The complete mitochondrial genome of the Madagascar ground gecko Paroedura picta (Squamata: Gekkonidae)
Jazyk angličtina Země Anglie, Velká Británie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- Klíčová slova
- 454 pyrosequencing, Gekkonidae, lizard, long-range PCR, mitogenome, mtDNA,
- MeSH
- biologická evoluce MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom mitochondriální genetika MeSH
- genom genetika MeSH
- ještěři genetika MeSH
- mitochondriální DNA genetika MeSH
- mitochondriální geny genetika MeSH
- mitochondrie genetika MeSH
- pořadí genů MeSH
- sekvence nukleotidů genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA metody MeSH
- zastoupení bazí genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Madagaskar MeSH
- Názvy látek
- mitochondriální DNA MeSH
We sequenced the complete mitochondrial genome of the Madagascar ground gecko Paroedura picta (Squamata: Gekkonidae). The mitogenome is 17 220 base pairs long and conforms to the typical vertebrate gene composition and arrangement, i.e. 13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, 2 ribosomal RNA genes and 1919 bp long control region. We reconstructed phylogenetic relationships of P. picta and representatives of nine other genera from the family Gekkonidae and calculated mean p-distances for all 13 protein-coding mitochondrial genes. The lowest mean p-distances were found in cytochrome oxidase subunit I and III genes (COI and COIII) indicating their usefulness for elucidating deeper phylogenetic relationships.
b Zoological Institute University of Basel Basel Switzerland
Department of Zoology Faculty of Science Charles University Prague Viničná Prague Czech Republic and
Citace poskytuje Crossref.org
