Arthroderma is the most diverse genus among dermatophytes encompassing species occurring in soil, caves, animal burrows, clinical material and other environments. In this study, we collected ex-type, reference and authentic strains of all currently accepted Arthroderma species and generated sequences of three highly variable loci (ITS rDNA, β-tubulin, and translation elongation factor 1-α). The number of accepted species was expanded to 27. One novel species, A. melbournense (ex-type strain CCF 6162T = CBS 145858T), is described. This species was isolated from toenail dust collected by a podiatrist in Melbourne, during an epidemiological study of four geographical regions of Eastern Australia. Trichophyton terrestre, Chrysosporium magnisporum, and Chrysosporium oceanitis are transferred to Arthroderma. Typification is provided for T. terrestre that is not conspecific with any of the supposed biological species from the former T. terrestre complex, that is, A. insingulare, A. lenticulare and A. quadrifidum. A multi-gene phylogeny and reference sequences provided in this study should serve as a basis for future phylogenetic studies and facilitate species identification in practice.LAY ABSTRACT: The genus Arthroderma encompasses geophilic dermatophyte species that infrequently cause human and animal superficial infections. Reference sequences from three genetic loci were generated for all currently accepted Arthroderma species and phylogeny was constructed. Several taxonomic novelties are introduced. The newly provided data will facilitate species identification and future taxonomic studies.
- MeSH
- Arthrodermataceae klasifikace genetika MeSH
- DNA fungální genetika MeSH
- elongační faktor 1 genetika MeSH
- fylogeneze * MeSH
- geny hub genetika MeSH
- lidé MeSH
- mezerníky ribozomální DNA genetika MeSH
- Microsporum klasifikace genetika MeSH
- Trichophyton klasifikace genetika MeSH
- tubulin genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Austrálie MeSH
Cílem práce bylo zhodnotit molekulárně genetickými metodami (MGM) spektrum původců dermatofytóz na území České republiky s rozdělením podle hlavních klinických forem. Během dvou let (červenec 2011 až červen 2013) bylo na šesti regionálních pracovištích zachyceno 3235 kultivačně pozitivních vzorků s dermatofyty. Nejvyšší počet izolátů pocházel z případů tinea unguium (55,5 %), dále t. corporis (29,2 %), t. pedis (14,6 %) a t. capitis (0,7 %). Druhová identifikace izolátů všech druhů (n = 672) s výjimkou Trichophyton rubrum (n = 2 563) byla provedena MGM (PCR-fingerprinting nebo sekvenace ITS oblasti rDNA). Pro T. rubrum byla molekulárně ověřena jen identifikace morfologicky nejednoznačných izolátů (n = 189). Celkem bylo identifikováno 14 druhů dermatofytů, přičemž nejvýznamnější změnou oproti minulosti bylo vysoké zastoupení zoofilního druhu Arthroderma benhamiae, který působil velkou část případů t. corporis (22,9 %) a t. capitis (29,2 %). Geofilní druhy působily jen 1,3 % všech infekcí, přestože se jednalo o druhově nejpočetnější skupinu, ve které byly odhaleny dva nepopsané druhy a také přehlížené druhy Microsporum persicolor a M. fulvum. Klíčová slova: Arthroderma benhamiae – DNA sekvenace – geofilní dermatofyty – ITS oblast rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguium – zoofilní dermatofyty
The aim of the study was to evaluate the spectrum of causative agents of the main clinical forms of dermatophytoses in the Czech Republic by molecular genetic methods (MGM). During two years (from July 2011 to June 2013), 3255 cultivation specimens were positive for dermatophytes. The highest number of specimens was isolated from tinea unguinum (55,5%), then tinea corporis (29,2%), tinea pedis (14,6%) and tinea capitis (0,7%). The identification of isolated species (n = 672) except for Trichophytom rubrum (n = 2563) was performed by MGM (PCR fingerprinting or sequencing of ITS segments of rDNA). For T. rubrum only morphologically non-clear isolates were identified (n = 189). In total, 14 species of dermatophytes were identified. The most important change noticed compared to previous results was an increased detection of Arthroderma benhamiae in the cases of tinea corporis (22,9%) and tinea capitis (29,2%). Geophilic species caused only 1,3% of all infections even if this group comprised the highest number of species with two newly described ones and also Microsporum persicolor and M. fulvum wich are usually overlooked in the morphological examination. Key words: Arthroderma benhamiae – DNA sequencing – geophilic dermatopytes – ITS region of rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguinum – zoophilic dermatophytes
- Klíčová slova
- Arthroderma benhamiae, zoofilní dermatofyty, tinea unguium, tinea corporis, PCR-fingerprinting, ITS oblast rDNA, geofilní dermatofyty, Trichophyton rubrum,
- MeSH
- Arthrodermataceae genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- dermatomykózy * epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- DNA fingerprinting MeSH
- DNA fungální analýza MeSH
- DNA primery diagnostické užití MeSH
- druhová specificita MeSH
- houby * genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- mykologické určovací techniky metody MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- ribozomální DNA MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- tinea capitis epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- tinea pedis epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- tinea * epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- Trichophyton genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Uvádíme kazuistiku kožní mykotické infekce typu tinea corporis u čtyřicetileté ženy. Ložisko infekce bylo lokalizované na hřbetu levé ruky a nereagovalo na úvodní lokální léčbu ciklopiroxolaminem. Změna léčby na systémovou terapii terbinafinem byla spojena s výskytem nežádoucích účinků a musela být ukončena. Ložisko bylo úspěšně vyléčeno kombinací lokálních antimykotik naftifinu a natamycinu. Jako původce infekce byl izolován zástupce geofilních dermatofytů Microsporum incurvatum, který je poměrně vzácně izolován z klinického materiálu a pravděpodobně žádný případ infekce zatím nebyl popsán v České republice. Identifikace izolátu byla ověřena sekvenací oblasti ITS rDNA. Vzhledem k morfologické podobnosti s druhy M. gypseum a M. fulvum je možné, že část infekcí přisuzovaných těmto druhům je ve skutečnosti působena právě M. incurvatum. Dále se v článku diskutuje o kontroverzní taxonomii druhu spolu s možnostmi, jak je možné ho rozlišit od příbuzných druhů. Klíčová slova: Arthroderma – ciklopiroxolamin – dermatofytózy – naftifin – natamycin – terbinafin
We present a case of mycotic infection of tinea corporis type in a forty-year old woman. The lesion was localised on the dorsal aspect of the left hand and did not react to ciclopirox olamine. The systemic therapy by terbinafine was stopped because of its side effects. The lesion was treated successfully with local antimycotics naftifine and natamycin. The geophillic dermatophyte Microsporum incurvatum was isolated and verified by the sequencing of ITS rDNA. This dermatophyte is rarely isolated from clinical material and probably no case was described in the Czech Republic. It is possible that some infections caused by M. incurvatum are attributed to M. gypseum and M. fulvum due to morphologic similarity of these species. The controversial taxonomy of this species and possibility of its differentiation from other species is discussed as well. Key words: Arthroderma – ciclopirox olamine– dermatophytoses – naftifine – natamycin – terbinafine
- Klíčová slova
- ciklopiroxolamin, naftifin, dermatofytózy,
- MeSH
- allylamin analogy a deriváty terapeutické užití MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- antifungální látky * terapeutické užití MeSH
- antiinfekční látky lokální terapeutické užití MeSH
- Arthrodermataceae genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- DNA fungální MeSH
- dospělí MeSH
- inhibitory enzymů škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- kombinovaná farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum * genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- naftaleny škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- natamycin terapeutické užití MeSH
- pyridony škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- ribozomální DNA MeSH
- ruka MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- terbinafin MeSH
- terminologie jako téma MeSH
- tinea * diagnóza farmakoterapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Taxonomie dermatofytů prošla v minulosti řadou výrazných změn a nikdy nebyla příliš stabilní. Poslední rozsáhlejší změny proběhly v souvislosti s revizí skupiny molekulárně genetickými metodami. Hlavním cílem této práce je seznámit čtenáře s pokroky v taxonomii dermatofytů a prostřednictvím seznamu doporučených jmen sjednotit pojmenovávání druhů napříč českými pracovišti. To by mělo nejen usnadnit komunikaci, ale také porovnávání výsledků se zahraniční literaturou. Jedním z doporučení je například ukončení používání jména Trichophyton mentagrophytes v klinické praxi. V úvodu textu se diskutuje o problematickém konceptu druhu u dermatofytů, jehož rozdílná aplikace může mít velký vliv na počet uznávaných druhů. Závěrečná část je věnována budoucím změnám souvisejícím s novým vydáním Mezinárodního kódu nomenklatury řas, hub a rostlin. Jedná se především o ukončení duální nomenklatury hub a vybrání jediného správného jména pro každý druh. Obecně se dá říci, že je vhodné preferovat jméno nepohlavního stadia (Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton), s výjimkou případů, kde toto jméno není k dispozici (např. Arthroderma benhamiae). Klíčová slova: Arthroderma – druhový koncept – fylogeneze – Mezinárodní nomenklatorický kód – jedna houba, jedno jméno – polyfázický přístup – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes
Taxonomy of dermatophytes has changed significantly in the past and it has never been stable. Last extensive changes appeared after revision of the group by molecular genetic methods. This paper introduces the advances in taxonomy of dermatophytes and helps to unify the species names in use among the Czech laboratories to simplify their communication and comparison of the results with foreign literature. The complicated species concept of dermatophytes that might be applied differently and might influence the number of accepted species is discussed in the beginning. The last part is dedicated to future changes related to a new edition of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants namely to termination of a dual nomenclature of fungi and choosing the one correct name for each species. Key words: Atrhroderma – species concept – phylogeny – the International Code of Nomenclature – one fungus one name – polyphasic approach – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes
- Klíčová slova
- druhový koncept, Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, polyfázický přístup, Mezinárodní nomenklatorický kód, zoofilní druhy, geofilní druhy,
- MeSH
- Arthrodermataceae klasifikace MeSH
- dermatomykózy mikrobiologie MeSH
- Epidermophyton klasifikace MeSH
- fylogeneze * MeSH
- houby klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum klasifikace MeSH
- mitosporické houby * izolace a purifikace klasifikace MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- terminologie jako téma * MeSH
- Trichophyton klasifikace MeSH
- zoonózy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
An undescribed Microsporum species was isolated from skin scales recovered from a 40-mm large, annular, scaling lesion on the wrist of a 46-year-old woman. The risk factors for dermatophyte infection in the patient were frequent work in the garden, hunting, and contact with dogs and horses. Direct microscopic examination of the scales revealed the presence of dermatophyte hyphae; when the samples were cultured, a morphologically similar fungus grew on all slants in pure culture. Both of these findings strongly suggested that the isolate was the true causal agent of infection. The possible geophilic nature of the species was based on phylogenetic analysis (internal transcribed spacer region of rDNA and β-tubulin gene) that placed it in between species of the M. gypseum complex. However, its divergencies from all other Microsporum species exceeded 4% base pairs. Based on β-tubulin phylogeny, the isolated species is a sister to M. gypseum. The species produces abundant chlamydospores and clumps of hyphae similar to those of ascomatal primordia but no conidia and ascospores. The species was unable to grow at 37°C and does not grow on T6 basal medium, which is unlike other Microsporum species; hair perforation and urease tests were positive. The addition of histidine to the T6 medium resulted in rapid growth of the fungus. The phylogenetic evidence, morphology, growth parameters, and physiology justified the proposal that the isolate is a new species, M. aenigmaticum, sp. nov.
- MeSH
- fylogeneze MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mezerníky ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- Microsporum klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- shluková analýza MeSH
- tinea diagnóza mikrobiologie MeSH
- tubulin genetika MeSH
- zápěstí mikrobiologie patologie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- infekce etiologie patofyziologie MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum klasifikace patogenita MeSH
- savci MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
