proteom Dotaz Zobrazit nápovědu
The proteome is the pool of proteins expressed at a given time and circumstance. The word 'proteomics' summarizes several technologies for visualization, quantitation and identification of these proteins. Recent advances in these techniques are helping to elucidate platelet processes which are relevant to bleeding and clotting disorders, transfusion medicine and regulation of angiogenesis. RECENT FINDINGS: Over 1100 platelet proteins have been identified using proteomic techniques. Various subproteomes have been characterized, including platelet releasates (the 'secretome'), alpha and dense granules, membrane and cytoskeletal proteins, platelet-derived microparticles, and the platelet 'phosphoproteome'. Proteomic data about platelets have become increasingly available in integrated databases. SUMMARY: Proteomic experiments in resting and activated platelets have identified novel signaling pathways and secreted proteins which may represent therapeutic targets, as well as potential cancer biomarkers.
- MeSH
- aktivace trombocytů MeSH
- lidé MeSH
- mikropartikule MeSH
- proteom analýza MeSH
- proteomika metody MeSH
- signální transdukce MeSH
- trombocyty chemie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cíl: Seminální plazma obsahuje proteiny, které jsou důležitými markery patologií reprodukčního ústrojí. Cílem práce je analyzovat rozdíly detekované v proteomu seminální plazmy mužů s azoospermií a dárců spermatu. Materiál a metodika: Vzorky seminální plazmy byly získány standardním postupem od mužů s azoospermií a dárců spermatu a zamrazeny v kapalném dusíku. Proteiny ve vzorcích byly solubilizovány lyzačním pufrem obsahujícím detergent CHAPS. Výsledné proteinové izoláty byly separovány dvourozměrnou gelovou elektroforézou (2-DE). V prvním rozměru byl pro izoelektrickou fokusaci použit imobilizovaný gradient pH 3?10 NL, pro dělení v druhém rozměru 12 % SDS-PAGE. Proteiny v gelu byly barveny fluorescenčním barvivem Sypro Ruby. Kvalitativní a kvantitativní rozdíly mezi jednotlivými vzorky byly vyhodnoceny pomocí programu PDQuest. Proteiny ve vybraných spotech vykazující rozdíly byly následně štěpeny trypsinem a identifikovány pomocí MALDI-MS/MS (resp. LC-MS/MS) a vyhodnocovacího programu Mascot. Výsledky: Vyšetření byla provedena na vzorcích od 6 dárců spermatu a 6 mužů s azoospermií. V proteomu dárců spermatu s normospermií byly nalezeny minimální rozdíly, mezi dárci spermatu a skupinou pacientů s azoospermií byly zjištěny četné kvalitativní a kvantitativní rozdíly. Na základě výsledků analýzy obrazu bylo pomocí hmotnostní spektrometrie identifikováno 18 kvalitativně odlišných proteinů. Závěr: Bylo nalezeno 18 kandidátních proteinů, které mohou být potenciálními biomarkery azoospermie. Komparativní proteomika je perspektivním nástrojem výzkumu poruch plodnosti a oxidačního stresu.
- Klíčová slova
- neplodnost,
- MeSH
- analýza spermatu metody MeSH
- azoospermie diagnóza MeSH
- biologické markery MeSH
- financování organizované MeSH
- hmotnostní spektrometrie využití MeSH
- krevní plazma MeSH
- lidé MeSH
- mužská infertilita diagnóza MeSH
- oxidační stres MeSH
- proteom analýza diagnostické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
1 svazek
- MeSH
- proteom MeSH
- proteomika MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- elektronické časopisy
xiv, 510 s. : il.
- Klíčová slova
- Proteom,
- MeSH
- klinické laboratorní techniky MeSH
- proteiny MeSH
- proteom MeSH
- proteomika MeSH
- Publikační typ
- příručky MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- biologie
Výrazný rozvoj analytické instrumentace a metodických přístupů během posledních dvou desetiletí významně rozšířil možnosti studia proteinů v živých systémech. Analýza tzv. proteomu poskytuje neustále se prohlubující náhled do biologických procesů na úrovni kvalitativních a kvantitativních změn proteinového složení v souvislosti s fyziologickými a patologickými stavy organizmu, čímž nabízí možnost jejich lepšího pochopení a stává se přínosem pro vývoj a validaci diagnostických a terapeutických přístupů. Proto se na studium lidského proteomu v současné době soustřeďuje i pozornost odborné veřejnosti v oblasti onkologie. V tomto článku jsou vysvětleny principy nejvyužívanějších proteomických metod (gelová elektroforéza, kapalinová chromatografie, hmotnostně spektrometrická analýza, čipové technologie) a uvedeny příklady jejich využití v oblasti onkologických, resp. hematoonkologických onemocnění.
The rapid development of analytical instrumentation and methodical approaches in the course of the last two decades has significantly extended the possibilities of studying proteins in living systems. Proteomic analysis provides ever deeper insights into the molecular nature of biological processes in terms of qualitative and quantitative changes in protein composition in connection with the physiological and pathological states of the organism. Thus, proteomic analysis contributes to a better understanding of these processes and becomes a tool for the development and validation of diagnostic and therapeutic approaches. Thanks to recent achievements, the attention of cancer specialists is more and more focused on human proteome research. In this brief review we explain the principles of widely used proteomic techniques (gel electrophoresis, liquid chromatography, mass spectrometry analysis, protein array technologies) and show examples of their application in oncology, namely hematooncological diseases.
