During aetiological study of diseased red clover (Trifolium pratense L.) using high throughput sequencing, a novel virus with a 10 kb genome divided into two segments was discovered. The virus, tentatively named red clover associated varicosavirus (RCaVV), is phylogenetically related to classifiable members of the genus Varicosavirus (family Rhabdoviridae, order Mononegavirales). Analysis of mRNA levels from the individual RCaVV genes suggested possible differences in transcription regulation between rhabdoviruses with divided and undivided genomes.
- MeSH
- DNA viry klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom virový MeSH
- nemoci rostlin virologie MeSH
- rostlinné viry klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- Trifolium virologie MeSH
- virové proteiny genetika MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- antivirové látky aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- chronická nemoc farmakoterapie prevence a kontrola terapie MeSH
- diagnostické techniky a postupy využití MeSH
- DNA viry izolace a purifikace patogenita růst a vývoj MeSH
- hepatitida B * diagnóza epidemiologie etiologie MeSH
- hepatitida C * diagnóza epidemiologie etiologie MeSH
- hepatocelulární karcinom diagnóza prevence a kontrola terapie MeSH
- imunizace metody trendy využití MeSH
- jaterní cirhóza diagnóza dietoterapie embryologie MeSH
- klinický obraz nemoci MeSH
- lidé MeSH
- přenos infekční nemoci prevence a kontrola MeSH
- preventivní lékařství * metody trendy MeSH
- sérologie metody trendy MeSH
- transplantace jater metody trendy využití MeSH
- virová hepatitida u lidí diagnóza epidemiologie etiologie MeSH
- viry hepatitidy enzymologie imunologie klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Exfoliative toxin A (ETA)-coding temperate bacteriophages are leading contributors to the toxic phenotype of impetigo strains of Staphylococcus aureus. Two distinct eta gene-positive bacteriophages isolated from S. aureus strains which recently caused massive outbreaks of pemphigus neonatorum in Czech maternity hospitals were characterized. The phages, designated φB166 and φB236, were able to transfer the eta gene into a prophageless S. aureus strain which afterwards converted into an ETA producer. Complete phage genome sequences were determined, and a comparative analysis of five designed genomic regions revealed major variances between them. They differed in the genome size, number of open reading frames, genome architecture, and virion protein patterns. Their high mutual sequence similarity was detected only in the terminal regions of the genome. When compared with the so far described eta phage genomes, noticeable differences were found. Thus, both phages represent two new lineages of as yet not characterized bacteriophages of the Siphoviridae family having impact on pathogenicity of impetigo strains of S. aureus.
- MeSH
- DNA virů chemie genetika MeSH
- DNA viry genetika izolace a purifikace MeSH
- epidemický výskyt choroby MeSH
- exfoliatiny genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom virový * MeSH
- impetigo epidemiologie mikrobiologie MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí epidemiologie MeSH
- lidé MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- novorozenec MeSH
- otevřené čtecí rámce MeSH
- polymorfismus délky restrikčních fragmentů MeSH
- pořadí genů MeSH
- porodnice MeSH
- přenos genů horizontální MeSH
- profágy klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- sekvenční homologie MeSH
- shluková analýza MeSH
- stafylokokové bakteriofágy klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- stafylokokové infekce epidemiologie mikrobiologie MeSH
- Staphylococcus aureus izolace a purifikace virologie MeSH
- syntenie MeSH
- transdukce genetická MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- Adenoviridae izolace a purifikace MeSH
- dítě MeSH
- DNA viry izolace a purifikace MeSH
- Enterovirus izolace a purifikace MeSH
- hospitalizace MeSH
- infekce dýchací soustavy mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- Mycoplasma izolace a purifikace MeSH
- Orthomyxoviridae izolace a purifikace MeSH
- Respirovirus izolace a purifikace MeSH
- RNA-viry izolace a purifikace MeSH
- Simplexvirus izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
