Genome organization of Treponema zioleckii
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- MeSH
- bachor mikrobiologie MeSH
- bakteriální proteiny genetika MeSH
- DNA bakterií analýza izolace a purifikace MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom bakteriální * MeSH
- hybridizace nukleových kyselin MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- ovce MeSH
- plazmidy genetika MeSH
- replikace DNA MeSH
- sekvence aminokyselin MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- Treponema genetika izolace a purifikace MeSH
- zastoupení bazí MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- bakteriální proteiny MeSH
- DNA bakterií MeSH
Genome analysis of Treponema zioleckii proved that, in this bacterium, besides chromosomal DNA, a relatively small extrachromosomal DNA element is present. This element was shown to be a double-stranded circular plasmid DNA of approximately 7 kbp; it was designated as pKT. The plasmid was characterized by molecular and bioinformatic analysis. No pKT homologous DNA sequences were detected in other rumen Treponema strains. The overall G+C content of the pKT plasmid is approximately 56 %, which is higher than in other Treponema plasmids or genomes. The Rep module of the pKT plasmid consisting of the rep gene and the region of repeats was identified within a 1.6-kbp fragment. The putative rep gene encodes the replication protein belonging to the pfam04796 RepA_C family of proteins with the highest similarity (25 % within 249 amino acids) to the RepA protein from the green sulfur bacterium Prosthecochloris aestuarii.
Zobrazit více v PubMed
Folia Microbiol (Praha). 2006;51(4):303-5 PubMed
Plasmid. 2004 Jan;51(1):61-5 PubMed
Bacteriol Rev. 1977 Mar;41(1):181-204 PubMed
Trends Genet. 1995 Jun;11(6):217-8 PubMed
J Mol Biol. 1975 Nov 5;98(3):503-17 PubMed
Nucleic Acids Res. 1979 Nov 24;7(6):1513-23 PubMed
Variability of treponemes in the rumen of ruminants
