tkáňové exprese Dotaz Zobrazit nápovědu
Cervikální hlen je viskózní kapalina fungující jako zátka děložního čípku. V cervikálním hlenu můžeme detekovat produkty endometriálních a cervikálních žláz. Cervikální hlen je dále obohacen transudátem pocházejícím z vejcovodů a proteiny pocházející z vaječníků, peritonea a vzdálených tkání. Se zvyšující se hladinou ovariálních estrogenů se vlastnosti cervikálního hlenu mění tak, že umožňují snadnější odběr a zpracování. Z tohoto důvodu jsme vybrali skupinu deseti pacientek léčených kontrolovanou ovariální hyperstimulací pro in vitro fertilizaci v centru asistované reprodukce. Tato studie se zaměřuje na proteomickou charakterizaci cervikálního hlenu a na buněčnou a tkáňovou lokalizaci identifikovaných proteinů. Nejvíce intenzivními proteiny identifikovanými v cervikálním hlenu jsou muciny, ale bylo nalezeno také mnoho méně abundantních proteinů vnitrobuněčného původu. Analýza tkáňových expresí odhalila mnoho proteinů, které jsou kromě tkání ženských reprodukčních orgánů exprimovány také v jiných tkáních a mimo jiné také proteiny specifické pro varlata, játra, placentu, oční sítnici a mozeček. Tato studie dále potvrzuje vhodnost cervikálního hlenu jako zdroje proteomických biomarkerů nejen pro diagnostiku ženského reprodukčního traktu.
Cervical mucus is a viscous fluid functioning as a cervix plug. Products of the endometrial and cervical glands can be detected in the cervical mucus. Cervical mucus is further enriched with transudate originating from the fallopian tubes and proteins originating from the ovaries, peritoneum and distant tissues. With increasing levels of ovarian estrogens, the properties of cervical mucus for possible collection and processing change appropriately. For these reasons, we chose a group of 10 patients treated in the center of assisted reproduction by controlled ovarian stimulation for in vitro fertilization. This study focuses on the proteomic characterization of cervical mucus and localizes the possible sources of the identified proteins. The most abundant proteins were extracellular proteins, mainly mucins; however, most of the identified proteins, present usually in lower quantities, were of intracellular origin. The tissue analysis revealed that proteins from female reproductive organs are also expressed in other tissues in addition to female reproductive organs, but also proteins specific to the testis, liver, placenta, retina, and cerebellum. This study confirms the suitability and high potential of cervical mucus as a source of proteomic biomarkers not only for the diagnosis of the female reproductive tract.
- Klíčová slova
- tkáňové exprese,
- MeSH
- cervikální hlen * chemie MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- proteomika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Cíl práce: Zhodnotit přítomnost exprese genů PAX5 a Shb ve tkáni povrchových uroteliálních karcinomů močového měchýře, posoudit její korelaci s patologií genu p53 a uvážit prognostický význam jednotlivých faktorů. Pacienti a metodika: Do studie bylo zahrnuto 61 pacientů s histologicky prokázaným povrchovým uroteliálním karcinomem močového měchýře. Exprese mRNA genů PAX5 a Shb ve tkáni nádoru byla detekována pomocí reverzní polymerázové řetězové reakce (RT-PCR) a výsledek byl vyjádřen semikvantitativně. Přítomnost mutací p53 byla zachycena pomocí SSCP (single strand conformation polymorphism) a potvrzena sekvenováním. K imunohistochemickému vyšetření p53 byla použita protilátka DO1, k vyjádření výsledku bylo použito semikvantitativní hodnocení pomocí HSCORE (HS). Kontrolní skupinu pro posouzení PAX5 a Shb exprese tvořilo 8 mužů, u kterých byl vzorek urotelu odebrán během operace pro benigní hyperplazií prostaty. Výsledky: Přítomnost exprese PAX5 a Shb byla prokázána u 50, respektive 52 pacientů s uroteliálním nádorem, ale u žádného z kontrolní skupiny. Mutace p53 byla zachycena u jediného pacienta s tumorem pTaG2 a byla lokalizována v exonu 5 (delece prolinu 128). Jaderná imunoreaktivita p53 byla přítomna u většiny pacientů, při použití prahové hodnoty HS 200 mělo 56,9 % nemocných pozitivní nález. Kvantita imunohistochemické pozitivity p53 nekorelovala s kvantitou exprese PAX5. Při použití prahových hodnot HS 200 pro p53 a 0,2 pro PAX5 mělo z 8 progredujících pacientů 7 nadprahovou hodnotu HS a 4 nadprahovou hodnotu PAX5. Závěr: Exprese genu PAX5 je častým nálezem u povrchových uroteliálních karcinomů močového měchýře.
The objective of the work: To evaluate the presence of the PAX5 and Shb genes expression in the tissue of superficial urotelial urinary bladder cancers, to judge its correlation with the p53 gene pathology and to consider the prognostic value of individual factors. Patients and Method: 61 patients with histologically proven superficial urotelial bladder cancer were included into the study. The mRNA expression of PAX5 and Shb genes in the cancer tissue was detected by the reverse polymerase chain reaction (RT- PCR) and the result was expressed semiquantitatively. The presence of p53 mutations was recorded by SSCP (single strand conformation polymorphism) and confirmed by sequening. The immunohistological examination of p53 was made by using DO1 antibody and the result was expressed using semiquantitative evaluation by HSCORE (HS). 8 men created the control group for PAX5 and Shb expression evaluation. Their urotel sample was withdrawn during the operation of benign prostate hyperplasia. Results: The presence of PAX5 and Shb expression was proven in 50, let us say in 52 patients with urotelial cancer, but it was not proven in anybody of the control group. p53 mutation was recorded in one patient with pTaG2 tumour and it was localised in 5 exon (proline 128 deletion). Nuclear immunoreactivity of p53 was present in the majority of patients, 56,9% of patients had positive finding using the threshold value HS 200. The quantity of p53 immunohistochemical positivity did not correlate with the quantity of PAX5 expression. Using the threshold values of HS 200 for p53 and 0,2 for PAX5 the 7 of 8 progressing patients had supra-threshold HS value and 4 of them had supra-threshold PAX5 value. Conclusion: The PAX5 gene expression is an often finding in superficial urotelial urinary bladder cancers.
- MeSH
- karcinoembryonální antigen krev MeSH
- lidé MeSH
- nádory rekta diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Úvod do problematiky: Matrixové metaloproteinázy 2 a 9 (želatinázy, typ IV kolagenázy), patogeneticky významné produkty nádorových a zánětiivých buněk, byly v poslední době prokázány také v pohrudničních výpotcích různého původu. Zatímco se MMP-2 zdá být exprimována v pleurální tekutině konstitučně, je exprese MMP-9 indukována u patologických stavů jako jsou záněty a nádorové bujení. Údaje o stupni exprese u poruch různé etiologie jsou však rozporné. Metody: Látkové koncentrace obou želatináz byly kvantifikovány tmunochemickými metodami a metodou želatinové zymografie v tekutině 31 pohrudničních výpotků a ve 26 krevních sérech téže skupiny pacientů. Imunochemicky byly kvantifikovaný také tkáňové inhibitory metaloproteináz TIMP-1 a TIMP-2 v tekutině 39 pleurálních výpotků. Kultivační media buněk, získaných z maligních výpotků, byla testována na želatinovém filmu (n=12). Výsledky: Exprese MMP-9 (želatinázy B) v parainfekčních výpotcích byla signifikantně vyšší v porovnání s mahgními výpotky. Pro posouzení role tkáňových inhibitorů metaloproteas byly provedeny imunometrické analýzy TIMP-1 a TIMP-2 u 39 výpotků, potvrzující přednostní expresi TIMP-1 v porovnání s TIMP-2. Na rozdfl od výpotků, kde byly detegovány takřka výhradně inaktivní, proenzymové formy MMPs, kultivační media buněk, získaných z mahgních výpotků, byly v řadě případů proteolyticky aktivní při přímém želatinovém testu, což nasvědčuje přítomnosti volných aktivovaných proteas. Závěry: Uvedené výsledky jsou příspěvkem k objasnění vztahů mezi expresí proteas/antiproteas v pohrudničnich výpotcích a etiologií pleurálních poruch. Fenotypová různorodost exprese proteas u maligních výpotků vyžaduje však další studium, jehož cílem je rozšíření informačního potenciálu pleurálních tekutin.
Background: Matrix metalloproteinases 2 and 9 (gelatinases, type IV collagenases), pathogenetically important products of tumor and inflammatory cells, have previously been detected in pleural effusions of different origin. Whereas MMP-2 appeared to be expressed in pleural fluids constitutively, the expression of MMP-9 is apparently induced under pathological conditions, such as inflammation and cancer. However, the reports on the degree of expression of MMP-9 in effusions of different etiology remain contradictory. Methods: The expression of gelatinase A and B was quantified on the basis of molar concentration by means of immunoassays and gelatin zymography in 31 pleural effusion fluids, and in 26 sera from the same patient group. Tissue inhibitors of metalloproteinases TIMP-1 and TIMP-2 were analyzed by immunoassays in 39 effusions. Cultivation media of malignant effusion-derived cells were tested by a gelatin film method (n = 12). Results: The expression of MMP-9 (gelatinase B) in parainflammatory effusions was found to be significantiy higher when compared to parsmeoplastic effusions. To assess the regulatory role of tissue inhibitors of metalloproteinases, TIMP-1 and TIMP-2 in 39 effusions were subjected to immunometric qucintification, confirming high expression of TIMP-1 when compared to TlMP-2. In contrast to pleural fluids, in which almost exclusively inactive, proenzyme forms of MMPs were detected, some of the cultivation media of malignsoit effusion-derived cells weproteolytically active against a gelatin film, indicating the presence of free activated proteases. Conclusions: The results contribute to the understanding correlations between the expression of proteinases/antiproteinases and etiology of pleural disorders. To explore phenotypically heterogenous expression of proteases in mahgnant effusions, further investigation is needed, aiming at the extension of the informative potential of pleural fluids.
- MeSH
- dospělí MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- imunochemie metody MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- maligní pleurální výpotek diagnóza patologie MeSH
- matrixová metaloproteinasa 2 krev MeSH
- matrixová metaloproteinasa 9 krev MeSH
- pleurální výpotek diagnóza patologie MeSH
- senioři MeSH
- tkáňové inhibitory metaloproteinas krev MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
Přeruš. str. : il. ; 30 cm
The long-term outcomes of renal transplantation are affected, among other things, by graft quality and ischemia-reperfusion injury to the renal graft during transplantation. No standard histological or other methods making it possible to assess the status of the kidney pre-transplant and during the procedure are currently available. The aim of the project is to determine, using mRNA profile analysis and immunohistochemical evidence of selected proteins in cadaveric donor kidney biopsies before and during reperfusion and in standard protocol biopsy at 3 months post-transplant, the predictive value of these biomarkers for assessing the quality of the donor organ and its long-term function.
Dlouhodobé výsledky transplantací ledvin jsou ovlivněny mimo jiné kvalitou štěpu a ischemicko-reperfuzním poškozením ledviny během transplantace. V současnosti nejsou k dispozici standardní histologické nebo jiné metody umožňující zhodnocení stavu ledviny před transplantací a v jejím průběhu. Cílem tohoto projektu je pomocí analýzy genové exprese a biostatistiky identifikovat takové kandidátní geny, jejichž změněná míra exprese v renální tkáni předpovídá jako biomarker závažnost ischemicko/reperfusníhopoškození a tak umožní prognosticky se vyjádřit k výsledku transplantace ledviny.
- MeSH
- biopsie MeSH
- exprese genu MeSH
- reperfuzní poškození MeSH
- transplantace ledvin MeSH
- transplantace MeSH
- Konspekt
- Lékařské vědy. Lékařství
- NLK Obory
- transplantologie
- molekulární biologie, molekulární medicína
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Cíl studie: Zjistit možný přímý regulační vliv estrogenu na expresi MMP-26 in vitro.Typ studie: Experimentální studie.Název a sídlo pracoviště: Gynekologicko-porodnická klinika, UP LF a FN, Olomouc, Česká republika,Gynekologicko-porodnická klinika, Univerzitní nemocnice, Lund, Švédsko.Metodika: Studovali jsme MMP-26 mRNA ve 14 vzorcích normální endometriální tkáně, získanýchz proliferační fáze menstruálního cyklu. Vzorky byly pět dnů kultivovány buď se samotnýmestradiolem, nebo s kombinací estradiolu a progesteronu. Kontrolní skupiny tvořily vzorkykultivované s etanolem. Exprese MMP-26 mRNA byla zjišťována ve zmražených vzorcích pomocíin situ hybridizace. Přítomnost estrogenových a progesteronových receptorů byla stanovovánaimunohistochemicky.Výsledky: Exprese MMP-26 mRNA byla nejvyšší v čerstvých (nekultivovaných) endometriálníchvzorcích. Intenzita signálu strmě klesala v obou studovaných i kontrolních skupinách běhemprvních dvou dnů kultivace a v dalších dnech dosahovala zanedbatelných hladin. Nukleárníintenzita estrogenových i progesteronových receptorů byla po pěti dnech kultivace na vysokéúrovni.Závěr: Neprokázali jsme přímý regulační vliv estrogenu na expresi MMP-26 mRNA in vitro.
Objective: To examine possible estrogen dependent endometrial expression of MMP-26 in vitro.Design: Experimental study.Setting: Department of Obstetrics and Gynecology of the Palacky University Medical School andUniversity Hospital, Olomouc, Czech Republic, Department of Obstetrics and Gynecology, UniversityHospital, Lund, Sweden.Methods: We studied MMP-26 mRNA in 14 normal endometrial samples obtained from the proliferativephase of the menstrual cycle. Samples were cultured for fi ve days either with estradiolalone or in combination with progesterone. Samples cultured with ethanol represented controlgroups. MMP-26 mRNA expression was examined in frozen samples using in situ hybridization.Immunohistochemistry was used to study the presence of estrogen and progesterone receptorsin endometrial explants.Results: MMP-26 mRNA expression was highest in fresh (non cultured) samples. Signal intensitydecreased during the fi rst two days of culture and was negligable in the following days. Nuclearintensity for estrogen and progesterone receptor was high after fi ve days of culture.Conclusion: We did not fi nd MMP-26 mRNA in vitro expression to be directly estrogen dependent.
- MeSH
- endometrium MeSH
- lidé MeSH
- messenger RNA MeSH
- receptory estradiolu genetika MeSH
- receptory progesteronu genetika MeSH
- regulace genové exprese MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- techniky in vitro MeSH
Cíl studie: Stanovit endometriální profi ly exprese mesengerové RNA (mRNA) vybraných matrixmetaloproteináz (MMP) a tkáňového inhibitoru metaloproteináz-1 (TIMP-1).Typ studie: Experimentální studie.Název a sídlo pracoviště: Gynekologicko-porodnická klinika, LF UP a FN Olomouc, Česká republika,Gynekologicko-porodnická klinika, Univerzitní nemocnice Lund, Švédsko.Metodika: Studovali jsme MMP-1, -3, -7, -10, -11, -12, -13, -14, -16, -26 a TIMP-1 mRNA ve 39 vzorcíchnormální endometriální tkáně získaných z různých fází menstruálního cyklu. Na základě histologickéhovyšetření byly vzorky klasifi kovány jako časná (n=8), střední (n=6) a pozdní (n=7) proliferace,časná (n=4), střední (n=4) a pozdní (n=8) sekrece a menstruální (n=3) fáze. Hladiny mRNAextrahované ze zmražených tkáňových vzorků byly kvantifi kovány pomocí real time PCR.Výsledky: Celkem byly zjištěny čtyři vzorce exprese MMP mRNA v průběhu menstruačního cyklu.MMP-1, -3, -10, a -12 byly exprimovány převážně v perimenstruálním období, MMP-7 a -11 mělynejvyšší hladiny v proliferační fázi, MMP-13, -14 a -16 byly exprimovány v průběhu celého cyklua MMP-26 měla maximum exprese v periovulatorním období. Hladiny TIMP-1 mRNA zůstávalynezměněny během cyklu.Závěr: Specifi cké profi ly endometriální exprese MMP v průběhu menstruačního cyklu ukazují najejich odlišný biologický význam v průběhu cyklu. MMP-26 vykazuje samostatný vzorec exprese.
Objective: To examine the endometrial expression pattern of messenger RNA (mRNA) for selectedmatrix metalloproteinases (MMP) and tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1).Design: Experimental study.Setting: Department of Obstetrics and gynecology of the Palacky University Medical School andUniversity Hospital, Olomouc, Czech Republic, Department of Obsterics and Gynecology, UniversityHospital, Luna, Sweden.Methods: We studied MMP-1, -3, -7, -10, -11, -12, -13, -14, -16, -26 and TIMP-1 mRNA in 39 normalendometrial samples obtained across the menstrual cycle. Based on histological examination, allspecimens were classifi ed according to an ideal 28 day menstrual cycle as early (n=8), mid (n=6)and late (n=7) proliferative phase, early (n=4), mid (n=4) and late (n=8) secretory phase and menstrual(n=3) phase. mRNA extracted from frozen tissue samples was quantitated using real timePCR.Results: Four distinct patterns of MMP mRNA expression were detected in cycling endometrium.MMP-1, -3, -10, and -12 were expressed predominantly in perimenstrual period, MMP-7 and -11had highest levels in proliferative phase, MMP-13, -14 and -16 were expressed throughout thecycle and MMP-26 was found to be maximal in periovulatory period. Levels of TIMP-1 mRNAremained unchanged during the cycle.Conclusion: The specifi c endometrial expression profi les of MMPs during menstrual cycle pointto their specifi c biologic roles during the cycle. MMP-26 exhibits a unique expression pattern.
- MeSH
- endometrium MeSH
- exprese genu MeSH
- genetické techniky MeSH
- lidé MeSH
- menstruační cyklus MeSH
- messenger RNA analýza MeSH
- tkáňový inhibitor metaloproteinasy 1 genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- techniky in vitro MeSH
Východiska: Karcinom plic je jedním z nejfatálnějších karcinomů jak u mužů, tak u žen. Tento typ karcinomu je rozdělen do různých podtypů, k nimž patří nemalobuněčný karcinom plic (non-small cell lung cancer -NSCLC). NSCLC představuje asi 80 % všech případů. Bylo prokázáno, že dlouhé nekódující RNA (long non-coding RNA - lncRNA) ovlivňují patogenezi karcinomu plic. Vliv lncRNA LINC01433 na tento typ karcinomu u íránských pacientů však není jednoznačný. Cíl: V tomto projektu jsme pomocí kvantitativní polymerázové řetězové reakce v reálném čase vyhodnotili expresi LINC01433 ve 42 vzorcích NSCLC a jejich párových nenádorových tkáních. Vzorky byly odebrány od pacientů přijatých do nemocnice Labbafinejad v letech 2016-2017. Výsledky: Nebyl nalezen žádný významný rozdíl v expresi LINC01433 mezi nádorovými a nenádorovými tkáněmi (poměr exprese 0,67; p = 0,42). Exprese této lncRNA nebyla spojena s žádnými klinickými a demografickými údaji vč. věku, pohlaví, historie kouření, stadia nebo podtypu karcinomu. Závěr: Na základě podobných hladin exprese této lncRNA mezi nádorovými a nenádorovými tkáněmi a chybějící asociace mezi hladinami exprese a klinickými údaji nemá tato lncRNA vliv na karcinom plic u íránských pacientů.
Background: Lung cancer is one of the most fatal human cancers both in males and females. This type of cancer is categorized to different subtypes among them is non-small cell lung cancer (NSCLC). NSCLC accounts for about 80% of all cases. Long non-coding RNAs (lncRNAs) have been shown to influence the pathogenic course of lung cancer. However, the contribution of LINC01433 lncRNA in this type of cancer in Iranian patients is not clear. Purpose: In the current project, we evaluated expression of LINC01433 in 42 NSCLC samples and their paired non-tumoral tissues using quantitative real time polymerase chain reaction method. Samples were collected from patients admitted to Labbafinejad Hospital during 2016-2017. Results: There was no significant difference in the expression of LINC01433 between tumoral and non-tumoral tissues (expression ratio 0.67, p = 0.42). Expression of this lncRNA was not associated with any of clinical and demographic data including age, gender, smoking history, stage or cancer subtype. Conclusion: Based on the similar expression levels of this lncRNA between tumoral and non-tumoral tissues and lack of association between expression levels and clinical data, this lncRNA is not a possible contributor to lung cancer in Iranian patients. However, expression analysis of this lncRNA in larger sample sizes is needed to verify our results.
- MeSH
- dospělí MeSH
- exprese genu MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory plic * genetika MeSH
- RNA dlouhá nekódující analýza MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH