Mitochondrial membrane potential-based genome-wide RNAi screen of Trypanosoma brucei
Jazyk angličtina Země Německo Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem, validační studie
- MeSH
- genom protozoální * MeSH
- genový knockdown metody MeSH
- lidé MeSH
- malá interferující RNA genetika MeSH
- membránový potenciál mitochondrií * MeSH
- průtoková cytometrie MeSH
- Trypanosoma brucei brucei genetika fyziologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- validační studie MeSH
- Názvy látek
- malá interferující RNA MeSH
We have screened the Trypanosoma brucei genome-wide RNAi library by staining the procyclics with the dye JC-1 followed by sorting the differentially stained cells by flow cytometry. This allowed us to highly enrich for cells in which mitochondrial membrane potential was decreased. We have further validated a subset of selected clones by a reverse approach in which we showed that cloning the selected genomic regions into another RNAi vector also results in a drop in mitochondrial membrane potential.
Zobrazit více v PubMed
EMBO J. 2002 Sep 2;21(17):4429-38 PubMed
J Biol Chem. 2000 Dec 22;275(51):40174-9 PubMed
Mol Biochem Parasitol. 2004 Mar;134(1):163-7 PubMed
Mol Biochem Parasitol. 2002 Nov-Dec;125(1-2):211-6 PubMed
Curr Opin Microbiol. 2004 Aug;7(4):362-8 PubMed
Biochem Soc Trans. 2005 Dec;33(Pt 6):1409-12 PubMed
Eukaryot Cell. 2006 Sep;5(9):1539-49 PubMed
EMBO J. 2008 Jan 9;27(1):143-54 PubMed
Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 Dec 8;95(25):14687-92 PubMed
Mol Microbiol. 2005 Oct;58(1):116-30 PubMed
PLoS Pathog. 2009 May;5(5):e1000436 PubMed
J Biol Chem. 2009 Mar 13;284(11):7255-63 PubMed
RNA. 2009 Apr;15(4):588-99 PubMed
Proteomics. 2009 Jan;9(2):434-50 PubMed
