Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Charakterizace Neisseria meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění v České republice v letech 2018-2024 metodou sekvenace celého genomu (WGS) – analýza vlivu pandemie covid-19
[Whole genome sequencing (WGS) characterisation of Neisseria meningitidis from invasive meningococcal disease in the Czech Republic in 2018–2024 – analysis of the impact of the COVID-19 pandemic]

Z. Okonji, M. Honskus, M. Musílek, P. Křížová

. 2025 ; 74 (1) : 20-30.

Jazyk čeština Země Česko

Typ dokumentu práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc25010836

Cíl: Cílem studie byla analýza vlivu pandemie covidu-19 na epidemiologickou situaci invazivního meningokokového onemocnění (IMO) a na molekulární charakteristiky izolátů Neisseria meningitidis způsobujících IMO v České republice. Materiál a metody: Studie vycházela z dat surveillance IMO za období 2018–2024 (k 27. 5. 2024) a analyzovány celogenomovou sekvenací (WGS) byly všechny dostupné izoláty N. meningitidis z IMO z těchto let. Pro analýzu vlivu pandemie covidu-19 bylo sledované období rozděleno na tři srovnávané etapy: pre-covidové období (2018–2019), období pandemie covidu-19 (2020–2022) a post-covidové období (2023–2024). Výsledky: V důsledku zavedení epidemiologických opatření proti pandemii covidu-19 došlo v České republice, podobně jako v ostatních zemích, k poklesu počtu infekčních onemocnění přenášených vzdušnou cestou, včetně IMO. Po uvolnění těchto epidemiologických opatření však nedošlo v České republice k opětnému vzestupu počtu IMO, na rozdíl od řady jiných zemí. Charakterizace izolátů z IMO metodou WGS prokázala, že v průběhu covidového a post-covidového období došlo k postupné změně populace meningokoků, které v České republice působí IMO. U izolátů N. meningitidis séroskupin C, W a Y lze sledovat postupný a výrazný pokles celkové heterogenity – z deseti různých klonálních komplexů zachycených v pre-covidovém období na pouhé tři v post-covidových letech (cc11, cc23 a cc103). Zároveň byla zjištěna významná redukce izolátů N. meningitidis C; cc11. U izolátů N. meningitidis B lze naopak pozorovat nárůst celkové heterogenity během období pandemie covidu-19 a její opětovnou redukci na celkově nejnižší hodnoty v post-covidovém období. Závěr: V přetrvávajícím poklesu počtu IMO v České republice má roli i zavedení úhrady očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y pro malé děti (v květnu 2020) a pro adolescenty (v lednu 2022). K udržení nízkých počtů IMO v České republice je žádoucí pokračovat v očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y dle doporučení České vakcinologické společnosti ČLS JEP.

Objective: To analyse the impact of the COVID-19 pandemic on the epidemiological situation of invasive meningococcal disease (IMD) and molecular characteristics of Neisseria meningitidis isolates causing IMD in the Czech Republic. Material and Methods: The study was based on IMD surveillance data for 2018–2024 (as of 27 May 2024), and all available N. meningitidis isolates from IMD of these years were subjected to whole genome sequencing (WGS). To analyse the impact of the COVID-19 pandemic, the study period was divided into three parts: the pre-COVID period (2018–2019), the COVID-19 pandemic period (2020–2022), and the post-COVID period (2023–2024). Results: As a result of the implementation of the COVID-19 control measures, similar to other countries, there has been a decline in the incidence of air-borne infections including IMD in the Czech Republic. However, unlike many other countries, there has not been a resurgence of IMD in the Czech Republic following the release of these epidemiological measures. WGS characterisation of IMD isolates showed a gradual change in the population of meningococci causing IMD in the Czech Republic during the COVID-19 and post-COVID periods. For N. meningitidis isolates of serogroups C, W, and Y, a gradual and significant decline in overall heterogeneity can be observed – from ten different clonal complexes detected in the pre-COVID period to only three in the post-COVID years (cc11, cc23, and cc103). At the same time, a significant reduction was observed in N. meningitidis C isolates; cc11. In contrast, an increase in overall heterogeneity can be observed for N. meningitidis B isolates during the COVID-19 pandemic period, followed by its decline again to overall lowest values in the post-COVID period. Conclusion: The fact that MenB vaccine and conjugate vaccine A, C, W, Y started to be covered by health insurance for young children (in May 2020) and adolescents (in January 2022) also appears to play a role in the persistent decline of IMD in the Czech Republic. In order to maintain the low incidence of IMD in the Czech Republic, it is desirable to continue vaccination with MenB vaccine and conjugated vaccine A, C, W, Y in accordance with the recommendations of the Czech Society of Vaccinology of the Czech Medical Association of Jan Evangelista Purkyně.

Whole genome sequencing (WGS) characterisation of Neisseria meningitidis from invasive meningococcal disease in the Czech Republic in 2018–2024 – analysis of the impact of the COVID-19 pandemic

Citace poskytuje Crossref.org

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc25010836
003      
CZ-PrNML
005      
20250528152242.0
007      
ta
008      
250424s2025 xr d f 000 0|cze||
009      
AR
024    7_
$a 10.61568/emi/11-6445/20250128/139684 $2 doi
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a cze $b eng
044    __
$a xr
100    1_
$a Okonji, Zuzana $7 xx0230941 $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha
245    10
$a Charakterizace Neisseria meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění v České republice v letech 2018-2024 metodou sekvenace celého genomu (WGS) – analýza vlivu pandemie covid-19 / $c Z. Okonji, M. Honskus, M. Musílek, P. Křížová
246    31
$a Whole genome sequencing (WGS) characterisation of Neisseria meningitidis from invasive meningococcal disease in the Czech Republic in 2018–2024 – analysis of the impact of the COVID-19 pandemic
520    3_
$a Cíl: Cílem studie byla analýza vlivu pandemie covidu-19 na epidemiologickou situaci invazivního meningokokového onemocnění (IMO) a na molekulární charakteristiky izolátů Neisseria meningitidis způsobujících IMO v České republice. Materiál a metody: Studie vycházela z dat surveillance IMO za období 2018–2024 (k 27. 5. 2024) a analyzovány celogenomovou sekvenací (WGS) byly všechny dostupné izoláty N. meningitidis z IMO z těchto let. Pro analýzu vlivu pandemie covidu-19 bylo sledované období rozděleno na tři srovnávané etapy: pre-covidové období (2018–2019), období pandemie covidu-19 (2020–2022) a post-covidové období (2023–2024). Výsledky: V důsledku zavedení epidemiologických opatření proti pandemii covidu-19 došlo v České republice, podobně jako v ostatních zemích, k poklesu počtu infekčních onemocnění přenášených vzdušnou cestou, včetně IMO. Po uvolnění těchto epidemiologických opatření však nedošlo v České republice k opětnému vzestupu počtu IMO, na rozdíl od řady jiných zemí. Charakterizace izolátů z IMO metodou WGS prokázala, že v průběhu covidového a post-covidového období došlo k postupné změně populace meningokoků, které v České republice působí IMO. U izolátů N. meningitidis séroskupin C, W a Y lze sledovat postupný a výrazný pokles celkové heterogenity – z deseti různých klonálních komplexů zachycených v pre-covidovém období na pouhé tři v post-covidových letech (cc11, cc23 a cc103). Zároveň byla zjištěna významná redukce izolátů N. meningitidis C; cc11. U izolátů N. meningitidis B lze naopak pozorovat nárůst celkové heterogenity během období pandemie covidu-19 a její opětovnou redukci na celkově nejnižší hodnoty v post-covidovém období. Závěr: V přetrvávajícím poklesu počtu IMO v České republice má roli i zavedení úhrady očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y pro malé děti (v květnu 2020) a pro adolescenty (v lednu 2022). K udržení nízkých počtů IMO v České republice je žádoucí pokračovat v očkování MenB vakcínou a konjugovanou vakcínou A, C, W, Y dle doporučení České vakcinologické společnosti ČLS JEP.
520    9_
$a Objective: To analyse the impact of the COVID-19 pandemic on the epidemiological situation of invasive meningococcal disease (IMD) and molecular characteristics of Neisseria meningitidis isolates causing IMD in the Czech Republic. Material and Methods: The study was based on IMD surveillance data for 2018–2024 (as of 27 May 2024), and all available N. meningitidis isolates from IMD of these years were subjected to whole genome sequencing (WGS). To analyse the impact of the COVID-19 pandemic, the study period was divided into three parts: the pre-COVID period (2018–2019), the COVID-19 pandemic period (2020–2022), and the post-COVID period (2023–2024). Results: As a result of the implementation of the COVID-19 control measures, similar to other countries, there has been a decline in the incidence of air-borne infections including IMD in the Czech Republic. However, unlike many other countries, there has not been a resurgence of IMD in the Czech Republic following the release of these epidemiological measures. WGS characterisation of IMD isolates showed a gradual change in the population of meningococci causing IMD in the Czech Republic during the COVID-19 and post-COVID periods. For N. meningitidis isolates of serogroups C, W, and Y, a gradual and significant decline in overall heterogeneity can be observed – from ten different clonal complexes detected in the pre-COVID period to only three in the post-COVID years (cc11, cc23, and cc103). At the same time, a significant reduction was observed in N. meningitidis C isolates; cc11. In contrast, an increase in overall heterogeneity can be observed for N. meningitidis B isolates during the COVID-19 pandemic period, followed by its decline again to overall lowest values in the post-COVID period. Conclusion: The fact that MenB vaccine and conjugate vaccine A, C, W, Y started to be covered by health insurance for young children (in May 2020) and adolescents (in January 2022) also appears to play a role in the persistent decline of IMD in the Czech Republic. In order to maintain the low incidence of IMD in the Czech Republic, it is desirable to continue vaccination with MenB vaccine and conjugated vaccine A, C, W, Y in accordance with the recommendations of the Czech Society of Vaccinology of the Czech Medical Association of Jan Evangelista Purkyně.
650    07
$a lidé $7 D006801 $2 czmesh
650    17
$a Neisseria meningitidis $x genetika $7 D009345 $2 czmesh
650    07
$a meningokokové infekce $x epidemiologie $7 D008589 $2 czmesh
650    17
$a sekvenční analýza $7 D017421 $2 czmesh
650    07
$a COVID-19 $x epidemiologie $7 D000086382 $2 czmesh
650    07
$a pandemie $7 D058873 $2 czmesh
650    07
$a vakcinace $x statistika a číselné údaje $7 D014611 $2 czmesh
651    _7
$a Česká republika $7 D018153 $2 czmesh
655    07
$a práce podpořená grantem $7 D013485 $2 czmesh
700    1_
$a Honskus, Michal $7 xx0253626 $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha
700    1_
$a Musílek, Martin $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha $7 xx0060586
700    1_
$a Křížová, Pavla $u Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy, Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha 2 3. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha $7 xx0048673
773    0_
$w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 74, č. 1 (2025), s. 20-30
856    41
$u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2025-1-1/charakterizace-neisseria-meningitidis-z-invazivniho-meningokokoveho-onemocneni-v-ceske-republice-v-letech-2018-2024-metodou-sekvenace-celeho-genomu-wgs-analyza-vlivu-pandemie-covid-19-139684 $y Meditorial
910    __
$a ABA008 $b A 981 $c 560 $y p $z 0
990    __
$a 20250422 $b ABA008
991    __
$a 20250528152241 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 2324058 $s 1247917
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2025 $b 74 $c 1 $d 20-30 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 139684
LZP    __
$c NLK192 $d 20250525 $b NLK111 $a Meditorial-20250422

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat ...

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...