-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Charakterizace Neisseria meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění v České republice v letech 2018-2024 metodou sekvenace celého genomu (WGS) – analýza vlivu pandemie covid-19
[Whole genome sequencing (WGS) characterisation of Neisseria meningitidis from invasive meningococcal disease in the Czech Republic in 2018–2024 – analysis of the impact of the COVID-19 pandemic]
Z. Okonji, M. Honskus, M. Musílek, P. Křížová
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- MeSH
- COVID-19 epidemiologie MeSH
- lidé MeSH
- meningokokové infekce epidemiologie MeSH
- Neisseria meningitidis * genetika MeSH
- pandemie MeSH
- sekvenční analýza * MeSH
- vakcinace statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Cíl: Cílem studie byla analýza vlivu pandemie covidu-19 na epidemiologickou situaci invazivního meningokokového onemocnění (IMO) a na molekulární charakteristiky izolátů Neisseria meningitidis způsobujících IMO v České republice. Materiál a metody: Studie vycházela z dat surveillance IMO za období 2018–2024 (k 27. 5. 2024) a analyzovány celogenomovou sekvenací (WGS) byly všechny dostupné izoláty N. meningitidis z IMO z těchto let. Pro analýzu vlivu pandemie covidu-19 bylo sledované období rozděleno na tři srovnávané etapy: pre-covidové období (2018–2019), období pandemie covidu-19 (2020–2022) a post-covidové období (2023–2024). Výsledky: V důsledku zavedení epidemiologických opatření proti pandemii covidu-19 došlo v České republice, podobně jako v ostatních zemích, k poklesu počtu infekčních onemocnění přenášených vzdušnou cestou, včetně IMO. Po uvolnění těchto epidemiologických opatření však nedošlo v České republice k opětnému vzestupu počtu IMO, na rozdíl od řady jiných zemí. Charakterizace izolátů z IMO metodou WGS prokázala, že v průběhu covidového a post-covidového období došlo k postupné změně populace meningokoků, které v České republice působí IMO. U izolátů N. meningitidis séroskupin C, W a Y lze sledovat postupný a výrazný pokles celkové heterogenity – z deseti různých klonálních komplexů zachycených v pre-covidovém období na pouhé tři v post-covidových letech (cc11, cc23 a cc103). Zároveň byla zjištěna významná redukce izolátů N. meningitidis C; cc11. U izolátů N. meningitidis B lze naopak pozorovat nárůst celkové heterogenity během období pandemie covidu-19 a její opětovnou redukci na celkově nejnižší hodnoty v post-covidovém období. Závěr: V přetrvávajícím poklesu počtu IMO v České republice má roli i zavedení úhrady očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y pro malé děti (v květnu 2020) a pro adolescenty (v lednu 2022). K udržení nízkých počtů IMO v České republice je žádoucí pokračovat v očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y dle doporučení České vakcinologické společnosti ČLS JEP.
Objective: To analyse the impact of the COVID-19 pandemic on the epidemiological situation of invasive meningococcal disease (IMD) and molecular characteristics of Neisseria meningitidis isolates causing IMD in the Czech Republic. Material and Methods: The study was based on IMD surveillance data for 2018–2024 (as of 27 May 2024), and all available N. meningitidis isolates from IMD of these years were subjected to whole genome sequencing (WGS). To analyse the impact of the COVID-19 pandemic, the study period was divided into three parts: the pre-COVID period (2018–2019), the COVID-19 pandemic period (2020–2022), and the post-COVID period (2023–2024). Results: As a result of the implementation of the COVID-19 control measures, similar to other countries, there has been a decline in the incidence of air-borne infections including IMD in the Czech Republic. However, unlike many other countries, there has not been a resurgence of IMD in the Czech Republic following the release of these epidemiological measures. WGS characterisation of IMD isolates showed a gradual change in the population of meningococci causing IMD in the Czech Republic during the COVID-19 and post-COVID periods. For N. meningitidis isolates of serogroups C, W, and Y, a gradual and significant decline in overall heterogeneity can be observed – from ten different clonal complexes detected in the pre-COVID period to only three in the post-COVID years (cc11, cc23, and cc103). At the same time, a significant reduction was observed in N. meningitidis C isolates; cc11. In contrast, an increase in overall heterogeneity can be observed for N. meningitidis B isolates during the COVID-19 pandemic period, followed by its decline again to overall lowest values in the post-COVID period. Conclusion: The fact that MenB vaccine and conjugate vaccine A, C, W, Y started to be covered by health insurance for young children (in May 2020) and adolescents (in January 2022) also appears to play a role in the persistent decline of IMD in the Czech Republic. In order to maintain the low incidence of IMD in the Czech Republic, it is desirable to continue vaccination with MenB vaccine and conjugated vaccine A, C, W, Y in accordance with the recommendations of the Czech Society of Vaccinology of the Czech Medical Association of Jan Evangelista Purkyně.
Whole genome sequencing (WGS) characterisation of Neisseria meningitidis from invasive meningococcal disease in the Czech Republic in 2018–2024 – analysis of the impact of the COVID-19 pandemic
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc25010836
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20250528152242.0
- 007
- ta
- 008
- 250424s2025 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.61568/emi/11-6445/20250128/139684 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Okonji, Zuzana $7 xx0230941 $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha
- 245 10
- $a Charakterizace Neisseria meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění v České republice v letech 2018-2024 metodou sekvenace celého genomu (WGS) – analýza vlivu pandemie covid-19 / $c Z. Okonji, M. Honskus, M. Musílek, P. Křížová
- 246 31
- $a Whole genome sequencing (WGS) characterisation of Neisseria meningitidis from invasive meningococcal disease in the Czech Republic in 2018–2024 – analysis of the impact of the COVID-19 pandemic
- 520 3_
- $a Cíl: Cílem studie byla analýza vlivu pandemie covidu-19 na epidemiologickou situaci invazivního meningokokového onemocnění (IMO) a na molekulární charakteristiky izolátů Neisseria meningitidis způsobujících IMO v České republice. Materiál a metody: Studie vycházela z dat surveillance IMO za období 2018–2024 (k 27. 5. 2024) a analyzovány celogenomovou sekvenací (WGS) byly všechny dostupné izoláty N. meningitidis z IMO z těchto let. Pro analýzu vlivu pandemie covidu-19 bylo sledované období rozděleno na tři srovnávané etapy: pre-covidové období (2018–2019), období pandemie covidu-19 (2020–2022) a post-covidové období (2023–2024). Výsledky: V důsledku zavedení epidemiologických opatření proti pandemii covidu-19 došlo v České republice, podobně jako v ostatních zemích, k poklesu počtu infekčních onemocnění přenášených vzdušnou cestou, včetně IMO. Po uvolnění těchto epidemiologických opatření však nedošlo v České republice k opětnému vzestupu počtu IMO, na rozdíl od řady jiných zemí. Charakterizace izolátů z IMO metodou WGS prokázala, že v průběhu covidového a post-covidového období došlo k postupné změně populace meningokoků, které v České republice působí IMO. U izolátů N. meningitidis séroskupin C, W a Y lze sledovat postupný a výrazný pokles celkové heterogenity – z deseti různých klonálních komplexů zachycených v pre-covidovém období na pouhé tři v post-covidových letech (cc11, cc23 a cc103). Zároveň byla zjištěna významná redukce izolátů N. meningitidis C; cc11. U izolátů N. meningitidis B lze naopak pozorovat nárůst celkové heterogenity během období pandemie covidu-19 a její opětovnou redukci na celkově nejnižší hodnoty v post-covidovém období. Závěr: V přetrvávajícím poklesu počtu IMO v České republice má roli i zavedení úhrady očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y pro malé děti (v květnu 2020) a pro adolescenty (v lednu 2022). K udržení nízkých počtů IMO v České republice je žádoucí pokračovat v očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y dle doporučení České vakcinologické společnosti ČLS JEP.
- 520 9_
- $a Objective: To analyse the impact of the COVID-19 pandemic on the epidemiological situation of invasive meningococcal disease (IMD) and molecular characteristics of Neisseria meningitidis isolates causing IMD in the Czech Republic. Material and Methods: The study was based on IMD surveillance data for 2018–2024 (as of 27 May 2024), and all available N. meningitidis isolates from IMD of these years were subjected to whole genome sequencing (WGS). To analyse the impact of the COVID-19 pandemic, the study period was divided into three parts: the pre-COVID period (2018–2019), the COVID-19 pandemic period (2020–2022), and the post-COVID period (2023–2024). Results: As a result of the implementation of the COVID-19 control measures, similar to other countries, there has been a decline in the incidence of air-borne infections including IMD in the Czech Republic. However, unlike many other countries, there has not been a resurgence of IMD in the Czech Republic following the release of these epidemiological measures. WGS characterisation of IMD isolates showed a gradual change in the population of meningococci causing IMD in the Czech Republic during the COVID-19 and post-COVID periods. For N. meningitidis isolates of serogroups C, W, and Y, a gradual and significant decline in overall heterogeneity can be observed – from ten different clonal complexes detected in the pre-COVID period to only three in the post-COVID years (cc11, cc23, and cc103). At the same time, a significant reduction was observed in N. meningitidis C isolates; cc11. In contrast, an increase in overall heterogeneity can be observed for N. meningitidis B isolates during the COVID-19 pandemic period, followed by its decline again to overall lowest values in the post-COVID period. Conclusion: The fact that MenB vaccine and conjugate vaccine A, C, W, Y started to be covered by health insurance for young children (in May 2020) and adolescents (in January 2022) also appears to play a role in the persistent decline of IMD in the Czech Republic. In order to maintain the low incidence of IMD in the Czech Republic, it is desirable to continue vaccination with MenB vaccine and conjugated vaccine A, C, W, Y in accordance with the recommendations of the Czech Society of Vaccinology of the Czech Medical Association of Jan Evangelista Purkyně.
- 650 07
- $a lidé $7 D006801 $2 czmesh
- 650 17
- $a Neisseria meningitidis $x genetika $7 D009345 $2 czmesh
- 650 07
- $a meningokokové infekce $x epidemiologie $7 D008589 $2 czmesh
- 650 17
- $a sekvenční analýza $7 D017421 $2 czmesh
- 650 07
- $a COVID-19 $x epidemiologie $7 D000086382 $2 czmesh
- 650 07
- $a pandemie $7 D058873 $2 czmesh
- 650 07
- $a vakcinace $x statistika a číselné údaje $7 D014611 $2 czmesh
- 651 _7
- $a Česká republika $7 D018153 $2 czmesh
- 655 07
- $a práce podpořená grantem $7 D013485 $2 czmesh
- 700 1_
- $a Honskus, Michal $7 xx0253626 $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha
- 700 1_
- $a Musílek, Martin $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha $7 xx0060586
- 700 1_
- $a Křížová, Pavla $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha $7 xx0048673
- 773 0_
- $w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 74, č. 1 (2025), s. 20-30
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2025-1-1/charakterizace-neisseria-meningitidis-z-invazivniho-meningokokoveho-onemocneni-v-ceske-republice-v-letech-2018-2024-metodou-sekvenace-celeho-genomu-wgs-analyza-vlivu-pandemie-covid-19-139684 $y Meditorial
- 910 __
- $a ABA008 $b A 981 $c 560 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20250422 $b ABA008
- 991 __
- $a 20250528152241 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 2324058 $s 1247917
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2025 $b 74 $c 1 $d 20-30 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 139684
- LZP __
- $c NLK192 $d 20250525 $b NLK111 $a Meditorial-20250422