The low frequency of nontuberculous mycobacterial infections, nonspecific symptoms for individual mycobacteria, and the lack of specific identification methods could alter correct diagnosis. This study presents a combined microbiology and molecular-based approach for Mycobacterium marinum detection in four aquarists with cutaneous mycobacterial infection. Simultaneously, ecology screening for M. marinum presence in the aquarists' fish tanks was performed. A total of 38 mycobacterial isolates originated from four human patients (n = 20), aquarium animals (n = 8), and an aquarium environment (n = 10). Isolate identification was carried out using 16S rRNA sequence analysis. A microbiology-based approach, followed by 16S rRNA sequence analysis, was successfully used for detection of M. marinum in all four patients. Animal and environmental samples were simultaneously examined, and a total of seven mycobacterial species were isolated: Mycobacterium chelonae , Mycobacterium fortuitum , Mycobacterium gordonae , Mycobacterium kansasii , Mycobacterium mantenii , Mycobacterium marinum , and Mycobacterium peregrinum . The presence of M. marinum was proven in the aquarium environments of two patients. Although M. marinum is described as being present in water, it was detected only in fish.
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie terapeutické užití MeSH
- atypické mykobakteriální infekce diagnóza farmakoterapie mikrobiologie patologie MeSH
- klarithromycin farmakologie terapeutické užití MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- mikrobiologie životního prostředí MeSH
- Mycobacterium marinum klasifikace účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- Mycobacterium klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- ryby mikrobiologie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Je uveden výtah z příručky shrnující laboratorní metody diagnostiky tuberkulózy prováděné v současné době v Evropě. Příručku vydalo v květnu 2011 Evropské centrum pro prevenci a kontrolu nemocí pro laboratorní i klinické pracovníky, a to na základě údajů Evropských referenčních laboratoří pro TB. Jde o první krok k dosažení sjednocení a standardizaci vhodných laboratorních metod pro kontrolu TB v zemích Evropské Unie. Metody jsou přehledně rozčleněny na ty používané v diagnostice tuberkulózní infekce (tuberkulínové testy a IGRA metody), v diagnostice aktivních tuberkulózních onemocnění (mikroskopická a kultivační vyšetření), při identifikaci druhů a typizaci, jakož i při stanovení rezistence na antituberkulotika. Jsou uvedeny jak klasické a dobře známé mikrobiologické metody, tak i moderní imunologické a molekulární testy až po automatizované systémy identifikace jednotlivých kmenů mykobakterií analýzou DNA. Pozornost je soustředěna na indikace, přípravu, provádění a hodnocení jednotlivých testů, zásady bezpečnosti práce a provádění kontrol kvality, přičemž u jednotlivých testů je popsána jak podstata jejich provádění, tak i komerční názvy, což přispívá k přehlednosti.
This is an abridgement of a handbook summarizing laboratory methods for the diagnosis of tuberculosis currently used in Europe. The handbook, published in May 2011 by the European Centre for Disease Prevention and Control to serve both laboratory and clinical workers, is based on data from the European Reference Laboratory Network for TB. It is the first step towards unification and standardization of laboratory methods suitable for TB control in the European Union countries. The methods are clearly divided into those for diagnosing tuberculous infections (tuberculin skin tests and IGRAs), diagnosing active TB diseases (microscopy and culture tests), species identification and typing as well as detecting resistance to antituberculous drugs. The handbook includes both traditional, well-known microbiological methods and modern immunological and molecular assays as well as automated systems for identification of individual mycobacterial strains using DNA analysis. Focus is placed on indication, preparation, performance and interpretation of individual tests, work safety policy and quality assuranee. For particular tests, both the methods and commercial names are stated.
- Klíčová slova
- laboratorní dignostika, diagnostika tuberkulózní infekce, diagnostika aktivní tuberkulózy, kultivace, typizace a identifikace, analýza DNA, molekulární metody, příručka ECDC,
- MeSH
- analýza polymorfismu délky amplifikovaných restrikčních fragmentů MeSH
- DNA fingerprinting metody MeSH
- klinické laboratorní techniky metody využití MeSH
- kultivační techniky metody trendy MeSH
- laboratoře normy organizace a řízení MeSH
- latentní tuberkulóza diagnóza MeSH
- mikrobiologické techniky metody MeSH
- mikroskopie metody MeSH
- molekulární typizace metody MeSH
- sputum mikrobiologie MeSH
- test pomocí interferonu gama metody MeSH
- tuberkulinový test metody MeSH
- tuberkulóza diagnóza MeSH
- Publikační typ
- laboratorní příručky MeSH
Jsou shrnuta doporučení skupiny expertů a základní údaje týkající se vhodnosti a účelnosti používání metod IGRA a tuberkulínové kožní zkoušky (TST) v diagnostice aktivní TB a LTBI, tak jak jsou uvedena v dokumentu vydaném v březnu 2011 Evropským centrem pro prevenci a kontrolu nemocí (ECDC) jako orgánu Evropské Unie. V souborech prací publikovaných ve světovém písemnictví byly stanoveny senzitivita, specificita, pozitivní a negativní prediktivní hodnoty jednotlivých použitých IGRA (TST) metod, a to jak pro imunokompetentní, tak i imunokompromitované (zejména infikované HIV) dospělé osoby a děti. Pozornost byla věnována vlivu BCG vakcinace, použití při screeningových vyšetřeních osob s vyšším rizikem TB, včetně ekonomických aspektů (10. Zpráva komise Světové zdravotnické organizace STAG-TB). IGRA metody nemohou nahradit v diagnostice aktivní TB v současnosti používaný soubor vyšetřovacích metod, v určitých klinických situacích mohou poskytnout doplňující informace k souboru vyšetření. Mohou však být užitečné v diagnostice LTBI (přes stávající omezení, jako je neexistence zlatého standardu), jako součást celkového posouzení TB rizika. U BCG vakcinovaných jsou specifičtější než TST, jsou vhodné pro hromadná vyšetřování v zemích s nízkou incidencí TB. Senzitivita obou IGRA metod je však považována panelem expertů i nadále za suboptimální. Na základě těchto utříděných informací se lze lépe orientovat ve volbě vhodné metody pro použití v dané klinické situaci.
Summarized are expert opinions and basic data on the use of the IGRA methods and tuberculin skin test (TST) for the diagnosis of active TB and LTBl, as stated in a document published in March 2011 by the European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), a European Union agency. Meta-analyses of studies published worldwide were performed to determine the sensitivity, specificity, positive and negative predictive values of individual IGRA (TST) methods for both immunocompetent and immunocompromised (especially HIV-infected) adults and children. Attention was paid to the effect of BCG vaccination, the use in screening of persons at higher risk of TB, including economic aspects (WHO STAG-TB Report of the tenth meeting). IGRA methods should not replace the existing standard diagnostic methods for the diagnosis of active TB. In certain clinical situations they could contribute supplementciry information as part of the diagnostic work-up. However, they may be beneficial in the diagnosis of LTBl (despite the existing limitations such as the lack of a diagnostic gold stsmdard for LTBl), as part of the overall risk assessment. In BCG-vaccinated individuals, they are more specific than TST. They are suitable for mass screenings in low TB incidence countries. The sensitivity of the two IGRA methods is still considered suboptimal by the panel of experts. Such structured data help to select adequate methods to be used in specific clinical situations.
- Klíčová slova
- aktivní TB, latentní TB infekce, diagnostika TB, IGRA metody, tuberkulinová kožní zkouška, Quantiferon-GIT, T-Spot. TB,
- MeSH
- BCG vakcína imunologie MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- HIV infekce imunologie komplikace MeSH
- hostitel s imunodeficiencí imunologie MeSH
- imunologické testy metody normy MeSH
- interferon gama imunologie krev MeSH
- interferonové induktory imunologie MeSH
- latentní tuberkulóza diagnóza prevence a kontrola MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- tuberkulinový test normy MeSH
- tuberkulóza diagnóza prevence a kontrola MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
V článku je popsán výskyt tuberkulózy způsobené multirezistentními kmeny Mycobacterium tuberculosis (MDR TB) v České republice v letech 2003 až 2008. Hlavním zdrojem dat byl Informační systém bacilární tuberkulózy a Registr tuberkulózy, další potřebné informace byly získány od příslušných krajských konzultantů TBC, odpovědných zaměstnanců krajských hygienických stanic, Národní referenční laboratoře pro mykobakterie a od lékařů oddělení pneumologie a ftizeologie. Byly sledovány následující proměnné: věk nemocného v roce, kdy byla MDR poprvé zjištěna, pohlaví, země původu, lokalizace TBC procesu, zda se jednalo o recidivu a zda byl pacient již dříve pro tuberkulózu léčen, způsob zjištění onemocnění, výsledek vyšetření (zda byl vzorek pozitivní i mikroskopicky), výsledek vyšetření citlivosti na další antituberkulotika 1. řady, HIV status a výskyt rizikových faktorů TBC. MDR kmen byl během sledovaného období diagnostikován u 61 pacientů z celkem 4 114 případů (1,5 %), u kterých bylo provedeno vyšetření citlivosti kmene M. tuberculosis na isoniazid a rifampicin. Mezi nejdůležitější zjištění patří problémy v interpretaci laboratorních výsledků, občasná neshoda v názorech lékařů mikrobiologů a pneumologů, zda se jedná o MDR TB či nikoli a také poměrně častý nesoulad v záznamech dvou paralelně fungujících částí Registru tuberkulózy.
The incidence of tuberculosis caused by multidrug-resistant strains Mycobacterium tuberculosis (MDRTB) in the Czech Republic in 2003-2008 was described. The national web-based Information System of Bacillary Tuberculosis and TB Registry have served as the main sources of data; further information was obtained from regional TB consultants, regional public health institutes, the National Reference Mycobacterium Laboratory and physicians from departments of tuberculosis and respiratory diseases. The following variables were analyzed: age in the year of the first MDR detection, gender, country of origin, localization of TB process, a relapse of TB, previous TB treatment, way of disease detection, examination results (smear positivity), results of drug susceptibility testing to other first-line anti-TB drugs, HIV status, and presence of risk factors for tuberculosis. An MDR strain was diagnosed in 61 patients out of overall 4,114 cases (1.5 %) undergoing drug susceptibility testing of M. tuberculosis strains to isoniazid and rifampicin. The most important findings include difficulties with laboratory result interpretation, occasional disagreement between pneumologists and microbiologists as to whether the case is (or is not) MDR TB, and also relatively frequent discrepancies in records of the two simultaneously functioning parts of the TB Registry.
- MeSH
- antituberkulotika škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- epidemiologie statistika a číselné údaje MeSH
- fungální léková rezistence genetika imunologie účinky léků MeSH
- HIV infekce MeSH
- incidence MeSH
- isoniazid škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- multirezistentní tuberkulóza epidemiologie MeSH
- Mycobacterium tuberculosis izolace a purifikace patogenita účinky léků MeSH
- registrace statistika a číselné údaje MeSH
- rifampin škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- rizikové faktory MeSH
- statistika jako téma MeSH
- tuberkulóza diagnóza epidemiologie etiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Článek volně navazující na již publikované sdělení „Výskyt tuberkulózy vyvolané multirezistentními kmeny Mycobacterium tuberculosis v České republice v letech 2003 až 2008“ je zaměřen na léčebné výsledky pacientů s tuberkulózou vyvolanou multirezistentními kmeny M. tuberculosis (MDR TB) v České republice v letech 2003 až 2008. Hlavním zdrojem dat byl Informační systém bacilární tuberkulózy a Registr tuberkulózy, další potřebné informace byly získány od příslušných krajských konzultantů TBC, odpovědných zaměstnanců krajských hygienických stanic, Národní referenční laboratoře pro mykobakterie a od lékařů specializace pneumologie a ftizeologie. MDR kmen byl během sledovaného období diagnostikován u 61 pacientů. Nejdůležitějším zjištěním je nízké procento léčebných úspěchů za 24 měsíců od zahájení terapie (28 %), které je srovnatelné s výsledky ze států EU/EEA.
The article, as a free continuation of the previously published paper „The occurrence of tuberculosis caused by multidrug-resistant strains Mycobacterium tuberculosis in the Czech Republic during 2003-2008", focuses on the treatment outcomes of patients with tuberculosis caused by multidrug-resistant strains M. tuberculosis (MDR TB) in the Czech Republic in 2003-2008. The national web-based Information System of Bacillary Tuberculosis and TB Registry served as the main sources of data, further information was obtciined from regional TB consultants, regional public health institutes, the National Reference Mycobacterium Laboratory and pneumologists. During the monitored period, MDR strains were diagnosed in 61 patients. The most important finding is a low percentage of successful outcomes after 24-month treatment (28 %), which is comparable with results from the EU/EEA countries.
- Klíčová slova
- MDR TB, AT léčba, výsledky léčby,
- MeSH
- adherence pacienta MeSH
- antituberkulotika aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- epidemiologie statistika a číselné údaje MeSH
- fungální léková rezistence genetika imunologie účinky léků MeSH
- isoniazid MeSH
- lidé MeSH
- multirezistentní tuberkulóza diagnóza farmakoterapie terapie MeSH
- Mycobacterium tuberculosis izolace a purifikace patogenita účinky léků MeSH
- rifampin MeSH
- statistika jako téma MeSH
- tuberkulóza diagnóza farmakoterapie terapie MeSH
- výsledky a postupy - zhodnocení (zdravotní péče) MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- O autorovi
- Mezenský, Lev, 1934-2009 Autorita
