-
Something wrong with this record ?
Identifikace dermatofytů pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie
[Identification of dermatophytes using MALDI-TOF mass spectrometry]
R. Walková, H. Janouškovcová, M. Šnajdrová, V. Hubka, A. Čmoková, J. Hrabák
Language Czech Country Czech Republic
Grant support
NV17-31269A
MZ0
CEP Register
Digital library NLK
Full text - Article
Source
E-resources NLK Online
Links
plný text volně dostupný
- MeSH
- Arthrodermataceae * MeSH
- Clinical Studies as Topic MeSH
- Humans MeSH
- Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization * methods MeSH
- Trichophyton * MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
Dermatofyty jsou mikroskopické vláknité houby způsobující časté infekce kůže a kožních adnex. Jejich identifikace byla do nedávné doby prováděna pouze podle morfologických charakteristik. Ta je však velmi zdlouhavá a vyžaduje značné zkušenosti. V posledních letech se v identifikaci dermatofytů začíná uplatňovat MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight) hmotnostní spektrometrie (MS). U vláknitých hub je nutné, kvůli jejich komplexní morfologii a požadavkům na kultivaci, použít odlišné postupy zpracování kultury. Tato práce se zabývá srovnáním MALDI-TOF MS v identifikaci dermatofytů v porovnání s metodou sekvenace oblasti ITS (Internal Transcribed Spacer) rDNA a konvenčními metodami. Do studie bylo zahrnuto 81 izolátů dermatofytů získaných z klinických vzorků. Výsledky MALDI-TOF MS analýzy se shodovaly s výsledky molekulárně genetické identifikace u 75 % izolátů. Metodami klasické identifikace se podařilo identifikovat pouze 47 % izolátů. MALDI-TOF MS lze tedy považovat za účinný nástroj rychlé a jednoduché identifikace dermatofytů v rutinní diagnostické laboratoři.
Dermatophytes are microscopic fungi causing skin infections and infections of skin adnexa. Their identification is usually performed by morphological characteristics requiring experienced microbiologists and quiet long turnaround time. In recent years, matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has been introducing to many diagnostic laboratories allowing identification of dermatophytes as well. For that purpose, however, specific procedures comparing with bacteria and yeasts must be used because of their complex morphology and specific cultivation requirements. This study is focused on comparison of MALDI-TOF MS-based identification, identification using DNA sequencing of Internal Transcribed Spacer (ITS) rDNA region and conventional methods. In the study, 81 clinical isolates of dermatophytes were included. MALDI-TOF MS correctly identified 74% of all isolates. Using classical methods, only 47% of isolates were identified. Thus, MALDI-TOF MS provides a useful tool for identification of those fungi in routine microbiological laboratories.
Katedra botaniky Přírodovědecká fakulta Univerzita Karlova Praha
Laboratoř genetiky a metabolismu hub Mikrobiologický ústav Akademie věd České republiky v v i Praha
Identification of dermatophytes using MALDI-TOF mass spectrometry
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc19010227
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20190402111401.0
- 007
- ta
- 008
- 190320s2018 xr f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Walková, Radka $7 xx0234048 $u Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Plzeň; Laboratoř antibiotické rezistence a aplikací hmotnostní spektrometrie v mikrobiologii, Biomedicínské centrum, Lékařská fakulta v Plzni, Univerzita Karlova, Plzeň
- 245 10
- $a Identifikace dermatofytů pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie / $c R. Walková, H. Janouškovcová, M. Šnajdrová, V. Hubka, A. Čmoková, J. Hrabák
- 246 31
- $a Identification of dermatophytes using MALDI-TOF mass spectrometry
- 520 3_
- $a Dermatofyty jsou mikroskopické vláknité houby způsobující časté infekce kůže a kožních adnex. Jejich identifikace byla do nedávné doby prováděna pouze podle morfologických charakteristik. Ta je však velmi zdlouhavá a vyžaduje značné zkušenosti. V posledních letech se v identifikaci dermatofytů začíná uplatňovat MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight) hmotnostní spektrometrie (MS). U vláknitých hub je nutné, kvůli jejich komplexní morfologii a požadavkům na kultivaci, použít odlišné postupy zpracování kultury. Tato práce se zabývá srovnáním MALDI-TOF MS v identifikaci dermatofytů v porovnání s metodou sekvenace oblasti ITS (Internal Transcribed Spacer) rDNA a konvenčními metodami. Do studie bylo zahrnuto 81 izolátů dermatofytů získaných z klinických vzorků. Výsledky MALDI-TOF MS analýzy se shodovaly s výsledky molekulárně genetické identifikace u 75 % izolátů. Metodami klasické identifikace se podařilo identifikovat pouze 47 % izolátů. MALDI-TOF MS lze tedy považovat za účinný nástroj rychlé a jednoduché identifikace dermatofytů v rutinní diagnostické laboratoři.
- 520 9_
- $a Dermatophytes are microscopic fungi causing skin infections and infections of skin adnexa. Their identification is usually performed by morphological characteristics requiring experienced microbiologists and quiet long turnaround time. In recent years, matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has been introducing to many diagnostic laboratories allowing identification of dermatophytes as well. For that purpose, however, specific procedures comparing with bacteria and yeasts must be used because of their complex morphology and specific cultivation requirements. This study is focused on comparison of MALDI-TOF MS-based identification, identification using DNA sequencing of Internal Transcribed Spacer (ITS) rDNA region and conventional methods. In the study, 81 clinical isolates of dermatophytes were included. MALDI-TOF MS correctly identified 74% of all isolates. Using classical methods, only 47% of isolates were identified. Thus, MALDI-TOF MS provides a useful tool for identification of those fungi in routine microbiological laboratories.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 12
- $a spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice $x metody $7 D019032
- 650 12
- $a Arthrodermataceae $7 D003883
- 650 12
- $a Trichophyton $7 D014249
- 650 _2
- $a klinická studie jako téma $7 D000068456
- 700 1_
- $a Janouškovcová, Helena $u Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Plzeň; Laboratoř antibiotické rezistence a aplikací hmotnostní spektrometrie v mikrobiologii, Biomedicínské centrum, Lékařská fakulta v Plzni, Univerzita Karlova, Plzeň $7 xx0224096
- 700 1_
- $a Šnajdrová, Marta $u Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Plzeň $7 xx0106889
- 700 1_
- $a Hubka, Vít, $d 1986- $7 mzk2016904736 $u Katedra botaniky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, Praha; Laboratoř genetiky a metabolismu hub, Mikrobiologický ústav, Akademie věd České republiky, v. v. i., Praha
- 700 1_
- $a Čmoková, Adéla $7 xx0234049 $u Katedra botaniky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, Praha; Laboratoř genetiky a metabolismu hub, Mikrobiologický ústav, Akademie věd České republiky, v. v. i., Praha
- 700 1_
- $a Hrabák, Jaroslav, $u Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Plzeň; Laboratoř antibiotické rezistence a aplikací hmotnostní spektrometrie v mikrobiologii, Biomedicínské centrum, Lékařská fakulta v Plzni, Univerzita Karlova, Plzeň $d 1981- $7 xx0025811
- 773 0_
- $w MED00010989 $t Česko-slovenská dermatologie $x 0009-0514 $g Roč. 93, č. 6 (2018), s. 250-256
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/cesko-slovenska-dermatologie/2018-6-12/identifikace-dermatofytu-pomoci-maldi-tof-hmotnostni-spektrometrie-107985 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 64 $c 115 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20190320 $b ABA008
- 991 __
- $a 20190402111406 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1388151 $s 1048500
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2018 $b 93 $c 6 $d 250-256 $i 0009-0514 $m Československá dermatologie $x MED00010989 $y 107985
- GRA __
- $a NV17-31269A $p MZ0
- LZP __
- $c NLK109 $d 20190402 $b NLK111 $a Meditorial-20190320