genomové ostrovy [Genomic Islands]

tematický
25
Termíny

genomické ostrovy
genomické ostrůvky
genomové ostrůvky
kotvící genomové ostrovy
ostrovy patogenity
ostrovy symbiosy
ostrovy symbiózy
ostrůvky patogenity
symbiosové ostrovy
symbiosové ostrůvky
symbiotické ostrovy
zakotvené genomové ostrovy

 

Anchored Genomic Islands
Genomic Islets
Pathogenicity Islands
Pathogenicity Islets
Symbiosis Islands
Symbiosis Islets

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D044404
Definice

Části genomů některých bakterií, bakteriofágů nebo plazmidů, které jsou součástí skupiny mobilních genetických elementů. Obsahují řadu genů ovlivňujících zdraví, např. faktory virulence (v ostrovech a ostrůvcích patogenity), geny pro antibiotickou rezistenci nebo geny pro schopnost symbiózy (v ostrovech nebo ostrůvcích symbiózy). Obsahují 10 - 500 kb a od zbytku genomu se odlišují obsahem GC bází a využitím kodonů. Pomocí specifických integráz se začleňují do určitých míst genomu. Někdy gen pro integrázu chybí a vzniká tak zakotvený genomový ostrov.

Distinct units in some bacterial, bacteriophage or plasmid GENOMES that are types of MOBILE GENETIC ELEMENTS. Encoded in them are a variety of fitness conferring genes, such as VIRULENCE FACTORS (in pathogenicity islands or islets), ANTIBIOTIC RESISTANCE genes, or genes required for SYMBIOSIS (in symbiosis islands or islets). They range in size from 10 - 500 kilobases, and their GC CONTENT and CODON usage differ from the rest of the genome. They typically contain an INTEGRASE gene, although in some cases this gene has been deleted resulting in anchored genomic islands.

DUI
D044404 MeSH Prohlížeč
CUI
M0444985
Historická pozn.
2004
Veřejná pozn.
2004

G Jevy a procesy
G02.111.570 molekulární struktura 1 331
G02.111.570.080 sekvence nukleotidů 999
G02.111.570.080.708.330 rozptýlené repetitivní sekvence 16
G02.111.570.080.708.330.200 transpozibilní elementy DNA 103
G02.111.570.080.708.330.330 genomové ostrovy 25
G02.111.570.080.708.330.800 retroelementy 53
G05.360.080 sekvence nukleotidů 999
G05.360.080.708.330.200 transpozibilní elementy DNA 103
G05.360.080.708.330.330 genomové ostrovy 25
G05.360.080.708.330.800 retroelementy 53
G05.360.340 genom 363
G05.360.340.024 komponenty genomu 13
G05.360.340.024.425.200 transpozibilní elementy DNA 103
G05.360.340.024.425.500 genomové ostrovy 25
G05.360.340.024.425.800 retroelementy 53