-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Vznik a význam sekvenčních variant mikroRNA v kancerogenezi
[Development and significance of microRNA sequence variants in carcinogenesis]
Mgr. Pifková Lucie, Mgr. Veselá Petra, prof. RNDr. Slabý Ondřej, Ph.D.
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu přehledy
- Klíčová slova
- izomiRs, sekvenční varianty,
- MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA MeSH
- nádorové biomarkery * MeSH
- nádory * diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Východiska: MikroRNA (miRNA) jsou jednou ze skupin krátkých nekódujících RNA, které na posttranskripční úrovni regulují genovou expresi. Jsou zapojeny do klíčových buněčných procesů a podílejí se na vzniku a progresi mnohých onemocnění. Hladiny miRNA mohou odrážet fyziologický stav organizmů, a proto jsou v rámci biomarkerových studií analyzovány jejich expresní profily. Díky svým vlastnostem se jeví jako slibné diagnostické, prognostické a prediktivní biomarkery nádorových onemocnění. Nedávné studie poukazují na existenci sekvenčních variant miRNA, tzv. izomiRs, které se od anotovaných miRNA liší pozměněnou sekvencí v důsledku posttranskripčních modifikací. Tyto izomiRs mohou vykazovat vyšší zastoupení než některé kanonické miRNA. Bližší studium izomiRs odhaluje jejich nenáhodnou distribuci i odlišné biologické vlastnosti a poukazuje tak na možný biologický význam modifikací sekvence. Přítomnost izomiRs může také zásadně ovlivňovat výsledky biomarkerových studií. V současné době je pozornost zaměřena na jejich možný klinický význam. Cíl: Cílem této práce je poskytnout přehled současných poznatků o sekvenčních variantách miRNA. V práci jsou popsány mechanizmy vzniku izomiRs a vliv heterogenity v sekvenci na stabilitu, funkci a analýzu miRNA. Prostor je věnován také roli izomiRs v biomarkerových studiích.
Background: MicroRNA (miRNA) are a class of short non-coding RNAs that regulate gene expression at the posttranscriptional level. They are involved in key cellular processes and development as well as progression of many diseases. Their levels reflect the physiological state of organisms; therefore, the expression profiles of these molecules are analyzed in biomarker studies. Due to their properties, miRNA appear to be promising diagnostic, prognostic and predictive biomarkers of cancer. Recent studies indicate the existence of sequence variants in miRNA, so-called isomiRs, which differ from the annotated miRNAs by altered sequences due to posttranscriptional modifications. These isomiRs may have a higher abundance than canonical miRNA. The characterization of isomiRs reveals their regulated distribution and different biological properties and thus suggest the possible biological significance of the modifications. The presence of isomiRs can also significantly affect the results of biomarker studies. Currently, the research is focused on their possible clinical significance. Purpose: The aim of this review is to provide an overview of current knowledge about sequence variants in miRNA. The review summarizes the mechanisms of isomiRs biogenesis and describes the effects of sequence heterogeneity on miRNA stability, function and analysis. Subsequently, the role of isomiRs in biomarker studies is discussed.
Development and significance of microRNA sequence variants in carcinogenesis
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc21005952
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20210331204832.0
- 007
- ta
- 008
- 210301s2021 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.48095/ccko202120 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Pifková, Lucie $u Středoevropský technologický institut, MU Brno $7 xx0257731
- 245 10
- $a Vznik a význam sekvenčních variant mikroRNA v kancerogenezi / $c Mgr. Pifková Lucie, Mgr. Veselá Petra, prof. RNDr. Slabý Ondřej, Ph.D.
- 246 31
- $a Development and significance of microRNA sequence variants in carcinogenesis
- 520 3_
- $a Východiska: MikroRNA (miRNA) jsou jednou ze skupin krátkých nekódujících RNA, které na posttranskripční úrovni regulují genovou expresi. Jsou zapojeny do klíčových buněčných procesů a podílejí se na vzniku a progresi mnohých onemocnění. Hladiny miRNA mohou odrážet fyziologický stav organizmů, a proto jsou v rámci biomarkerových studií analyzovány jejich expresní profily. Díky svým vlastnostem se jeví jako slibné diagnostické, prognostické a prediktivní biomarkery nádorových onemocnění. Nedávné studie poukazují na existenci sekvenčních variant miRNA, tzv. izomiRs, které se od anotovaných miRNA liší pozměněnou sekvencí v důsledku posttranskripčních modifikací. Tyto izomiRs mohou vykazovat vyšší zastoupení než některé kanonické miRNA. Bližší studium izomiRs odhaluje jejich nenáhodnou distribuci i odlišné biologické vlastnosti a poukazuje tak na možný biologický význam modifikací sekvence. Přítomnost izomiRs může také zásadně ovlivňovat výsledky biomarkerových studií. V současné době je pozornost zaměřena na jejich možný klinický význam. Cíl: Cílem této práce je poskytnout přehled současných poznatků o sekvenčních variantách miRNA. V práci jsou popsány mechanizmy vzniku izomiRs a vliv heterogenity v sekvenci na stabilitu, funkci a analýzu miRNA. Prostor je věnován také roli izomiRs v biomarkerových studiích.
- 520 9_
- $a Background: MicroRNA (miRNA) are a class of short non-coding RNAs that regulate gene expression at the posttranscriptional level. They are involved in key cellular processes and development as well as progression of many diseases. Their levels reflect the physiological state of organisms; therefore, the expression profiles of these molecules are analyzed in biomarker studies. Due to their properties, miRNA appear to be promising diagnostic, prognostic and predictive biomarkers of cancer. Recent studies indicate the existence of sequence variants in miRNA, so-called isomiRs, which differ from the annotated miRNAs by altered sequences due to posttranscriptional modifications. These isomiRs may have a higher abundance than canonical miRNA. The characterization of isomiRs reveals their regulated distribution and different biological properties and thus suggest the possible biological significance of the modifications. The presence of isomiRs can also significantly affect the results of biomarker studies. Currently, the research is focused on their possible clinical significance. Purpose: The aim of this review is to provide an overview of current knowledge about sequence variants in miRNA. The review summarizes the mechanisms of isomiRs biogenesis and describes the effects of sequence heterogeneity on miRNA stability, function and analysis. Subsequently, the role of isomiRs in biomarker studies is discussed.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 12
- $a nádory $x diagnóza $7 D009369
- 650 12
- $a nádorové biomarkery $7 D014408
- 650 _2
- $a mikro RNA $7 D035683
- 653 00
- $a izomiRs
- 653 00
- $a sekvenční varianty
- 655 _2
- $a přehledy $7 D016454
- 700 1_
- $a Veselá, Petra $u Středoevropský technologický institut, MU Brno $7 xx0257734
- 700 1_
- $a Slabý, Ondřej, $u Středoevropský technologický institut, MU Brno; MOÚ Brno $d 1981- $7 js20030220015
- 773 0_
- $w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 34, č. 1 (2021), s. 20-25
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2021-1-1/vznik-a-vyznam-sekvencnich-variant-mikrorna-v-kancerogenezi-125888 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20210301 $b ABA008
- 991 __
- $a 20210331204828 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1627923 $s 1126284
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2021 $b 34 $c 1 $d 20-25 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 125888
- LZP __
- $c NLK109 $d 20210331 $b NLK111 $a Meditorial-20210301
