Dědičné neutropenie (DN) patří mezi geneticky podmíněná onemocnění, která mohou být diagnostikována i v dospělém věku. DN se v dospělosti manifestuje spíše lehkými formami neutropenie a cytopenie. Případné další klinické příznaky bývají mírnější ve srovnání s DN diagnostikovanými u dětí. Molekulárně genetickou analýzou, zejména exomovým sekvenováním, bylo v různých genech identifikováno mnoho patogenních mutací zodpovídajících za fenotyp DN. Mutace některých těchto genů zároveň pacienty predisponuje ke zvýšenému riziku rozvoje myelodysplastického syndromu či akutní myeloidní leukemie. Správná strategie sledování pacientů, genetické poradenství a stanovení optimálního postupu léčby mohou poté významně ovlivnit prognózu tohoto onemocnění.
Congenital neutropenias (CNs) are a group of genetic disorders that may even be diagnosed in adulthood. In such cases, they manifest most often as mild neutropenia and cytopenia and other clinical symptoms tend to be less pronounced compared to CN diagnosed in childhood. Several gene variants responsible for the CN phenotype have been identified by molecular genetic approaches, especially by exome sequencing. Mutations of some of these genes also increase the risk of patients developing myelodysplastic syndrome or acute myeloid leukaemia. Proper patient monitoring strategies, genetic counselling and optimal treatment protocols can substantially affect the prognosis of these disorders.
- Klíčová slova
- varianty genů,
- MeSH
- genetické nemoci vrozené MeSH
- lidé MeSH
- neutropenie * genetika MeSH
- sekvenování exomu MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Mutations in the Sterile alpha motif domain containing 9 (SAMD9) gene have been described in patients with severe multisystem disorder, MIRAGE syndrome, but also in patients with bone marrow (BM) failure in the absence of other systemic symptoms. The role of hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) in the management of the disease is still unclear. Here, we present a patient with a novel mutation in SAMD9 (c.2471 G>A, p.R824Q), manifesting with prominent gastrointestinal tract involvement and immunodeficiency, but without any sign of adrenal insufficiency typical for MIRAGE syndrome. He suffered from severe CMV (cytomegalovirus) infection at 3 months of age, with a delayed development of T lymphocyte functional response against CMV, profound T cell activation, significantly reduced B lymphocyte counts and impaired lymphocyte proliferative response. Cultured T cells displayed slightly lower calcium flux and decreased survival. At the age of 6 months, he developed severe neutropenia requiring G-CSF administration, and despite only mild morphological and immunophenotypical disturbances in the BM, 78% of the BM cells showed monosomy 7 at the age of 18 months. Surprisingly, T cell proliferation after CD3 stimulation and apoptosis of the cells normalized during the follow-up, possibly reflecting the gradual development of monosomy 7. Among other prominent symptoms, he had difficulty swallowing, requiring percutaneous endoscopic gastrostomy (PEG), frequent gastrointestinal infections, and perianal erosions. He suffered from repeated infections and periodic recurring fevers with the elevation of inflammatory markers. At 26 months of age, he underwent HSCT that significantly improved hematological and immunological laboratory parameters. Nevertheless, he continued to suffer from other conditions, and subsequently, he died at day 440 post-transplant due to sepsis. Pathogenicity of this novel SAMD9 mutation was confirmed experimentally. Expression of mutant SAMD9 caused a significant decrease in proliferation and increase in cell death of the transfected cells. Conclusion: We describe a novel SAMD9 mutation in a patient with prominent gastrointestinal and immunological symptoms but without adrenal hypoplasia. Thus, SAMD9 mutations should be considered as cause of enteropathy in pediatric patients. The insufficient therapeutic outcome of transplantation further questions the role of HSCT in the management of patients with SAMD9 mutations and multisystem involvement.
- MeSH
- cytomegalovirové infekce genetika imunologie MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- neutropenie genetika MeSH
- předškolní dítě MeSH
- protein Smad8 genetika MeSH
- syndromy imunologické nedostatečnosti genetika MeSH
- Check Tag
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Syndromy selhání kostní dřeně představují heterogenní skupinu onemocnění, která jsou charakterizovaná selháním kostní dřeně s cytopenií v periferní krvi, vrozenými anomáliemi orgánů a zvýšeným rizikem vzniku maligního onemocnění. Stupeň postižení kostní dřeně se může projevit různými změnami v krevním obraze od izolované cytopenie přes bicytopenii k těžké pancytopenii. Příčinou onemocnění jsou mutace genů kódujících proteiny, které se účastní důležitých buněčných pochodů: reparace poškozené DNA, biogeneze ribozomů, udržování délky telomer a regulace buněčného cyklu. Díky rozvoji metod molekulární biologie, především celogenomového sekvenování, byla v průběhu posledních 10 let odhalena řada vyvolávajících genetických defektů, což kromě pochopení patogeneze jednotlivých nemocí významně přispělo k lepšímu pochopení regulace hematopoezy i patofyziologie maligních onemocnění. Nové poznatky se staly základem definice nových skupin onemocnění, jako jsou ribozomopatie nebo telomeropatie. Odhalení genetického defektu jednotlivých nemocí je velmi důležité pro správnou strategii péče o pacienty a genetické poradenství. Cílem práce je shrnout přehled současných poznatků o této skupině onemocnění.
Inherited bone marrow failure syndromes are a heterogeneous group of diseases characterised by bone marrow failure with cytopenia in peripheral blood, associated somatic anomalies and increased tendency to malignancies. The degree of bone marrow damage can lead to various blood count changes from isolated cytopenia to bicytopenia or severe pancytopenia. The diseases in this group are caused by mutations in genes coding for proteins involved in important cellular processes such as DNA repair, ribosomal biogenesis, telomere maintenance and cell cycle regulation. Rapid development of new molecular-genetic techniques, especially next-generation sequencing, have led to the elucidation of several causative genetic defects. Besides the understanding of the pathogenesis of the different diseases, these new discoveries have significantly contributed to a better understanding of haematopoiesis regulation as well as the pathophysiology of malignancies. The new pieces of knowledge have enabled to create new disease groups such as ribosomopathies or telomeropathies. Revealing the genetic defect in individual diseases is extremely important for appropriate approach to treatment strategies and genetic counselling. The aim of the paper is to present the overview of current knowledge about this group of diseases.
- Klíčová slova
- reparace DNA, biogeneze ribozomů, ribozomopatie, syndrom hypoplastických chrupavek a vlasů, McKusickův typ metafyzální chondrodysplazie, těžká vrozená neutropenie, retikulární dysgeneze, TAR syndrom, amegakaryocytární trombocytopenie, Pearsonův syndrom, telomeropatie,
- MeSH
- Diamondova-Blackfanova anemie diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- dyskeratosis congenita diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- exokrinní pankreatická insuficience diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- Fanconiho anemie diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- genetické nemoci vrozené * diagnóza patofyziologie terapie MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nemoci chrupavky diagnóza genetika patofyziologie MeSH
- nemoci kostní dřeně * diagnóza genetika patofyziologie terapie vrozené MeSH
- neutropenie diagnóza genetika patofyziologie terapie vrozené MeSH
- pancytopenie diagnóza genetika vrozené MeSH
- ribozomy genetika MeSH
- Shwachmanův-Diamondův syndrom MeSH
- syndrom MeSH
- syndromy imunologické nedostatečnosti diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- telomery genetika MeSH
- transplantace kmenových buněk MeSH
- trombocytopenie diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- vzácné nemoci diagnóza genetika patofyziologie terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Autosomal-dominant tubulo-interstitial kidney disease (ADTKD) encompasses a group of disorders characterized by renal tubular and interstitial abnormalities, leading to slow progressive loss of kidney function requiring dialysis and kidney transplantation. Mutations in UMOD, MUC1, and REN are responsible for many, but not all, cases of ADTKD. We report on two families with ADTKD and congenital anemia accompanied by either intrauterine growth retardation or neutropenia. Ultrasound and kidney biopsy revealed small dysplastic kidneys with cysts and tubular atrophy with secondary glomerular sclerosis, respectively. Exclusion of known ADTKD genes coupled with linkage analysis, whole-exome sequencing, and targeted re-sequencing identified heterozygous missense variants in SEC61A1-c.553A>G (p.Thr185Ala) and c.200T>G (p.Val67Gly)-both affecting functionally important and conserved residues in SEC61. Both transiently expressed SEC6A1A variants are delocalized to the Golgi, a finding confirmed in a renal biopsy from an affected individual. Suppression or CRISPR-mediated deletions of sec61al2 in zebrafish embryos induced convolution defects of the pronephric tubules but not the pronephric ducts, consistent with the tubular atrophy observed in the affected individuals. Human mRNA encoding either of the two pathogenic alleles failed to rescue this phenotype as opposed to a complete rescue by human wild-type mRNA. Taken together, these findings provide a mechanism by which mutations in SEC61A1 lead to an autosomal-dominant syndromic form of progressive chronic kidney disease. We highlight protein translocation defects across the endoplasmic reticulum membrane, the principal role of the SEC61 complex, as a contributory pathogenic mechanism for ADTKD.
- MeSH
- alely MeSH
- anemie genetika MeSH
- biopsie MeSH
- chronická nemoc MeSH
- dánio pruhované embryologie genetika MeSH
- dítě MeSH
- dominantní geny MeSH
- dospělí MeSH
- endoplazmatické retikulum metabolismus MeSH
- exom genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- Golgiho aparát metabolismus MeSH
- heterozygot * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- messenger RNA analýza genetika MeSH
- missense mutace genetika MeSH
- mladý dospělý MeSH
- molekulární modely MeSH
- mutace * MeSH
- nemoci ledvin genetika patologie MeSH
- neutropenie genetika MeSH
- novorozenec MeSH
- progrese nemoci MeSH
- rodokmen MeSH
- růstová retardace plodu genetika MeSH
- sekvence aminokyselin MeSH
- senioři MeSH
- syndrom MeSH
- translokační kanály SEC chemie genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- novorozenec MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
Ganciclovir (GCV) is the cornerstone of cytomegalovirus prevention and treatment in transplant patients. It is associated with problematic adverse hematological effects in this population of immunosuppressed patients, which may lead to dose reduction thus favoring resistance. GCV crosses the membranes of cells, is activated by phosphorylation, and then stops the replication of viral DNA. Its intracellular accumulation might favor host DNA polymerase inhibition, hence toxicity. Following this hypothesis, we investigated the association between a selected panel of membrane transporter polymorphisms and the evolution of neutrophil counts in n=174 renal transplant recipients. An independent population of n=96 renal transplants served as a replication and experiments using HEK293T-transfected cells were performed to validate the clinical findings. In both cohorts, we found a variant in ABCC4 (rs11568658) associated with decreased neutrophil counts following valganciclovir (GCV prodrug) administration (exploratory cohort: β±SD=-0.68±0.28, p=0.029; replication cohort: β±SD=-0.84±0.29, p=0.0078). MRP4-expressing cells showed decreased GCV accumulation as compared to negative control cells (transfected with an empty vector) (-61%; p<0.0001). The efflux process was almost abolished in cells expressing MRP4 rs11568658 variant protein. Molecular dynamic simulations of GCV membrane crossing showed a preferred location of the drug just beneath the polar head group region, which supports its interaction with efflux transporters.
- MeSH
- antivirové látky * škodlivé účinky farmakokinetika terapeutické užití MeSH
- cytomegalovirové infekce prevence a kontrola MeSH
- dospělí MeSH
- ganciklovir * škodlivé účinky farmakokinetika MeSH
- HEK293 buňky MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus MeSH
- Jurkat buňky MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- neutropenie chemicky indukované genetika metabolismus MeSH
- proteiny spojené s mnohočetnou rezistencí k lékům genetika metabolismus MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- transplantace ledvin MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Syndromy selhání kostní dřeně představují heterogenní skupinu onemocnění, která jsou charakterizovaná selháním kostní dřeně s cytopenií v periferní krvi, vrozenými anomáliemi orgánů a zvýšeným rizikem vzniku maligního onemocnění. Díky rozvoji metod molekulární biologie, především celogenomového sekvenování, se v posledních letech u pacientů s tímto onemocněním podařilo odhalit řadu vyvolávajících genetických defektů. Byly popsány kauzální mutace genů kódujících proteiny, které se účastní důležitých buněčných pochodů: reparace poškozené DNA, biogeneze ribozomů, udržování délky telomer a regulace buněčného cyklu. Tyto nálezy významně přispěly k lepšímu pochopení regulace hematopoézy i patofyziologie maligních onemocnění. Znalost genetického defektu je velmi důležitá pro správnou strategii sledování pacientů, genetického poradeství a stanovení optimálního léčebného postupu, který může významně ovlivnit prognózu těchto onemocnění.
Inherited bone marrow failure syndromes are a heterogenous group of diseases characterised by a bone marrow failure with cytopenia in peripheral blood, associated somatic anomalies and increased tendency to malignancies. Rapid development of new molecular-genetic techniques, especially next generation sequencing, led to the elucidation of several causative genetic defects. Mutations in genes coding for proteins involved in important cellular processes such as DNA damage, ribosomal biogenesis, telomere maintenance and cell cycle acivation have been found. These new discoveries led to better understanding of the many aspects of hematopoisis regulation and tumour biology. Deeper knowledge of these diseases is extremely important for appropriate approach to follow up, genetic counselling and treatment strategy, which can substantialy influence the prognosis do these diseases.
- Klíčová slova
- Pearsonův syndrom, amegakaryocytární trombocytopenie, Swachmanův-Diamondův syndrom, retikulární dysgeneze, syndrom hypoplastických chrupavek a vlasů, TAR syndrom,
- MeSH
- acyl-CoA-dehydrogenasa s dlouhým řetězcem nedostatek MeSH
- Diamondova-Blackfanova anemie diagnóza epidemiologie farmakoterapie genetika terapie MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- dyskeratosis congenita diagnóza epidemiologie genetika terapie MeSH
- exokrinní pankreatická insuficience diagnóza epidemiologie etiologie genetika terapie vrozené MeSH
- Fanconiho anemie diagnóza epidemiologie genetika terapie MeSH
- genetické nemoci vrozené * diagnóza epidemiologie genetika terapie MeSH
- hematopoéza genetika MeSH
- Hirschsprungova nemoc diagnóza epidemiologie genetika patofyziologie terapie MeSH
- kojenec MeSH
- leukopenie diagnóza genetika MeSH
- lidé MeSH
- lipomatóza diagnóza epidemiologie etiologie genetika terapie MeSH
- mitochondriální nemoci diagnóza genetika vrozené MeSH
- nemoci kostní dřeně * diagnóza epidemiologie etiologie farmakoterapie genetika klasifikace terapie MeSH
- neutropenie diagnóza epidemiologie genetika terapie vrozené MeSH
- osteochondrodysplazie diagnóza epidemiologie genetika patofyziologie terapie vrozené MeSH
- pancytopenie diagnóza epidemiologie etiologie genetika terapie MeSH
- syndromy imunologické nedostatečnosti diagnóza epidemiologie genetika terapie MeSH
- trombocytopenie diagnóza epidemiologie genetika terapie vrozené MeSH
- vlasy, chlupy abnormality MeSH
- vrozené poruchy metabolismu tuků diagnóza genetika terapie MeSH
- vrozené vady diagnóza epidemiologie genetika MeSH
- vzácné nemoci diagnóza epidemiologie etiologie farmakoterapie genetika terapie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Cíl U populace japonských pacientů s malobuněčným karcinomem plic v extenzivním stadiu (extensive-stage small-cell lung cancer, E-SCLC) vedla léčba chemoterapií irinotecanem s cisplatinou (IP) v porovnání s režimem etoposid a cisplatina (EP) ke zlepšení přežití. Cílem naší rozsáhlé randomizované studie s identickým uspořádáním, jaké bylo použito u studie japonské, bylo ověřit výsledky získané u japonských pacientů na populaci nemocných s E-SCLC ze Severní Ameriky a případně ozřejmit potenciální roli populačně vázaných farmakogenomických faktorů na uvedené výsledky. Pacienti a metody Pacienti byli randomizováni do skupiny léčené chemoterapií IP (irinotecan 60 mg/m2 1., 8. a 15. den; cisplatina 60 mg/m2 1. den, každé 4 týdny) nebo EP (etoposid 100 mg/m2 1. až 3. den; cisplatina 80 mg/m2 1. den, každé tři týdny). U 169 pacientů byly před randomizací odebrány krevní vzorky na analýzu DNA. Výsledky Z celkového počtu 671 nemocných bylo vybráno 651 vhodných účastníků (324 pacientů v IP větvi a 327 nemocných v EP větvi). Míra léčebné odpovědi byla v IP větvi 60 % a v EP větvi 57 % (p = 0,56). Střední délka přežití bez známek progrese onemocnění byla v IP větvi 5,8 měsíce a ve větvi EP 5,2 měsíce (p = 0,07). Střední délka celkového přežití pak byla 9,9 měsíce v IP větvi a 9,1 měsíce v EP větvi (p = 0,71). Těžké formy průjmu se vyskytovaly častěji v IP větvi (19 % vs. 3 %); výskyt těžké neutropenie a trombocytopenie byl vyšší ve větvi EP (68 % vs. 33 % a 15 % vs. 4 %, v uvedeném pořadí). Farmakogenomická analýza ukázala, že gen ABCB1 (C3435T)T/T (membránový transport) byl asociován s výskytem průjmů v souvislosti s režimem IP; gen UGT1A1 (G-3156A) A/A (metabolismus léčiv) byl pak spojen s neutropenií související s režimem IP. Závěr Tato rozsáhlá severoamerická studie nebyla schopna potvrdit závěry dřívější japonské práce referující o delším přežití pacientů při terapii režimem IP. Oba chemoterapeutické režimy vykazovaly srovnatelnou účinnost, přičemž režim IP prokázal nižší hematologickou a vyšší gastrointestinální toxicitu. Tyto výsledky zdůrazňují potenciální význam farmakogenomických faktorů při interpretaci závěrů klinických studií zabývajících se onkologickou léčbou.
- MeSH
- cisplatina aplikace a dávkování škodlivé účinky MeSH
- dospělí MeSH
- etoposid aplikace a dávkování škodlivé účinky MeSH
- farmakogenetika MeSH
- glukuronosyltransferasa genetika MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus MeSH
- kamptothecin analogy a deriváty aplikace a dávkování škodlivé účinky MeSH
- Kaplanův-Meierův odhad MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- malobuněčný karcinom plic farmakoterapie genetika mortalita MeSH
- nádory plic farmakoterapie genetika mortalita MeSH
- neutropenie genetika chemicky indukované MeSH
- P-glykoprotein genetika MeSH
- protokoly antitumorózní kombinované chemoterapie terapeutické užití MeSH
- průjem genetika chemicky indukované MeSH
- rizikové faktory MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie epidemiologie genetika imunologie MeSH
- dítě MeSH
- genotyp MeSH
- hematologické nádory farmakoterapie MeSH
- lékařská onkologie metody trendy MeSH
- lektin vázající mannosu genetika imunologie izolace a purifikace MeSH
- lidé MeSH
- medicína založená na důkazech trendy MeSH
- molekulární epidemiologie metody statistika a číselné údaje MeSH
- neutropenie epidemiologie genetika imunologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody využití MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH