Inflammatory leiomyosarcoma (ILMS) is a very rare soft tissue tumor that usually follows an indolent clinical course, but long-term follow-up studies are lacking. Recent publications primarily focused on its genetic profile characterized by a near haploid genome. One study also showed these tumors to have upregulation of genes known to be crucial for skeletal muscle differentiation. Nevertheless, immunohistochemical expression of skeletal muscle markers, as well as markers that would help to distinguish ILMS from a long list of relevant differential diagnostic entities, has not been extensively studied. Nine cases of ILMS were collected and stained by a broad IHC panel which, besides others, contained MyoD1, myogenin, and PAX-7. A subset of cases was also analyzed by 2 different NGS assays and by MDM2 fluorescence in situ hybridization. Five male and 4 female patients ranged in age from 25 to 54 years (mean, 36 years). The tumors showed a predilection for intramuscular sites of the lower limbs (n = 4) and back (n = 2), whereas the remaining 3 cases affected an unspecified skeletal muscle, lung, and omentum. Follow-up with an average length of 10.6 years (range 0.5-22) was available for 8 patients. The omental tumor spread locally within the abdominal cavity, but the patient has been free of disease 7 years after treatment. None of the 5 patients with somatic soft tissue tumors (and follow-up longer than 1.5 years) had either recurrence or metastasis. Immunohistochemical studies revealed a substantial expression of skeletal muscle markers in almost all cases. This phenotype coupled with a highly characteristic genotype and significantly more indolent clinical behavior as compared with conventional leiomyosarcoma of deep soft tissue offers a strong rationale to change the current nomenclature. Based on the clinicopathological features and gene expression profile, we propose the name low-grade inflammatory myogenic tumor.
- MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- dospělí MeSH
- fenotyp MeSH
- imunoenzymatické techniky metody MeSH
- kosterní svaly metabolismus patologie MeSH
- leiomyosarkom metabolismus MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- lokální recidiva nádoru patologie MeSH
- nádorové biomarkery metabolismus MeSH
- nádory měkkých tkání patologie MeSH
- zánět metabolismus MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Cíl studie: Ověřit diagnostickou senzitivitu a specificitu nové chemiluminiscenční metody (CLIA) pro stanovení protilátek proti myeloperoxidáze (anti-MPO) a proteináze 3 (anti-PR3). Porovnat tuto metodu se standardně využívanými metodami enzymové imunoanalýzy (ELISA). Vyhodnotit vzájemnou shodu porovnávaných metod s metodou nepřímé fluorescence (NIF) a posoudit využití metody CLIA jako skríningové metody pro pacienty s diagnózou s protilátkami proti cytoplazmě neutrofilů (ANCA) asociované vaskulitidy (AAV). Typ studie: retrospektivní. Materiál a metody: Ve skupině 101 pacientů s diagnózou ANCA asociované vaskulitidy s postižením ledvin jsme stanovovali protilátky proti myeloperoxidáze a proteináze 3 chemiluminiscenční metodou, ELISA metodami dvou výrobců a metodou nepřímé imunofluorescence. Výsledky: Diagnostickou senzitivitu, resp. specificitu metody CLIA jsme pro anti-MPO stanovili jako 91,7 %, resp. 100 % a pro anti-PR3 jako 96,2 %, resp. 100 %. Vzájemná kvantitativní shoda mezi jednotlivými metodami nebyla pro celý měřící rozsah metod prokázána, při vyšších hodnotách koncentrací narůstá kvantitativní odchylka mezi metodami ve prospěch CLIA, a to především v případě stanovení anti-MPO. V kvalitativním porovnání s metodou NIF byla nejvyšší celková shoda prokázána mezi metodami NIF a CLIA, pro anti-MPO 91,9 %, pro anti-PR3 90,6 %. Kohenovou kappa analýzou byla uspokojivá míra shody nalezena pouze mezi metodami NIF a CLIA (kappa = 0,455 pro anti-MPO a kappa = 0,410 pro anti-PR3). Závěr: Ověřili jsme výrobcem udávanou senzitivitu a specificitu nové chemiluminiscenční metody, výsledky pro námi definovanou skupinu jsou aplikovatelné dle doporučení výrobce. Pro náš definovaný soubor ANCA pozitivních AAV pacientů jsme prokázali vyšší diagnostickou senzitivitu pro metodu CLIA oproti běžně používaným ELISA metodám v případě obou sledovaných protilátek. Hodnoty diagnostické specificity byly shodně 100 %. Dále jsme prokázali dobrou kvalitativní shodu mezi metodami CLIA a NIF pro oba typy stanovovaných protilátek. Studií jsme ověřili vhodnost metody CLIA pro využití při skríningovém vyšetření protilátek proti antigenům cytoplazmy neutrofilů a její vhodnost pro zařazení do běžného rutinního laboratorního algoritmu jejich vyšetřování. Velkou výhodou metody CLIA je výrazně kratší doba odezvy a přístup stanovení „po pacientech“, což metodu činí použitelnou pro statimový režim.
Objective: To verify diagnostic sensitivity and specificity of the novel chemiluminescence method for the detection of the autoantibodies against myeloperoxidase (anti-MPO) and proteinase 3 (anti-PR3). To compare this method with commonly used enzyme linked immunoassays (ELISA) and evaluate the mutual agreement of the methods with indirect immunofluorescence method (IIF). To assess the utility of chemiluminescent immunoassay (CLIA) as a screening test for ANCA associated vasculitis (AAV) patients. Design: retrospective Materials and Methods: Sera of 101 patients with AAV with kidney involvement were tested for presence of anti-MPO and anti-PR3 by three detection systems – CLIA, 1st generation ELISA of two producers and by IIF for presence of ANCA. Results: Diagnostic sensitivity and specificity of the CLIA for anti-MPO was 91.7 % and 100 %, for anti-PR3 it was 96.2 % and 100 %, respectively. Our study didn’t show mutual quantitative agreement between methods for their whole measurement range, the quantitative difference between methods is increasing in favour of CLIA with the increasing concentration of the antibodies. Highest total qualitative agreement was found between IIF and CLIA, for both observed autoantibodies, anti-MPO (91.9 %) and anti-PR3 (90.6 %). The moderate strength of agreement was found only between CLIA and IIF (kappa = 0.455 for anti-MPO and kappa = 0.410 for anti-PR3) by Cohen kappa analysis. Conclusion: We have verified the sensitivity and specificity values of the novel chemiluminescence method and the results obtained in our group of patients were applicable in agreement with manufacturer’s data. We have demonstrated higher diagnostic sensitivity for CLIA compared to common used ELISAs for both observed autoantibodies. We have also demonstrated acceptable strength of qualitative agreement between CLIA and IIF. The suitability of the CLIA for the ANCA screening and for the routine laboratory ANCA testing was proven. The great advantage of CLIA compared to ELISA is much shorter time of testing and the random access, which all make CLIA suitable for the testing in statim mode.
- Klíčová slova
- chemoluminscence,
- MeSH
- ANCA-asociované vaskulitidy * diagnóza krev MeSH
- ELISA metody MeSH
- imunoanalýza metody MeSH
- imunoenzymatické techniky metody MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- luminiscence MeSH
- peroxidasa MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- protilátky analýza krev MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Klíčová slova
- histaminová intolerance, histamin-degradační aktivita,
- MeSH
- afinita protilátek MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- feces enzymologie MeSH
- histamin * fyziologie imunologie krev MeSH
- histaminasa * krev MeSH
- imunoenzymatické techniky metody MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- potravinová alergie * diagnóza imunologie krev MeSH
- radioimunoanalýza MeSH
- reagenční diagnostické soupravy MeSH
- senioři MeSH
- uvolňování histaminu MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
BACKGROUND: Fourth-generation HIV assays detect both antigen and antibody, facilitating detection of acute/early HIV infection. The Bio-Rad GS HIV Combo Ag/Ab assay (Bio-Rad Combo) is an enzyme immunoassay that simultaneously detects HIV p24 antigen and antibodies to HIV-1 and HIV-2 in serum or plasma. OBJECTIVE: To evaluate the performance of the Bio-Rad Combo assay for detection of HIV infection in adults from Southern Africa. STUDY DESIGN: Samples were obtained from adults in Soweto and Vulindlela, South Africa and Dar es Salaam, Tanzania (300 HIV-positive samples; 300 HIV-negative samples; 12 samples from individuals previously classified as having acute/early HIV infection). The samples were tested with the Bio-Rad Combo assay. Additional testing was performed to characterize the 12 acute/early samples. RESULTS: All 300 HIV-positive samples were reactive using the Bio-Rad Combo assay; false positive test results were obtained for 10 (3.3%) of the HIV-negative samples (sensitivity: 100%, 95% confidence interval [CI]: 98.8-100%); specificity: 96.7%, 95% CI: 94.0-98.4%). The assay detected 10 of the 12 infections classified as acute/early. The two infections that were not detected had viral loads<400 copies/mL; one of those samples contained antiretroviral drugs consistent with antiretroviral therapy. CONCLUSIONS: The Bio-Rad Combo assay correctly classified the majority of study specimens. The specificity reported here may be higher than that seen in other settings, since HIV-negative samples were pre-screened using a different fourth-generation test. The assay also had high sensitivity for detection of acute/early infection. False-negative test results may be obtained in individuals who are virally suppressed.
- MeSH
- HIV antigeny * imunologie MeSH
- HIV infekce diagnóza imunologie virologie MeSH
- HIV korový protein p24 imunologie MeSH
- HIV protilátky * imunologie MeSH
- HIV-1 imunologie MeSH
- HIV-2 imunologie MeSH
- HIV imunologie MeSH
- imunoenzymatické techniky * metody normy MeSH
- lidé MeSH
- reagenční diagnostické soupravy * normy MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Research Support, N.I.H., Extramural MeSH
- Geografické názvy
- jižní Afrika MeSH
Cíl práce: Posouzení dostupnosti a laboratorní diagnostiky infekcí vyvolaných C. difficile v České republice (ČR) včetně spektra používaných testů, jejich využití v kombinacích a odpovídající interpretace modelových nálezů. Materiál a metodika: Data byla získána na základě vyplnění webového dotazníku zástupci 61 státních i soukromých mikrobiologických laboratoří. Dotazník byl zaměřen na používané diagnostické soupravy a kultivační média v rámci diagnostiky CDI (C. difficile infection). Dále byla požadována interpretace laboratorního nálezu GDH (glutamátdehydrogenáza) pozitivní, toxin A/B negativní bez konfirmace nebo s konfirmací podle možnosti laboratoře. Výsledky: V ČR je nejčastěji v prvním diagnostickém kroku u CDI používán test C. diff Quik Chek Complete? (Alere) pro průkaz GDH a toxinů A/B, jak uvedlo 50 laboratoří (82 %). Anaerobní kultivaci provádí 43 laboratoří (70,5 %), z toho 21 laboratoří (48,8 %) používá selektivní agar (Oxoid). Možnost přímého průkazu DNA toxigenních C. difficile má k dispozici 17 laboratoří (27,9 %) a většina z nich (15 laboratoří) používá uzavřený systém Xpert? C. difficile (Cepheid). Diagnostiku založenou pouze na průkazu GDH a toxinů A/B uvedlo 13 laboratoří (21,3 %). Dvě laboratoře (3,3 %) prokazují jen toxiny A/B a tři laboratoře (4,9 %) průkaz toxinů A/B doplňují anaerobní kultivací. Třístupňové schéma: průkaz GDH a toxinů A/B doplněné o anaerobní kultivaci provádí 26 laboratoří (42,6 %). Průkaz GDH, toxinů A/B a PCR nabízejí tři laboratoře (4,9 %). Kompletní diagnostické schéma CDI (průkaz GDH, toxinů, přímý průkaz DNA anaerobní kultivaci) má k dispozici 14 laboratoří (23 %). Závěr: V naší dotazníkové studii jsme identifikovali 24 různých testovacích algoritmů používaných v době studie (duben až červenec 2014) v ČR. Pět laboratoří (8,2 %) nemá ve svém testovacím algoritmu zahrnut citlivý screeningový test, jako je průkaz GDH nebo NAAT (Nucleic Acid Amplification Test). Třináct laboratoří (21,3 %) stanovuje GDH a toxiny a v případě izolované pozitivity jednoho testu nemá k dispozici konfirmační metodu. U GDH pozitivních a toxin A/B negativních vzorků by každý výsledek měl být opatřen doplňujícím komentářem o dalších možnostech laboratorního průkazu CDI a o uváděné senzitivitě použitého testu. V případě, že není možnost konfirmace dalším testem, by po vyloučení jiné příčiny průjmu, měl být výsledek hodnocen jako epidemiologicky i klinicky významný.
Objective: To assess the availability of the laboratory diagnosis of infections caused by C. difficile in the Czech Republic (CR), including the range of tests used, possible combinations, and adequate interpretation of model results. Material and methods: Data were collected through a web questionnaire survey with the participation of representatives of 61 public and private microbiological laboratories. The questionnaire addressed the use of diagnostic test kits and culture media in the diagnosis of C. difficile infection (CDI). In addition, the respondents were asked to interpret a glutamate dehydrogenase (GDH) positive and, at the same time, toxin A/B negative result, without or with laboratory confirmation if available. Results: In the CR, the most commonly used test in the diagnosis of CDI is the C. DIFF Quik Chek Complete? test (Alere) for the detection of GDH and A/B toxins, as reported by 50 (82 %) laboratories. Anaerobic culture is performed by 43 (70.5 %) laboratories, 21 (48.8 %) of which use selective agar (Oxoid). Direct detection of DNA of toxigenic C. difficile is feasible in 17 (27.9 %) laboratories, with most of them (15 laboratories) using the closed system Xpert? C. difficile (Cepheid). The diagnosis based only on the detection of GDH and A/B toxins is used by 13 (21.3 %) laboratories. Two (3.3 %) laboratories detect A/B toxins alone and three (4.9 %) laboratories carry out the detection of A/B toxins followed by anaerobic culture. A three step scheme: detection of GDH and A/B toxins with subsequent anaerobic culture is used by 26 (42.6 %) laboratories. The detection of GDH and A/B toxins along with a PCR assay are provided by three (4.9 %) laboratories. A complete diagnostic scheme for CDI (detection of GDH and A/B toxins, direct detection of DNA, and aerobic culture) is feasible in 14 (23 %) laboratories. Conclusion: This questionnaire survey study identified 24 different testing algorithms to be in use within the study period (April to July 2014) in the CR. Five (8.2 %) laboratories have no highly sensitive screening test such as the detection of GDH or nucleic acid amplification test (NAAT) included in their testing algorithm. Thirteen (21.3 %) laboratories perform the detection of GDH and A/B toxins but have no confirmation method to be used if only one test turns out positive. In the case of GDH positivity and A/B toxin negativity, the result should be provided with a supplementary comment on further possibilities for the laboratory detection of CDI and the claimed sensitivity of the test used. If no confirmation test is available, the result should be considered as epidemiolo-gically and clinically significant, once other possible causes of diarrhoea are ruled out.
- Klíčová slova
- testovací algoritmus, toxiny A/B,
- MeSH
- algoritmy MeSH
- bakteriální toxiny izolace a purifikace toxicita MeSH
- Clostridioides difficile * enzymologie izolace a purifikace MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- glutamátdehydrogenasa analýza MeSH
- imunoenzymatické techniky metody MeSH
- klinické laboratorní techniky * metody statistika a číselné údaje využití MeSH
- klostridiové infekce * diagnóza mikrobiologie MeSH
- kultivační média MeSH
- laboratoře MeSH
- lidé MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- reagenční diagnostické soupravy využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- hodnotící studie MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Vyšetření mozkomíšního moku je základní vyšetřovací metodou v neurologii používanou k diferenciální diagnostice řady zánětlivých, autoimunitních či neurodegenerativních onemocnění CNS. V důsledku nutnosti minimalizace diagnostických chyb byl vytvořen panel laboratorních likvorových vyšetření nezbytných k diagnostice a diferenciální diagnostice roztroušené sklerózy. Patří k nim kvantitativní a kvalitativní cytologie, základní biochemické vyšetření, posouzení stavu hematolikvorové bariéry, vyšetření intratekální syntézy IgG a stanovení počtu oligoklonálních IgG pásů.
An examination of the cerebrospinal fluid (CSF) is the essential examination method used in neurology, used for differential diagnostics of a number of inflammatory, auto-immune or neurodegenerative diseases of the CNS. Due to the necessity of minimising diagnostic errors, a panel of laboratory examinations of the CSF was developed, essential for diagnosis and differential diagnostics of multiple sclerosis. Among those are quantitative and qualitative cytology, basic biochemical examinations, examination of the condition of the blood-CSF barrier, examination of intrathecal IgG synthesis and determination of the number of oligoclonal IgG bands.
- MeSH
- biologické markery MeSH
- hematoencefalická bariéra chemie MeSH
- imunoenzymatické techniky metody MeSH
- imunoglobulin G biosyntéza MeSH
- lidé MeSH
- mozkomíšní mok cytologie chemie imunologie MeSH
- oligoklonální proužky biosyntéza diagnostické užití MeSH
- protilátky virové biosyntéza diagnostické užití MeSH
- roztroušená skleróza * MeSH
- virus spalniček imunologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Cíl práce: Porovnání senzitivity a specificity dvou komerčních testů na stanovení Clostridium difficile GDH (glutamát dehydrogenázy) a toxinů A/B. Materiál a metodiky: Bylo testováno 86 stolic pacientů hospitalizovaných ve FN Motol. GDH a toxiny A/B byly paralelně vyšetřovány dvěma testy: C. difficile Quik Chek Complete?, Techlab,USA) a Liaison? C. difficile GDH a Toxins AαB (DiaSorin USA). Současně byly ze stolic izolovány nukleové kyseliny pomocí UltraClean? Fecal DNA (MoBio Laboratories, USA). Pro metodu PCR byla použita komerční souprava C. difficile Elite MGB? kit (Nanogen, Itálie). Anaerobní kultivace na selektivním médiu pro C. difficile (Oxoid) proběhla u všech vzorků vykazující pozitivitu alespoň jednoho testu. Čisté izoláty byly molekulárně analyzovány ribotypizací. Výsledky: GDH a toxin A/B negativních oběma metodami bylo 36 vzorků (42 %). GDH a toxin pozitivních oběma metodami bylo 20 vzorků (23 %). GDH pozitivních a toxin negativních oběma metodami, ale PCR pozitivních bylo 9 vzorků (10 %). GDH pozitivních a toxin negativních oběma metodami a PCR negativních bylo 11 vzorků (13 %). GDH pozitivní, toxin pozitivní pouze testem Liaison? bylo 6 vzorků (7 %). GDH pozitivní pouze Liaison? byly 4 vzorky (5 %). K selhání kultivace došlo u 11 vzorků (13), z toho u 7 vzorků byl pozitivní test PCR. PCR reakce byla inhibována v 5 případech (6 %). Zachycené ribotypy toxigenní: AI-3, 001, 002, 012,014, 017, 020, 049, 054, 078, 176, 203, 413 a netoxigenní: AI-34, AI-61, 010, 485, 495, 596. Závěr: Stanovení toxinu A/B testem Liaison? vykazuje u námi vyšetřeného souboru o 7 % vyšší senzitivitu. Dvoukrokové uspořádání testů také přináší ekonomickou úsporu, která může být využita např. k zavedení PCR metod do diagnostického algoritmu laboratoře.
Study objective: Comparison of two commercially available tests for the detection of Clostridium difficile Glutamate Dehydrogenase (GDH) and toxins A and B for their sensitivity and specificity. Material and methods: Eighty-six stool samples from patients hospitalised in the Motol University Hospital were analysed. GDH and toxins A and B were assayed in parallel by two tests: C. difficile Quik Chek Complete? (Techlab, USA) and Liaison? C. difficile GDH and Toxins AαB (DiaSorin, USA). From the stool samples, nucleic acids were also isolated using the UltraClean? Fecal DNA kit (MoBio Laboratories, USA). The commercially available C. difficile Elite MGB? kit (Nanogen, Italy) was used for the polymerase chain reaction (PCR). Anaerobic culture on C. difficile selective medium (Oxoid) was performed for all positive samples at least in one test. Pure isolates were characterized by PCR ribotyping. Results: Thirty-six (42%) samples were GDH negative and toxin A/B negative by both tests. Twenty (23%) samples were GDH positive and toxin A/B positive by both tests. Nine (10%) samples were GDH positive and toxin negative by both tests, but were positive by PCR. Eleven (13%) samples that were GDH positive and toxin negative by both tests remained negative by PCR. Six (7%) samples only were GDH positive and toxin positive by the Liaison? test alone. Four (5%) samples were GDH-positive by theLiaison? test alone. Culture failure was observed in 11 (13%) samples, of which seven were positive by PCR. PCR was inhibited in five (6%) samples. The following toxigenic ribotypes: AI-3, 001, 002, 012,014, 017, 020, 049, 054, 078, 176, 203, and 413 and non-toxigenic ribotypes: AI-34, AI-61, 010, 485, 495, and 596 were identified. Conclusion: The Liaison? test had seven percent higher sensitivity for the detection of toxins A/B. The two-step protocol of the tests is also cost-saving. The savings can be used e.g. for incorporating the PCR techniques into the diagnostic algorithm of the laboratory.
- MeSH
- antigeny bakteriální analýza MeSH
- Clostridioides difficile * enzymologie chemie izolace a purifikace MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- glutamátdehydrogenasa imunologie MeSH
- imunoenzymatické techniky metody využití MeSH
- klostridiové infekce * diagnóza genetika mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
The review focuses on the latest development of the title method. Compared with conventional instrumental techniques the method is simple and fast. It can be used for qualitative and/or semiquatitative detection and should be applied in non-laboratory environment. The principles of current formats, different markers, such as gold, carbon, and latex nanoparticles as well as possible quantitative monitoring are described. The applications generally include tests for low- or high-molecular-weight compounds, such as pesticides, drugs, mycotoxins, hormones, allergens, pathogens and metabolites in food or feed, as well as veterinary, biomedical and environmental purposes.
- MeSH
- alergeny analýza MeSH
- automatizované zpracování dat MeSH
- bakteriální toxiny analýza MeSH
- chemické techniky analytické metody přístrojové vybavení využití MeSH
- imunoanalýza * metody přístrojové vybavení využití MeSH
- imunochemie * metody přístrojové vybavení MeSH
- imunoenzymatické techniky metody přístrojové vybavení využití MeSH
- metody pro přípravu analytických vzorků MeSH
- nanočástice * MeSH
- pesticidy analýza MeSH
- radioimunoprecipitační analýza metody přístrojové vybavení využití MeSH
- soudní toxikologie metody MeSH
- uhlík MeSH
- zlato MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
