Variability of treponemes in the rumen of ruminants
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- MeSH
- bachor mikrobiologie MeSH
- DNA bakterií chemie genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- počet mikrobiálních kolonií MeSH
- přežvýkavci mikrobiologie MeSH
- ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- shluková analýza MeSH
- Treponema klasifikace izolace a purifikace MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- DNA bakterií MeSH
- ribozomální DNA MeSH
- RNA ribozomální 16S MeSH
Complete 16S rRNA sequences were determined of recently proposed new species of treponemes designated strain S and T. Sequence comparison indicated that both species belong to the Treponema saccharophilum cluster, having thus at least 5 cultivable representatives. Phylogenetic analysis of available GenBank 16S rRNA sequences revealed two phylogenetically distant treponema clusters (T. saccharophilum cluster and T. bryantii cluster). Surprisingly, while among cultivated treponemes dominate T. saccharophilum cluster members, detailed analysis showed that all treponema-like sequences obtained by culture independent 16S rRNA methods belong to the T. bryantii cluster, from which only two cultivable representatives have so far been known. Meta-analysis of available data revealed that treponemes are an infrequent and minor group of bacteria, representing less than 2.4% of total rumen bacteria.
Zobrazit více v PubMed
J Bacteriol. 2001 Jun;183(12):3770-83 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1982 Mar;43(3):686-93 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1979 Nov;38(5):965-73 PubMed
Folia Microbiol (Praha). 2006;51(4):303-5 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1985 Aug;50(2):212-9 PubMed
Biosci Biotechnol Biochem. 2005 Mar;69(3):499-506 PubMed
Folia Microbiol (Praha). 2008;53(3):246-8 PubMed
Appl Environ Microbiol. 2004 Mar;70(3):1315-20 PubMed
Trends Genet. 1995 Jun;11(6):217-8 PubMed
FEMS Microbiol Lett. 2008 Dec;289(2):166-72 PubMed
Anaerobe. 2007 Apr;13(2):57-64 PubMed
Arch Microbiol. 1980 Sep;127(2):145-56 PubMed
Mol Biol Evol. 2007 Aug;24(8):1596-9 PubMed
GENBANK
GQ426550, GQ426551
