrometrické vlastnosti imidazolových ribosidů
[Mass-spectrometric properties of imidazol ribosides]
David Friedecký, Petra Vyskočilová, Petr Fryčák, Petr Hornik, Karel Lemr, Tomáš Adam
Language Czech Country Czech Republic
Grant support
NR8578
MZ0
CEP Register
Digital library NLK
Full text - Article
Full text - Část
Issue
Volume
Source
Source
Source
- MeSH
- Aminoimidazole Carboxamide diagnostic use chemistry MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Gas Chromatography-Mass Spectrometry methods MeSH
- Purine-Pyrimidine Metabolism, Inborn Errors diagnosis enzymology MeSH
- Ribonucleosides diagnostic use chemical synthesis chemistry MeSH
Cíl: V současné době byly identifikovány tři defekty v purinové de novo syntéze (PDNS). V případě deficitních enzymů jsou v tělních tekutinách pacientů akumulovány abnormální defosforylované substráty (aminoimidazolové ribosidy). Cílem této práce bylo studovat hmotově-spektrometrické vlastnosti aminoimidazolových ribosidů spojených s druhou polovinou PDNS. Metody: Aminoimidazolové ribosidy byly syntetizovány a chemicky charakterizovány. Technika kapalinová chromatografie s hmotnostní spektrometrií byla aplikována pro strukturní identifikaci. MS analýza byla provedena na LCQ hmotnostním spektrometru s iontovou pastí (Finnigan MAT, San Jose, USA). Pro ionizaci byla zvolena chemická ionizace za atmosferického tlaku. Výsledky: Účinnost syntézy ribosidů byla více než 90% a obdržená fragmentační spektra potvrdila jejich identitu. Při fragmentaci ztrácí imidazolový kruh substituenty ve formě malých molekul (NH3, CO2 nebo CO). Sukcinylaminoimidazol karboxamid ribosidu (SAICAr) odštěpuje buď N-sukcinokarboxamid jako celek, nebo se z něj pouze odštěpují skupiny vody z karboxylových skupin. Otevření imidazolového kruhu nebylo sledováno u žádné látky. Závěr: Výše popsaná charakteristika může být užitečná pro vývoj nových metod pro diagnostiku známých či zatím neodhalených defektů druhé poloviny PDNS.
Objectives: Three defects have been identified in purine de novo synthesis (PDNS). Dephosphorylated substrates (imidazole ribosides) of the deficient enzymes are accumulated in body fluids in affected patients. The aim of this work was to investigate mass spectrometric properties of aminoimidazole ribosides related to the second half of PDNS. Methods: These aminoimidazole ribosides were synthesised and chemically characterised. Liquid chromatography- -mass spectrometry technique was applied for structural identification. MS analysis was carried out using an LCQ ion trap mass spectrometer (Finnigan MAT, San Jose, USA). Atmospheric pressure chemical ionization source was employed. Results: Synthesis yielded ribosides with more than 90% purity and obtained fragmentation spectra confirmed their identity. The imidazole ring loses its substituents in the form of small molecules (NH3, CO2 or CO) in mass spectrometry fragmentation. The N-succinocarboxamide group of succinylaminoimidazole carboxamide riboside (SAICAr) either loses water from the free carboxyl groups or breaks away as a whole. Opening of the imidazole ring was not observed for any compound. Conclusions: Characteristics described above can be useful for development of new methods for diagnosing of known as well as unrevealed defects of second part of PDNS.
Mass-spectrometric properties of imidazol ribosides
Grant č. NR/8578-3/2005 Česko. Ministerstvo zdravotnictví. Interní grantová agentura -- Grant č. 6198959205 Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Bibliography, etc.Lit.: 5
- 000
- 04861naa 2200433 a 4500
- 001
- bmc07502433
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20131008094745.0
- 008
- 080321s2007 xr e cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Friedecký, David $7 xx0142900
- 245 10
- $a Hmotově-spektrometrické vlastnosti imidazolových ribosidů / $c David Friedecký, Petra Vyskočilová, Petr Fryčák, Petr Hornik, Karel Lemr, Tomáš Adam
- 246 11
- $a Mass-spectrometric properties of imidazol ribosides
- 314 __
- $a Oddělení klinické biochemie, Laboratoř dědičných metabolických poruch, FN UP, Olomouc
- 500 __
- $a Grant č. NR/8578-3/2005 Česko. Ministerstvo zdravotnictví. Interní grantová agentura -- Grant č. 6198959205 Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
- 504 __
- $a Lit.: 5
- 520 3_
- $a Cíl: V současné době byly identifikovány tři defekty v purinové de novo syntéze (PDNS). V případě deficitních enzymů jsou v tělních tekutinách pacientů akumulovány abnormální defosforylované substráty (aminoimidazolové ribosidy). Cílem této práce bylo studovat hmotově-spektrometrické vlastnosti aminoimidazolových ribosidů spojených s druhou polovinou PDNS. Metody: Aminoimidazolové ribosidy byly syntetizovány a chemicky charakterizovány. Technika kapalinová chromatografie s hmotnostní spektrometrií byla aplikována pro strukturní identifikaci. MS analýza byla provedena na LCQ hmotnostním spektrometru s iontovou pastí (Finnigan MAT, San Jose, USA). Pro ionizaci byla zvolena chemická ionizace za atmosferického tlaku. Výsledky: Účinnost syntézy ribosidů byla více než 90% a obdržená fragmentační spektra potvrdila jejich identitu. Při fragmentaci ztrácí imidazolový kruh substituenty ve formě malých molekul (NH3, CO2 nebo CO). Sukcinylaminoimidazol karboxamid ribosidu (SAICAr) odštěpuje buď N-sukcinokarboxamid jako celek, nebo se z něj pouze odštěpují skupiny vody z karboxylových skupin. Otevření imidazolového kruhu nebylo sledováno u žádné látky. Závěr: Výše popsaná charakteristika může být užitečná pro vývoj nových metod pro diagnostiku známých či zatím neodhalených defektů druhé poloviny PDNS.
- 520 9_
- $a Objectives: Three defects have been identified in purine de novo synthesis (PDNS). Dephosphorylated substrates (imidazole ribosides) of the deficient enzymes are accumulated in body fluids in affected patients. The aim of this work was to investigate mass spectrometric properties of aminoimidazole ribosides related to the second half of PDNS. Methods: These aminoimidazole ribosides were synthesised and chemically characterised. Liquid chromatography- -mass spectrometry technique was applied for structural identification. MS analysis was carried out using an LCQ ion trap mass spectrometer (Finnigan MAT, San Jose, USA). Atmospheric pressure chemical ionization source was employed. Results: Synthesis yielded ribosides with more than 90% purity and obtained fragmentation spectra confirmed their identity. The imidazole ring loses its substituents in the form of small molecules (NH3, CO2 or CO) in mass spectrometry fragmentation. The N-succinocarboxamide group of succinylaminoimidazole carboxamide riboside (SAICAr) either loses water from the free carboxyl groups or breaks away as a whole. Opening of the imidazole ring was not observed for any compound. Conclusions: Characteristics described above can be useful for development of new methods for diagnosing of known as well as unrevealed defects of second part of PDNS.
- 650 _2
- $a poruchy metabolismu purinů a pyrimidinů $x diagnóza $x enzymologie $7 D011686
- 650 _2
- $a aminoimidazolkarboxamid $x diagnostické užití $x chemie $7 D000620
- 650 _2
- $a ribonukleosidy $x diagnostické užití $x chemická syntéza $x chemie $7 D012263
- 650 _2
- $a plynová chromatografie s hmotnostně spektrometrickou detekcí $x metody $7 D008401
- 650 _2
- $a finanční podpora výzkumu jako téma $7 D012109
- 700 1_
- $a Vyskočilová, Petra. $7 _BN002462
- 700 1_
- $a Fryčák, Petr. $7 _BN002463
- 700 1_
- $a Hornik, Petr, $d 1980 únor 10.- $7 mzk2007411148
- 700 1_
- $a Lemr, Karel, $d 1963- $7 ola2002157903
- 700 1_
- $a Adam, Tomáš, $d 1965- $7 xx0054162
- 773 0_
- $w MED00011026 $t Klinická biochemie a metabolismus $g Roč. 15, č. 4 (2007), s. 212-214 $x 1210-7921
- 856 41
- $u http://www.cskb.cz/res/file/KBM-pdf/2007/4-07/KBM_04_07_FriedeckyD_212.pdf $y plný text volně přístupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1822 $c 374 a $y 1 $z 0
- 990 __
- $a 20080320154736 $b ABA008
- 991 __
- $a 20131008095307 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 618052 $s 470484
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2007 $b 15 $c 4 $d 212-214 $i 1210-7921 $m Klinická biochemie a metabolismus $x MED00011026
- GRA __
- $a NR8578 $p MZ0
- LZP __
- $a 2007-24/mkmv