Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

First evaluation of completeness and sensitivity of the measles surveillance system in the Czech Republic, January 1, 2018 until June 30, 2019 [První zhodnocení úplnosti dat a senzitivity systému surveillance u spalniček v České republice, 1. leden 2018 až 30. červen 2019]

M. Liptáková, M. Špačková, V. Príkazský, R. Limberková, S. Repelová, H. Orlíková, S. Balasegaram, J. Částková

. 2022 ; 71 (2) : 109-117.

Jazyk angličtina Země Česko

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc22020605

Cíle: Cílem studie bylo vyhodnotit úplnost dat a odhadnout senzitivitu surveillance spalniček v rámci hlášení do nové elektronické verze národního Informačního systému infekční nemoci (ISIN) za účelem posouzení fungování tohoto systému. Metody: Byla hodnocena úplnost hlášení spalniček v ISIN pro demografické charakteristiky (týden a kraj hlášení, věk a pohlaví), datum prvních příznaků, komplikace, hospitalizace, stav očkování, použité laboratorní metody a země importu od ledna 2018 do června 2019. Pomocí metody dvojího záchytu „capture-recapture method“ (CRM) porovnáním registrů Národní referenční laboratoře (NRL) a ISIN byl vyhodnocen počet případů spalniček. Případy byly spárovány pomocí jedinečného osobního identifikátoru (rodné číslo). Celkový odhadovaný skutečný počet případů spalniček v populaci byl vypočten pomocí Chapmanova vzorce. Senzitivita hlášení byla kalkulována podílem počtu hlášených případů odhadovaným skutečným počtem případů pomocí CRM. Výsledky: V ISIN bylo ve stanoveném časovém období nahlášeno 765 případů spalniček. U mnoha proměnných byla nalezena 100% úplnost. Data chyběla hlavně u statusu očkování (20 %), sérologických výsledků (55 %) a použitých laboratorních metod (8 %). NRL vyšetřila v uvedeném období 653 vzorků pacientů. V obou registrech (ISIN a NRL) bylo zachyceno celkem 612 shodných případů. Odhadovaný skutečný počet případů spalniček v populaci pomocí CRM byl 816 (95% CI: 809–823) ve srovnání se skutečně hlášenými 806 případy při spárování dat obou systémů. Odhadovaná senzitivita surveillance systému je 98,8 %. Pět procent (n = 41) případů pozitivně testovaných v NRL nebylo v ISIN hlášeno. Závěr: U většiny proměnných jsme zjistili vysokou úroveň úplnosti údajů o případech onemocnění spalničkami hlášených v ISIN. Odhadovaný skutečný a reálně hlášený počet případů dobře koreloval a vypočtená senzitivita systému ISIN byla na velmi vysoké úrovni. Zdroje dat použité ve studii nebyly navzájem dostatečně nezávislé, a proto výsledky nemusí být zcela přesné. Do budoucna je vhodné provést určité technické změny v ISIN, zejména nastavit více povinných polí v rámci jednotlivých proměnných a více logických syntaxí v automatickém nastavení systému, pro dosažení vyšší úplnosti, kontroly kvality a validity vkládaných dat. Poskytovatelé údajů by měli do ISIN hlásit všechny případy spalniček s maximální precizností při zadávání jednotlivých proměnných, a vyšetřující laboratoře zasílat vzorky ke konfirmaci do NRL v požadovaných případech.

Aim: The aim of study was to evaluate completeness and estimate sensitivity of the measles surveillance using the new electronic version of the national notification system of infectious diseases (ISIN) in order to assess its performance. Material and Methods: The completeness of measles reporting in the ISIN for demographic characteristics (week and region of reporting, age and gender), date of onset, complications, hospitalisations, vaccination status, used laboratory methods and country of import from January 2018 to June 2019 was assessed. The register from National Reference Laboratory (NRL) and the ISIN were compared using the capture-recapture method (CRM). Cases were matched using unique personal identifier. The total number of measles cases in the population was assessed using the Chapman’s formula. Sensitivity of reporting was calculated by dividing the number of reported cases by the CRM estimated true number of cases. Results: In the ISIN, 765 measles cases were registered within specified time period. For many variables 100% completeness was found. The data were missing mainly for vaccination status (20%), serology results (55%) and used laboratory methods (8%). The NRL confirmed 653 patient samples in respected period. Within both registries (ISIN and NRL) the total 612 cases were matched. Estimated real number of measles cases using the CRM was 816 (95% CI: 809-823) compared to 806 reported cases. The estimated surveillance system sensitivity was 98.8%. Five percent (n = 41) of cases tested positively in the NRL were not reported to the ISIN. Conclusions: We found high level of reported measles data completeness in the ISIN for most variables. Estimated real and reported number of cases was in a good correlation and calculated sensitivity of the ISIN was on very high level. Though, the data sources used in the study were not independent on each other, therefore results may not be fully accurate. The technical changes (more mandatory fields and more logical syntax to check data) in the ISIN to improve data completeness are being recommended. Data providers should report all measles cases to the ISIN with maximum precision in entering individual variables and investigating laboratories should send samples for confirmation to the NRL in required cases.

První zhodnocení úplnosti dat a senzitivity systému surveillance u spalniček v České republice, 1. leden 2018 až 30. červen 2019

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc22020605
003      
CZ-PrNML
005      
20220901142544.0
007      
ta
008      
220815s2022 xr d f 000 0|eng||
009      
AR
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng $b cze
044    __
$a xr
100    1_
$a Liptáková, Monika $u European Programme for Intervention Epidemiology Training, European Centre for Disease Prevention and Control, Stockholm, Sweden $u National Institute of Public Health, Prague $7 xx0259765
245    10
$a First evaluation of completeness and sensitivity of the measles surveillance system in the Czech Republic, January 1, 2018 until June 30, 2019 / $c M. Liptáková, M. Špačková, V. Príkazský, R. Limberková, S. Repelová, H. Orlíková, S. Balasegaram, J. Částková
246    31
$a První zhodnocení úplnosti dat a senzitivity systému surveillance u spalniček v České republice, 1. leden 2018 až 30. červen 2019
520    3_
$a Cíle: Cílem studie bylo vyhodnotit úplnost dat a odhadnout senzitivitu surveillance spalniček v rámci hlášení do nové elektronické verze národního Informačního systému infekční nemoci (ISIN) za účelem posouzení fungování tohoto systému. Metody: Byla hodnocena úplnost hlášení spalniček v ISIN pro demografické charakteristiky (týden a kraj hlášení, věk a pohlaví), datum prvních příznaků, komplikace, hospitalizace, stav očkování, použité laboratorní metody a země importu od ledna 2018 do června 2019. Pomocí metody dvojího záchytu „capture-recapture method“ (CRM) porovnáním registrů Národní referenční laboratoře (NRL) a ISIN byl vyhodnocen počet případů spalniček. Případy byly spárovány pomocí jedinečného osobního identifikátoru (rodné číslo). Celkový odhadovaný skutečný počet případů spalniček v populaci byl vypočten pomocí Chapmanova vzorce. Senzitivita hlášení byla kalkulována podílem počtu hlášených případů odhadovaným skutečným počtem případů pomocí CRM. Výsledky: V ISIN bylo ve stanoveném časovém období nahlášeno 765 případů spalniček. U mnoha proměnných byla nalezena 100% úplnost. Data chyběla hlavně u statusu očkování (20 %), sérologických výsledků (55 %) a použitých laboratorních metod (8 %). NRL vyšetřila v uvedeném období 653 vzorků pacientů. V obou registrech (ISIN a NRL) bylo zachyceno celkem 612 shodných případů. Odhadovaný skutečný počet případů spalniček v populaci pomocí CRM byl 816 (95% CI: 809–823) ve srovnání se skutečně hlášenými 806 případy při spárování dat obou systémů. Odhadovaná senzitivita surveillance systému je 98,8 %. Pět procent (n = 41) případů pozitivně testovaných v NRL nebylo v ISIN hlášeno. Závěr: U většiny proměnných jsme zjistili vysokou úroveň úplnosti údajů o případech onemocnění spalničkami hlášených v ISIN. Odhadovaný skutečný a reálně hlášený počet případů dobře koreloval a vypočtená senzitivita systému ISIN byla na velmi vysoké úrovni. Zdroje dat použité ve studii nebyly navzájem dostatečně nezávislé, a proto výsledky nemusí být zcela přesné. Do budoucna je vhodné provést určité technické změny v ISIN, zejména nastavit více povinných polí v rámci jednotlivých proměnných a více logických syntaxí v automatickém nastavení systému, pro dosažení vyšší úplnosti, kontroly kvality a validity vkládaných dat. Poskytovatelé údajů by měli do ISIN hlásit všechny případy spalniček s maximální precizností při zadávání jednotlivých proměnných, a vyšetřující laboratoře zasílat vzorky ke konfirmaci do NRL v požadovaných případech.
520    9_
$a Aim: The aim of study was to evaluate completeness and estimate sensitivity of the measles surveillance using the new electronic version of the national notification system of infectious diseases (ISIN) in order to assess its performance. Material and Methods: The completeness of measles reporting in the ISIN for demographic characteristics (week and region of reporting, age and gender), date of onset, complications, hospitalisations, vaccination status, used laboratory methods and country of import from January 2018 to June 2019 was assessed. The register from National Reference Laboratory (NRL) and the ISIN were compared using the capture-recapture method (CRM). Cases were matched using unique personal identifier. The total number of measles cases in the population was assessed using the Chapman’s formula. Sensitivity of reporting was calculated by dividing the number of reported cases by the CRM estimated true number of cases. Results: In the ISIN, 765 measles cases were registered within specified time period. For many variables 100% completeness was found. The data were missing mainly for vaccination status (20%), serology results (55%) and used laboratory methods (8%). The NRL confirmed 653 patient samples in respected period. Within both registries (ISIN and NRL) the total 612 cases were matched. Estimated real number of measles cases using the CRM was 816 (95% CI: 809-823) compared to 806 reported cases. The estimated surveillance system sensitivity was 98.8%. Five percent (n = 41) of cases tested positively in the NRL were not reported to the ISIN. Conclusions: We found high level of reported measles data completeness in the ISIN for most variables. Estimated real and reported number of cases was in a good correlation and calculated sensitivity of the ISIN was on very high level. Though, the data sources used in the study were not independent on each other, therefore results may not be fully accurate. The technical changes (more mandatory fields and more logical syntax to check data) in the ISIN to improve data completeness are being recommended. Data providers should report all measles cases to the ISIN with maximum precision in entering individual variables and investigating laboratories should send samples for confirmation to the NRL in required cases.
650    07
$a hlášení nemocí $7 D018563 $2 czmesh
650    17
$a spalničky $x epidemiologie $7 D008457 $2 czmesh
650    07
$a surveillance populace $x metody $7 D011159 $2 czmesh
650    _7
$a lidé $7 D006801 $2 czmesh
651    _7
$a Česká republika $7 D018153 $2 czmesh
700    1_
$a Špačková, Michaela $u National Institute of Public Health, Prague $7 xx0232062
700    1_
$a Príkazský, Vladimír $u National Institute of Public Health, Prague $7 xx0099891
700    1_
$a Limberková, Radomíra $u National Institute of Public Health, Prague $7 xx0074293
700    1_
$a Repelová, Simona $u National Institute of Public Health, Prague $7 xx0273135
700    1_
$a Orlíková, Hana, $u National Institute of Public Health, Prague $d 1965- $7 xx0218806
700    1_
$a Balasegaram, S. $u UK Health Security Agency, London, United Kingdom
700    1_
$a Částková, Jitka $u National Institute of Public Health, Prague $7 xx0048672
773    0_
$w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 71, č. 2 (2022), s. 109-117
856    41
$u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2022-2-24/prvni-zhodnoceni-uplnosti-dat-a-senzitivity-systemu-surveillance-u-spalnicek-v-ceske-republice-1-leden-2018-az-30-cerven-2019-131399 $y plný text volně dostupný
910    __
$a ABA008 $b A 981 $c 560 $y p $z 0
990    __
$a 20220815 $b ABA008
991    __
$a 20220901142536 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1829478 $s 1171858
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2022 $b 71 $c 2 $d 109-117 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 131399
LZP    __
$c NLK109 $d 20220901 $b NLK111 $a Meditorial-20220815

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat ...

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...