pozičně specifické skórovací matice [Position-Specific Scoring Matrices]

tematický
2
Termíny

pozičně frekvenční matice
sekvenční logo

 

Position Frequency Matrices
Position Weight Matrices
Position Weight Matrix
Position-Specific Scoring Matrix
Position-Specific Weight Matrices
Position-Specific Weight Matrix
Sequence Logo
Sequence Logos

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D056510
Definice

Tabulková číselná reprezentace sekvenčních motivů zobrazující jejich variabilitu jako hodnoty pravděpodobnosti pro každý nukleotid v každé pozici sekvence. Pozičně specifické skórovací matice se počítají z pozičně frekvenčních matic.

Tabular numerical representations of sequence motifs displaying their variability as likelihood values for each possible residue at each position in a sequence. Position-specific scoring matrices (PSSMs) are calculated from position frequency matrices.

DUI
D056510 MeSH Prohlížeč
CUI
M0527620
Historická pozn.
2010
Veřejná pozn.
2010

E Analytické, diagnostické a terapeutické techniky a přístroje
E05 výzkumné techniky 209
E05.318 epidemiologické metody 1 030
E05.318.740 statistika jako téma 13 066
E05.318.740.600 pravděpodobnost 275
E05.318.740.600.200 Bayesova věta 263
E05.318.740.600.300 skrytý Markovův model
E05.318.740.600.400 pravděpodobnostní funkce 85
E05.318.740.600.500 Markovovy řetězce 47
E05.318.740.600.600 odds ratio 277
E05.318.740.600.650 pozičně specifické skórovací matice 2
E05.318.740.600.675 tendenční skóre 83
E05.318.740.600.700 proporcionální rizikové modely 475
E05.318.740.600.800 riziko 2 681
E05.318.740.600.900 nejistota 85
E05.393 genetické techniky 579
E05.393.760 sekvenční analýza 135
E05.393.760.319 vysoce účinné nukleotidové sekvenování 533
E05.393.760.479 anotace sekvence 58
E05.393.760.560 nanopórové sekvenování 4
E05.393.760.640 sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů 256
E05.393.760.670 pozičně specifické skórovací matice 2
E05.393.760.700 sekvenční analýza DNA 1 477
E05.393.760.705 sekvenční analýza proteinů 44
E05.393.760.710 sekvenční analýza RNA 118

G Jevy a procesy
G02 chemické jevy 307
G02.111 biochemické jevy 370
G02.111.570 molekulární struktura 1 314
G02.111.570.580 konzervovaná sekvence 95
G02.111.570.580.175 konsenzuální sekvence 20
G02.111.570.580.175.500 pozičně specifické skórovací matice 2

Přidat