-
Something wrong with this record ?
Průkaz boreliové DNA u pacientů s neuroboreliózou
[Detection of spirochetal DNA from patients with neuroborreliosis]
D. Pícha, L. Moravcová, D. Smíšková
Language Czech Country Czech Republic
Document type Research Support, Non-U.S. Gov't, Evaluation Study
- MeSH
- Borrelia burgdorferi * genetics MeSH
- DNA, Bacterial genetics blood urine MeSH
- DNA Primers * MeSH
- Humans MeSH
- Lyme Neuroborreliosis * genetics blood urine MeSH
- Polymerase Chain Reaction statistics & numerical data MeSH
- Prospective Studies MeSH
- Sensitivity and Specificity MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Publication type
- Evaluation Study MeSH
- Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
Cíl: Ověření významu průkazu DNA Borrelia burgdorferi sensu lato u nervových forem lymeské boreliózy. Soubor a metodika: Bylo vyšetřeno 71 hospitalizovaných pacientů s prokázanou neuroboreliózou. Polymerázová řetězová reakce (PCR) byla vyšetřována paralelně v plazmě, moči a mozkomíšním moku před léčbou a po léčbě a dále po třech a šesti měsících v plazmě a moči. DNA byla izolována pomocí QIAamp DNA Mini Kitu. PCR probíhala jako dvoustupňová amplifikace (nested PCR). Každý biologický materiál byl testován paralelně pomocí pěti amplifikačních systémů: dva primery byly specifické pro plazmidové geny kódující OspA a OspC protein a tři pro chromozomální geny kódující 16S rDNA, flagelin a p66 protein. Výsledky: Z celkového počtu 71 pacientů byla alespoň v jedné tělní tekutině prokázána DNA před léčbou u 51 (71,8 %). Po léčbě byla DNA detekována u 25 pacientů (35,2 %). Po třech měsících pozitivita přetrvávala nadále u 19 (26,8 %) a po šesti měsících u pěti (7 %) nemocných. Nejvíce pozitivních výsledků bylo dosaženo pro 16S rDNA systém, o něco nižší citlivost byla zachycena s primery pro OspA, OspC a flagelin, nejnižší vykazoval p66 systém. Závěr: Boreliová DNA byla prokázána nejčastěji v mozkomíšním moku, méně v moči a nejmenší záchyt byl v plazmě. Pozitivita PCR během sledovaného období klesala postupně, u části pacientů byl test pozitivní ještě po šesti měsících. Z důvodu zlepšení diagnostické senzitivity lze doporučit paralelní vyšetření minimálně dvou cílových sekvencí. Na základě uvedených skutečností lze vyšetření DNA použít pouze jako doplňující test za předpokladu správné klinické interpretace jeho výsledků.
Aim: To assess the importance of Borrelia burgdorferi sensu lato DNA verification in neuroborreliosis. Material and methods: Seventy-one hospitalized patients with clinically and laboratory-confirmed neuroborreliosis were included. PCR of plasma, urine and CSF was performed in parallel before and after the treatment, and after 3 and 6 months for plasma and urine. DNA was isolated using the QIAamp DNA Mini Kit, PCR was arranged as a two-step amplification (nested PCR). Each sample was examined by the five amplification systems in parallel: two were targeted at plasmide genes encoding OspA and OspC proteins and three at genes for 16S rDNA, flagellin and p66 protein. Results: Of all 71 patients, the specific DNA was found in 51 cases (71.8%) before treatment. After the treatment, the DNA was proven in 25 patients (35.2%). PCR positivity persisted in 19 (26.8%) after three months and still in five (7%) patients after six months. The highest frequency of PCR-positive results was obtained by the 16S rDNA system, slightly lower sensitivity was achieved with the OspA, OspC and flagellin primers and the lowest frequency of positives was in the p66 target. Conclusion: Borrelial DNA was most frequently found in CSF, less frequently in urine and the lowest number of positive results were in plasma. PCR positivity decreased gradually during the observation period, the test was still positive in some patients after six months. It is possible to recommend testing with a minimum of two target sequences to improve diagnostic sensitivity. Our results suggest that the PCR testing should only be used in neuroborreliosis as an supplementary diagnostic method and subject to correct clinical interpretation.
Detection of spirochetal DNA from patients with neuroborreliosis
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc16028756
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20161018133723.0
- 007
- ta
- 008
- 161007s2016 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Pícha, Dušan, $u Klinika infekčních nemocí 2. LF UK a Nemocnice Na Bulovce, Praha $d 1957- $7 skuk0004583
- 245 10
- $a Průkaz boreliové DNA u pacientů s neuroboreliózou / $c D. Pícha, L. Moravcová, D. Smíšková
- 246 31
- $a Detection of spirochetal DNA from patients with neuroborreliosis
- 520 3_
- $a Cíl: Ověření významu průkazu DNA Borrelia burgdorferi sensu lato u nervových forem lymeské boreliózy. Soubor a metodika: Bylo vyšetřeno 71 hospitalizovaných pacientů s prokázanou neuroboreliózou. Polymerázová řetězová reakce (PCR) byla vyšetřována paralelně v plazmě, moči a mozkomíšním moku před léčbou a po léčbě a dále po třech a šesti měsících v plazmě a moči. DNA byla izolována pomocí QIAamp DNA Mini Kitu. PCR probíhala jako dvoustupňová amplifikace (nested PCR). Každý biologický materiál byl testován paralelně pomocí pěti amplifikačních systémů: dva primery byly specifické pro plazmidové geny kódující OspA a OspC protein a tři pro chromozomální geny kódující 16S rDNA, flagelin a p66 protein. Výsledky: Z celkového počtu 71 pacientů byla alespoň v jedné tělní tekutině prokázána DNA před léčbou u 51 (71,8 %). Po léčbě byla DNA detekována u 25 pacientů (35,2 %). Po třech měsících pozitivita přetrvávala nadále u 19 (26,8 %) a po šesti měsících u pěti (7 %) nemocných. Nejvíce pozitivních výsledků bylo dosaženo pro 16S rDNA systém, o něco nižší citlivost byla zachycena s primery pro OspA, OspC a flagelin, nejnižší vykazoval p66 systém. Závěr: Boreliová DNA byla prokázána nejčastěji v mozkomíšním moku, méně v moči a nejmenší záchyt byl v plazmě. Pozitivita PCR během sledovaného období klesala postupně, u části pacientů byl test pozitivní ještě po šesti měsících. Z důvodu zlepšení diagnostické senzitivity lze doporučit paralelní vyšetření minimálně dvou cílových sekvencí. Na základě uvedených skutečností lze vyšetření DNA použít pouze jako doplňující test za předpokladu správné klinické interpretace jeho výsledků.
- 520 9_
- $a Aim: To assess the importance of Borrelia burgdorferi sensu lato DNA verification in neuroborreliosis. Material and methods: Seventy-one hospitalized patients with clinically and laboratory-confirmed neuroborreliosis were included. PCR of plasma, urine and CSF was performed in parallel before and after the treatment, and after 3 and 6 months for plasma and urine. DNA was isolated using the QIAamp DNA Mini Kit, PCR was arranged as a two-step amplification (nested PCR). Each sample was examined by the five amplification systems in parallel: two were targeted at plasmide genes encoding OspA and OspC proteins and three at genes for 16S rDNA, flagellin and p66 protein. Results: Of all 71 patients, the specific DNA was found in 51 cases (71.8%) before treatment. After the treatment, the DNA was proven in 25 patients (35.2%). PCR positivity persisted in 19 (26.8%) after three months and still in five (7%) patients after six months. The highest frequency of PCR-positive results was obtained by the 16S rDNA system, slightly lower sensitivity was achieved with the OspA, OspC and flagellin primers and the lowest frequency of positives was in the p66 target. Conclusion: Borrelial DNA was most frequently found in CSF, less frequently in urine and the lowest number of positive results were in plasma. PCR positivity decreased gradually during the observation period, the test was still positive in some patients after six months. It is possible to recommend testing with a minimum of two target sequences to improve diagnostic sensitivity. Our results suggest that the PCR testing should only be used in neuroborreliosis as an supplementary diagnostic method and subject to correct clinical interpretation.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a prospektivní studie $7 D011446
- 650 12
- $a lymská neuroborelióza $x genetika $x krev $x moč $x mok mozkomíšní $7 D020852
- 650 12
- $a Borrelia burgdorferi $x genetika $7 D025065
- 650 12
- $a DNA primery $7 D017931
- 650 _2
- $a senzitivita a specificita $7 D012680
- 650 _2
- $a DNA bakterií $x genetika $x krev $x moč $x mok mozkomíšní $7 D004269
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $x statistika a číselné údaje $7 D016133
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 655 _2
- $a hodnotící studie $7 D023362
- 700 1_
- $a Moravcová, Lenka, $u Klinika infekčních nemocí 2. LF UK a Nemocnice Na Bulovce, Praha $d 1959- $7 xx0110521
- 700 1_
- $a Smíšková, Dita $u Klinika infekčních nemocí 2. LF UK a Nemocnice Na Bulovce, Praha $7 xx0139471
- 773 0_
- $w MED00010979 $t Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie $x 1210-7859 $g Roč. 79, č. 5 (2016), s. 566-571
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/ceska-slovenska-neurologie/2016-5-4/prukaz-boreliove-dna-u-pacientu-s-neuroboreliozou-59129 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 4085 $c 616 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20161007 $b ABA008
- 991 __
- $a 20161017115534 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1168675 $s 953388
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2016 $b 79 $c 5 $d 566-571 $i 1210-7859 $m Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie $x MED00010979 $y 99356
- LZP __
- $c NLK188 $d 20161017 $b NLK111 $a Meditorial-20161007