The incidence of renal cell carcinoma (RCC) is increasing worldwide, and its prevalence is particularly high in some parts of Central Europe. Here we undertake whole-genome and transcriptome sequencing of clear cell RCC (ccRCC), the most common form of the disease, in patients from four different European countries with contrasting disease incidence to explore the underlying genomic architecture of RCC. Our findings support previous reports on frequent aberrations in the epigenetic machinery and PI3K/mTOR signalling, and uncover novel pathways and genes affected by recurrent mutations and abnormal transcriptome patterns including focal adhesion, components of extracellular matrix (ECM) and genes encoding FAT cadherins. Furthermore, a large majority of patients from Romania have an unexpected high frequency of A:T>T:A transversions, consistent with exposure to aristolochic acid (AA). These results show that the processes underlying ccRCC tumorigenesis may vary in different populations and suggest that AA may be an important ccRCC carcinogen in Romania, a finding with major public health implications.

• MeSH
• dospělí MeSH
• fokální adheze metabolismus   MeSH
• fosfatidylinositol-3-kinasy genetika   MeSH
• fúzní onkogenní proteiny genetika   MeSH
• genetická variace * MeSH
• genom lidský genetika   MeSH
• genomika * MeSH
• karcinom z renálních buněk genetika   MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• mutační rychlost MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• sestřih RNA genetika   MeSH
• signální transdukce genetika   MeSH
• stanovení celkové genové exprese MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Evropa MeSH