-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Využití DNA diagnostiky u pacientů s povrchovou keratitidou virového původu
[Applying the DNA diagnostics in patients with superficial keratitis of viral origin]
Hlinomazová Zuzana, Šerý O., Horáčková M., Pitelová R., Loukotová V., Vlková E.
Jazyk čeština Země Česko
Grantová podpora
NR8507
MZ0
CEP - Centrální evidence projektů
- Klíčová slova
- EliDNA Store Kit, UltraClean DNA Tissue, RealTIme, TaqMan, Applied Biosystems RealTime System 7300, End-Point PCR,
- MeSH
- adenovirové infekce lidí diagnóza MeSH
- financování organizované MeSH
- herpetické infekce diagnóza MeSH
- keratitida diagnóza klasifikace virologie MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce využití MeSH
- prospektivní studie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Cíl: Autoři hodnotí význam DNA diagnostiky u pacientů s povrchovou keratitidou virového původu a její možnosti využití pro sledování účinnosti léčby. DNA analýzou byla stanovena přítomnost virů HSV1, HSV2, VZV a adenovirů. Materiál a metodika: Sledovaný soubor tvořilo 54 pacientů (33 mužů a 21 žen) průměrného věku 45,6 ± 9,5 let, kteří byli na naší klinice léčeni pro povrchovou keratitidu či keratouveitidu virového původu. Jednorázovou mikropipetou a vatovým tamponem byl proveden stěr z místa postižení a bylo odebráno cca 50 µl slz ze spojivkového vaku.Tampón i slzy byly protřepány s pufrem EliDNA Store Kit (ELISABETH PHARMACON, ČR), který zabraňuje degradaci DNA a umožňuje skladování a přepravu vzorků při pokojové teplotě. Po transportu do laboratoře byla ze vzorků izolována DNA pomocí kolonek kitem UltraClean DNA Tissue (Mo- Bio, USA). Izolovaná DNA posloužila pro detekci virů HSV1, HSV2, VZV a adenovirů pomocí nested PCR. Všechny vzorky byly dále prověřeny na přítomnost HSV1 in house metodikou RealTime s využitím próby TaqMan a přístroje Applied Biosystems RealTime System 7300. Při zjištění pozitivního výsledku pomocí DNA analýzy byl proveden kontrolní odběr po 7–10denních intervalech do negativního výsledku a dále také při suspektní recidivě onemocnění. Kontrolní vyšetření bylo prováděno také kultivačně ze stejného materiálu jinou laboratoří. Výsledky: Celkem bylo provedeno 82 odběrů a 230 DNA analýz. DNA diagnostika prokázala přítomnost HSV1 DNA u 28 pacientů, v jednom případě byla detekována DNA VZV a 16 pacientů bylo pozitivních na ADV. Pozitivita vzorků pro HSV1 byla ověřena in house metodou RealTime PCR i komerčně dostupným in vitro diagnostickým zdravotnickým prostředkem End-Point PCR HSV1/2 (Nanogen Advanced Diagnostics, Itálie). Všechna kontrolní vyšetření prováděná v jiné laboratoři vyšla kultivačně negativní. Opakovaně byla detekce pro monitorování léčby provedena u 9 pacientů. Závěr: DNA diagnostika se jeví jako rychlá a účelná metoda zjištění etiologického agens u pacientů s povrchovou keratitidou, která umožňuje velmi přesné monitorování účinnosti léčby.
Aim: The authors evaluate the significance of the DNA diagnostics in patients with superficial keratitis of viral origin and their capability to be used for monitoring of the treatment effectiveness in the follow-up. The presence of herpes simplex virus 1 and 2, varicella zoster virus (HSV 1, HSV 2, VZV), and adenoviruses was assessed by means of the DNA analysis. Material and methods: The group consisted of 54 patients (33 men and 21 women), mean age 45.6 ± 9.5 years, who were treated at the Eye Department for superficial keratitis or keratouveitis of viral origin. A sample from the involved place was taken with a cotton swab and a sample of approx. 50 µL of tears was taken from the conjunctival sac with a single-use micropipette. The cotton swab and the tears were shaken with the EliDNA Store Kit (ELISABETH PHARMACON, Czech Republic) buffer, which prevents the DNA degradation and allows the storage and transport of samples at the room temperature. After the transportation in to the laboratory, the DNA was isolated by means of the UltraClean DNA Tissue Kit (MoBio, U.S.A.).The isolated DNA was used for HSV 1, HSV 2, VZV, and adenoviruses detection by means of PCR (polymerase chain reaction). All samples were screened for the HSV1 presence using the in-house RealTime method with TaqMan probe and the Applied Biosystems RealTime System 7300 device. In case of positive result of the DNA analysis, control samples were taken in 7 – 10 days periods until negative result was obtained; another sample was taken in case of suspected relapse. The control examination was also performed by means of cultivation from the same sample by another laboratory. Results: Altogether 82 samples were taken and 230 DNA analyses were performed. The DNA diagnostics proved the presence of HSV 1 DNA in 28 patients, in one case, VZV DNA was detected, and 16 patients were positive on adenoviruses. The HSV 1 positive samples were confirmed by means of in-house RealTime PCR method as well as commercially available in vitro diagnostic healthcare device End-Point PCR HSV1/2 (Nanogen Advanced Diagnostics, Italy). All cultivation control examinations performed in another laboratory were negative. The samples were taken repeatedly in 9 patients to monitor the efficacy of the treatment. Summary:The DNA diagnostics seem to be a fast and reliable method to determine the etiological agent in patients with superficial keratitis and allow very accurate monitoring of the treatment efficacy.
Applying the DNA diagnostics in patients with superficial keratitis of viral origin
Lit.: 10
- 000
- 06925naa 2200505 a 4500
- 001
- bmc07509288
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20131011100457.0
- 008
- 080923s2008 xr e cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hlinomazová, Zuzana, $d 1964- $7 nlk20010099055
- 245 10
- $a Využití DNA diagnostiky u pacientů s povrchovou keratitidou virového původu / $c Hlinomazová Zuzana, Šerý O., Horáčková M., Pitelová R., Loukotová V., Vlková E.
- 246 11
- $a Applying the DNA diagnostics in patients with superficial keratitis of viral origin
- 314 __
- $a Oční klinika LF MU a FN, Brno-Bohunice
- 504 __
- $a Lit.: 10
- 520 3_
- $a Cíl: Autoři hodnotí význam DNA diagnostiky u pacientů s povrchovou keratitidou virového původu a její možnosti využití pro sledování účinnosti léčby. DNA analýzou byla stanovena přítomnost virů HSV1, HSV2, VZV a adenovirů. Materiál a metodika: Sledovaný soubor tvořilo 54 pacientů (33 mužů a 21 žen) průměrného věku 45,6 ± 9,5 let, kteří byli na naší klinice léčeni pro povrchovou keratitidu či keratouveitidu virového původu. Jednorázovou mikropipetou a vatovým tamponem byl proveden stěr z místa postižení a bylo odebráno cca 50 µl slz ze spojivkového vaku.Tampón i slzy byly protřepány s pufrem EliDNA Store Kit (ELISABETH PHARMACON, ČR), který zabraňuje degradaci DNA a umožňuje skladování a přepravu vzorků při pokojové teplotě. Po transportu do laboratoře byla ze vzorků izolována DNA pomocí kolonek kitem UltraClean DNA Tissue (Mo- Bio, USA). Izolovaná DNA posloužila pro detekci virů HSV1, HSV2, VZV a adenovirů pomocí nested PCR. Všechny vzorky byly dále prověřeny na přítomnost HSV1 in house metodikou RealTime s využitím próby TaqMan a přístroje Applied Biosystems RealTime System 7300. Při zjištění pozitivního výsledku pomocí DNA analýzy byl proveden kontrolní odběr po 7–10denních intervalech do negativního výsledku a dále také při suspektní recidivě onemocnění. Kontrolní vyšetření bylo prováděno také kultivačně ze stejného materiálu jinou laboratoří. Výsledky: Celkem bylo provedeno 82 odběrů a 230 DNA analýz. DNA diagnostika prokázala přítomnost HSV1 DNA u 28 pacientů, v jednom případě byla detekována DNA VZV a 16 pacientů bylo pozitivních na ADV. Pozitivita vzorků pro HSV1 byla ověřena in house metodou RealTime PCR i komerčně dostupným in vitro diagnostickým zdravotnickým prostředkem End-Point PCR HSV1/2 (Nanogen Advanced Diagnostics, Itálie). Všechna kontrolní vyšetření prováděná v jiné laboratoři vyšla kultivačně negativní. Opakovaně byla detekce pro monitorování léčby provedena u 9 pacientů. Závěr: DNA diagnostika se jeví jako rychlá a účelná metoda zjištění etiologického agens u pacientů s povrchovou keratitidou, která umožňuje velmi přesné monitorování účinnosti léčby.
- 520 9_
- $a Aim: The authors evaluate the significance of the DNA diagnostics in patients with superficial keratitis of viral origin and their capability to be used for monitoring of the treatment effectiveness in the follow-up. The presence of herpes simplex virus 1 and 2, varicella zoster virus (HSV 1, HSV 2, VZV), and adenoviruses was assessed by means of the DNA analysis. Material and methods: The group consisted of 54 patients (33 men and 21 women), mean age 45.6 ± 9.5 years, who were treated at the Eye Department for superficial keratitis or keratouveitis of viral origin. A sample from the involved place was taken with a cotton swab and a sample of approx. 50 µL of tears was taken from the conjunctival sac with a single-use micropipette. The cotton swab and the tears were shaken with the EliDNA Store Kit (ELISABETH PHARMACON, Czech Republic) buffer, which prevents the DNA degradation and allows the storage and transport of samples at the room temperature. After the transportation in to the laboratory, the DNA was isolated by means of the UltraClean DNA Tissue Kit (MoBio, U.S.A.).The isolated DNA was used for HSV 1, HSV 2, VZV, and adenoviruses detection by means of PCR (polymerase chain reaction). All samples were screened for the HSV1 presence using the in-house RealTime method with TaqMan probe and the Applied Biosystems RealTime System 7300 device. In case of positive result of the DNA analysis, control samples were taken in 7 – 10 days periods until negative result was obtained; another sample was taken in case of suspected relapse. The control examination was also performed by means of cultivation from the same sample by another laboratory. Results: Altogether 82 samples were taken and 230 DNA analyses were performed. The DNA diagnostics proved the presence of HSV 1 DNA in 28 patients, in one case, VZV DNA was detected, and 16 patients were positive on adenoviruses. The HSV 1 positive samples were confirmed by means of in-house RealTime PCR method as well as commercially available in vitro diagnostic healthcare device End-Point PCR HSV1/2 (Nanogen Advanced Diagnostics, Italy). All cultivation control examinations performed in another laboratory were negative. The samples were taken repeatedly in 9 patients to monitor the efficacy of the treatment. Summary:The DNA diagnostics seem to be a fast and reliable method to determine the etiological agent in patients with superficial keratitis and allow very accurate monitoring of the treatment efficacy.
- 650 _2
- $a keratitida $x diagnóza $x klasifikace $x virologie $7 D007634
- 650 _2
- $a herpetické infekce $x diagnóza $7 D006566
- 650 _2
- $a adenovirové infekce lidí $x diagnóza $7 D000258
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $x využití $7 D016133
- 650 _2
- $a financování organizované $7 D005381
- 650 _2
- $a prospektivní studie $7 D011446
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 653 00
- $a EliDNA Store Kit
- 653 00
- $a UltraClean DNA Tissue
- 653 00
- $a RealTIme
- 653 00
- $a TaqMan
- 653 00
- $a Applied Biosystems RealTime System 7300
- 653 00
- $a End-Point PCR
- 700 1_
- $a Šerý, Omar, $d 1972- $7 xx0060835
- 700 1_
- $a Horáčková, Monika, $d 1969- $7 xx0037216
- 700 1_
- $a Pitelová, Renáta $7 xx0170386
- 700 1_
- $a Trnková, Věra $7 xx0106090
- 700 1_
- $a Vlková, Eva, $d 1952- $7 nlk20010099047
- 773 0_
- $w MED00010980 $t Česká a slovenská oftalmologie $g Roč. 64, č. 2 (2008), s. 47-51 $x 1211-9059
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/ceska-slovenska-oftalmologie/2008-2/vyuziti-dna-diagnostiky-u-pacientu-s-povrchovou-keratitidou-viroveho-puvodu-1091 $y plný text volně přístupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 202 $c 639 $y 1 $z 0
- 990 __
- $a 20080923113425 $b ABA008
- 991 __
- $a 20131011101021 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 624879 $s 477314
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2008 $b 64 $c 2 $d 47-51 $i 1211-9059 $m Česká a slovenská oftalmologie $x MED00010980
- GRA __
- $a NR8507 $p MZ0
- LZP __
- $a 2008-22/dkmd