A combined AFLP-multiplex PCR assay for molecular typing of Escherichia coli strains using variable bacterial interspersed mosaic elements
Jazyk angličtina Země Anglie, Velká Británie Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem, validační studie
PubMed
14979591
PubMed Central
PMC2870079
DOI
10.1017/s095026880300133x
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- časové faktory MeSH
- DNA bakterií analýza genetika MeSH
- DNA fingerprinting MeSH
- elektroforéza v agarovém gelu metody normy MeSH
- Escherichia coli klasifikace genetika MeSH
- frekvence genu genetika MeSH
- genetická variace genetika MeSH
- genotyp MeSH
- infekce vyvolané Escherichia coli epidemiologie mikrobiologie MeSH
- intergenová DNA genetika MeSH
- lidé MeSH
- molekulární epidemiologie metody MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody normy MeSH
- polymorfismus délky restrikčních fragmentů * MeSH
- rozptýlené repetitivní sekvence genetika MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody MeSH
- skot MeSH
- techniky typizace bakterií metody normy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- skot MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- validační studie MeSH
- Názvy látek
- DNA bakterií MeSH
- intergenová DNA MeSH
The original method for molecular typing of E. coli strains was developed using the polymorphism in chromosomal sequences of bacterial interspersed mosaic elements (BIMEs) detected by multiplex PCR and analysed by AFLP assay. The applicability of the method in the epidemiology of E. coli was tested on a group of 524 strains of human and veterinary origin. In the studied group 18 different genotypes were detected. Significant differences were found in the frequencies of the genotypes among various groups of strains, suggesting the method could be a promising tool in the epidemiology of E. coli.
Citace poskytuje Crossref.org
