Streptococcus pyogenes je patogen způsobující především hnisavé infekce faryngu a kůže, může však vyvolat i systémové infekce, které mohou být doprovázeny streptokokovým syndromem toxického šoku. Významnými faktory virulence produkovanými tímto agens jsou pyrogenní exotoxiny, tzv. superantigeny. Vyvolávají hyperstimulaci imunitního systému s masivní sekrecí prozánětlivých cytokinů, která může vyústit až v poškození tkání a selhání orgánů. Hlavním faktorem virulence S. pyogenes je M protein kódovaný genem emm, na jehož základě jsou kmeny členěny do emm typů. V Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy bylo analyzováno celkem 27 klinických izolátů S. pyogenes z let 2018–2020, které patřily k 11 různým emm typům. Zjišťována byla přítomnost genů kódujících superantigeny – speA, speC, speG, speH, speI, speJ, speK, speL, speM, ssa a smeZ – pomocí polymerázové řetězové reakce v reálném čase (RT-PCR). Napříč analyzovanými kmeny byly identifikovány všechny testované geny kódující superantigeny. Počet superantigenů nesených izoláty se pohyboval mezi 0–6 geny. Jelikož nosičství konkrétních superantigenů je spojeno s emm typy, sledování distribuce superantigenů přináší cenná epidemiologická data o subtypech S. pyogenes v rámci emm typů.
Streptococcus pyogenes is a pathogen which causes mainly suppurative infections of the pharynx and skin but may also be involved in systemic infections, possibly accompanied by streptococcal toxic shock syndrome. Important virulence factors produced by this agent are pyrogenic exotoxins, the so-called superantigens. They induce hyperstimulation of the immune system with massive secretion of anti-inflammatory cytokines, which may even result in tissue damage and/or organ failure. The major virulence factor of S. pyogenes is M protein encoded by the emm gene, used as the basis for emm typing. The National Reference Laboratory for Streptococcal Infections analysed 27 clinical isolates of S. pyogenes from 2018–2020 assigned to 11 emm types. The real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to detect the genes encoding superantigens – speA, speC, speG, speH, speI, speJ, speK, speL, speM, ssa, and smeZ. All the genes listed above were revealed across the study strains. The number of superantigens carried by the study isolates ranged from zero to six. As the carriage of specific superantigens is associated with emm types, the monitoring of superantigen distribution provides valuable epidemiological data on S. pyogenes subtypes within emm types.
- MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- Streptococcus pyogenes * genetika izolace a purifikace MeSH
- superantigeny izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Práce se zabývá studiem grampozitivní bakterie Streptococcus suis. Jedná se o zoopatogena, který je schopný vy-volávat sporadické infekce lidí. Tyto infekce jsou zaznamenávány i v České republice . Touto prací se na ně snažíme upozornit a zkvalitnit jejich diagnostiku. Doposud byly využívány převážně metody klasické mikrobiologie a nyní se do možného spektra použití zavedly i metody molekulární.
The focus is on the study of the Gram-positive bacterium Streptococcus suis, a zoopathogen which causes spo-radic infection in humans. These infections also occur in the Czech Republic. This study draws attention to these infections in order to improve their diagnosis. To date, conventional microbiological methods have mostly been used for the diagnosis, and recently, molecular methods have also become available.
- MeSH
- mikrobiologie * MeSH
- Streptococcus MeSH
- streptokokové infekce MeSH
- Publikační typ
- biografie MeSH
- nekrology MeSH
- O autorovi
- Šrámek, Jaroslav, 1922-2019 Autorita
- Klíčová slova
- hexavakcína, odložené očkování kvůli respirační infekci, konjugované pneumokokové vakcíny,
- MeSH
- anamnéza MeSH
- antibakteriální látky * aplikace a dávkování farmakologie terapeutické užití MeSH
- apatie MeSH
- C-reaktivní protein normy MeSH
- edém mozku MeSH
- fatální výsledek * MeSH
- fibrilace komor MeSH
- hemiplegie * diagnóza MeSH
- horečka MeSH
- hospitalizace * MeSH
- infekce dýchací soustavy MeSH
- jednotky intenzivní péče pediatrické * MeSH
- kojenec * MeSH
- laboratoře MeSH
- lidé MeSH
- meningitida * diagnóza etiologie farmakoterapie terapie MeSH
- mozkomíšní mok * mikrobiologie MeSH
- paracetamol aplikace a dávkování farmakologie terapeutické užití MeSH
- péče o pacienty v kritickém stavu MeSH
- pediatrie * metody organizace a řízení pracovní síly MeSH
- pneumokokové vakcíny klasifikace MeSH
- poruchy vědomí MeSH
- resuscitace MeSH
- sepse MeSH
- sérotypizace klasifikace MeSH
- srdeční zástava MeSH
- status epilepticus diagnóza MeSH
- Streptococcus pneumoniae * MeSH
- vakcinace * využití zákonodárství a právo MeSH
- zvracení MeSH
- Check Tag
- kojenec * MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Naše sdělení se zabývá výběrem vhodného materiálu a jeho přípravou pro bezkultivační laboratorní diagnostiku, průkaz a typizaci DNA původců invazivních meningokokových, pneumokokových a hemofilových onemocnění. Jedná se především o klinické obrazy odpovídající invazivnímu onemocnění: meningitida, septikémie, bakteriémie, pneumonie. Vhodným klinickým materiálem dle EU „case“ definice je pouze materiál z míst za normálních podmínek sterilních (cerebrospinální mok, krev, popř. sekční materiál). Tento materiál se v Oddělení vzdušných bakteriálních nákaz, CEM, SZÚ po jeho doručení ihned zpracovává. Prvotní zpracování je pomocí zde předkládaného postupu izolace DNA. S izolovanou DNA se dále pracuje molekulárními technikami PCR a real-time PCR za účelem identifikace a následné typizace uvedených původců invazivních bakteriálních onemocnění. V současné době nabízíme možnost celkového vyšetření zmiňovaného klinického materiálu při podezření na invazivní onemocnění způsobené bakteriemi Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae nebo Haemophilus influenzae a posléze typizace Neisseria meningitidis či Streptococcus pneumoniae. Provádění těchto vyšetření má velký význam, vzhledem ke stále se zvyšujícímu procentu invazivních bakteriálních onemocnění kultivačně negativních, laboratorně diagnostikovaných pouze metodami PCR.
This article is about selecting appropriate clinical specimens and processing them for non-culture laboratory diagnosis, detection, and typing of DNA of the causative agents of invasive meningococcal, pneumococcal, and Haemophilus infections. The patients present with clinical pictures of invasive infection: meningitis, septicemia, bacteremia, or pneumonia. As it follows from the EU case definition, only specimens collected from normally sterile sites are considered appropriate, i.e. cerebrospinal fluid (CSF), blood, or autopsy specimens. These clinical specimens are processed as soon as received by the Unit for Airborne Bacterial Infections, Centre for Epidemiology and Microbiology, National Institute of Public Health. Step 1 of the processing is DNA isolation using the procedure specified in this article. The DNA obtained is analyzed by molecular methods such as PCR and real-time PCR allowing for the identification and subsequent typing of the above mentioned causative agents of invasive infections. At present, the laboratory is able to provide a comprehensive analysis of the clinical specimens from patients with suspected invasive bacterial infections caused by Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumonie, or Haemophilus influenzae, followed by subsequent typing of Neisseria meningitides and Streptococcus pneumoniae, if appropriate. These advanced investigations are increasingly relevant as the proportion of culture-negative cases of invasive bacterial infections whose laboratory diagnosis is only feasible by PCR-based methods is on the rise.
- MeSH
- DNA * izolace a purifikace MeSH
- Haemophilus influenzae * izolace a purifikace MeSH
- lidé MeSH
- molekulární biologie metody MeSH
- Neisseria meningitidis * izolace a purifikace MeSH
- odběr biologického vzorku MeSH
- směrnice jako téma MeSH
- Streptococcus pneumoniae * izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
