- MeSH
- dítě MeSH
- hemolyticko-uremický syndrom * farmakoterapie MeSH
- humanizované monoklonální protilátky škodlivé účinky MeSH
- infekce vyvolané Escherichia coli * farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- shiga-toxigenní Escherichia coli * MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
V tomto sdělení podáváme zprávu o činnosti Národní referenční laboratoře pro E. coli a shigely za léta 2018 a 2019, a to v oblasti diagnostické, vzdělávací a publikační.
We provide a report on the activities of the National Reference Laboratory for E. coli and Shigella in the diagnostic, educational and publication areas in 2018 and 2019.
V návaznosti na článek uveřejněný ve Zprávách CEM (2019; 28(4): 139–145) uvádíme přehled deseti nejčastěji identifikovaných sérotypů Salmonella enterica subsp. enterica, které byly nahlášeny do systémů EpiDat a ISIN (systémy pro hlášení infekčních onemocnění) za kalendářní roky 2017 a 2018. V obou letech se na prvních pěti pozicích zařadily: S. Enteritidis, S. Typhimurium (první a druhé místo), monofázická S. Typhimurium, S. Infantis a S. Bareilly, resp. S. Coeln (třetí až pátá pozice v různém pořadí). Dále informujeme o doporučení, které sérotypy Salmonella enterica subsp. enterica by měly být schopny laboratoře dourčit.
Following the article in The Bulletin of the Centre for Epidemiology and Microbiology (Zprávy CEM, 2019; 28(4): 139–145), we present a list of the top ten most prevalent serotypes of Salmonella enterica subsp. enterica reported to the infectious diseases information systems EPIDAT and ISIN in calendar years 2017 and 2018. In both years, the top five serotypes were S. Enteritidis, S. Typhimurium (in first or second place), monophasic S. Typhimurium, S. Infantis, and S. Bareilly or S. Coeln (in third to fifth place in different orders). In addition, information is provided as to which serotypes of Salmonella enterica subsp. enterica should be further identifiable by laboratories.
V příspěvku popisujeme případ těžkého diarea-pozitivního hemolyticko-uremického syndromu (D+ HUS) spo-jeného s infekcí enterohemoragickou Escherichia coli (EHEC) O157:H7 produkující Shiga toxin 2c. Pacient, 4,5letý chlapec, byl hospitalizován s diagnózou atypický HUS (aHUS) na podkladě defi citu/mutace CD46/MCP (membránový proteinový kofaktor). Jedná se tedy o vzácnou koincidenci aHUS s infekcí EHEC O157:H7. EHEC O157:H7 byla izolována ze vzorku stolice pacienta pomocí optimalizovaného diagnostického postupu dostupného v Národní referenční laboratoři (NRL) pro E. coli a shigely, Státní zdravotní ústav (SZÚ) Praha, zatímco rektální výtěr od pacienta odebraný ve stejný den a vyšetřený pomocí běžného postupu byl na E. coli O157 negativní. Tato skutečnost jasně zdůrazňuje nutnost vyšetřovat u pacientů s již rozvinutým HUS co největší množství materiálu (tj. vzorek stolice, ne rektální výtěr) a použít selektivní, citlivé a specifi cké diagnostické metody. Takový přístup zvyšuje pravděpodobnost záchytu EHEC ve vzorku z pozdního odběru, kdy je agens ve stolici vzhledem ke sníženému až minimálnímu kvantu těžko prokazatelné. Protože odlišení D+ HUS a aHUS je důležité z hlediska terapeutického, apelujeme na lékaře, aby zasílali stolice od pacientů s HUS na průkaz EHEC do NRL pro E. coli a shigely, SZÚ Praha, kde jsou příslušné diagnostické metody k dispozici. Tato kazuistika ukazuje, že ačkoliv velmi vzácně, případy HUS s koincidencí genetického podkladu aHUS a infekce EHEC se mohou vyskytnout a v důsledku kombinovaného poškození endotelu mohou mít velmi závažný klinický průběh.
The authors present a case of severe diarrhea-positive hemolytic uremic syndrome (D+HUS) in a 4.5-year-old boy associated with infection by enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 producing Shiga toxin 2c.The patient was admitted to the hospital with atypical HUS (aHUS) based on CD46/MCP (membrane cofactor protein) defi ciency/mutation. This case thus represents a rare coincidence of aHUS and EHEC O157:H7 infection. EHEC O157:H7 was isolated from the patient ́s stool sample using an optimized diagnostic procedure available in the National Reference Laboratory (NRL) for E. coli and Shigella, National Institute of Public Health (NIPH), Prague, while a rectal swab from the patient collected on the same day and analyzed by the routine procedure tested negative for E. coli O157. This fi nding clearly demonstrates the need to analyze in patients with already developed HUS as much specimen as possible (i.e., stool sample, not rectal swab) and to use selective, sensitive, and specifi c diagnostic methods. Such an approach increases the probability of EHEC detection in late samples where the detection of the agent is diffi cult because of its reduced or minimum amount. Since it is crucial from the therapeutic point of view to differentiate D+ HUS from aHUS, we encourage the physicians to refer stool samples from HUS patients to the NRL for E. coli and Shigella, NIPH, Prague where appropriate diagnostic methods are available. This case report illustrates that, although rare, cases of genetically based aHUS co-occurring with EHEC infection can appear and can have a very severe clinical course due to combined endothelial damage.
BACKGROUND: Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O26:H11/H-, the most common non-O157 serotype causing hemolytic uremic syndrome worldwide, are evolutionarily highly dynamic with new pathogenic clones emerging rapidly. Here, we investigated the population structure of EHEC O26 isolated from patients in several European countries using whole genome sequencing, with emphasis on a detailed analysis of strains of the highly virulent new European clone (nEC) which has spread since 1990s. RESULTS: Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP)-based analysis of 32 EHEC O26 isolated in the Czech Republic, Germany, Austria and Italy demonstrated a split of the nEC (ST29C2 clonal group) into two distinct lineages, which we termed, based on their temporal emergence, as "early" nEC and "late" nEC. The evolutionary divergence of the early nEC and late nEC is marked by the presence of 59 and 70 lineage-specific SNPs (synapomorphic mutations) in the genomes of the respective lineages. In silico analyses of publicly available E. coli O26 genomic sequences identified the late nEC lineage worldwide. Using a PCR designed to target the late nEC synapomorphic mutation in the sen/ent gene, we identified the early nEC decline accompanied by the late nEC rise in Germany and the Czech Republic since 2004 and 2013, respectively. Most of the late nEC strains harbor one of two major types of Shiga toxin 2a (Stx2a)-encoding prophages. The type I stx2a-phage is virtually identical to stx2a-phage of EHEC O104:H4 outbreak strain, whereas the type II stx2a-phage is a hybrid of EHEC O104:H4 and EHEC O157:H7 stx2a-phages and carries a novel mutation in Stx2a. Strains harboring these two phage types do not differ by the amounts and biological activities of Stx2a produced. CONCLUSIONS: Using SNP-level analyses, we provide the evidence of the evolutionary split of EHEC O26:H11/H- nEC into two distinct lineages, and a recent replacement of the early nEC by the late nEC in Germany and the Czech Republic. PCR targeting the late nEC synapomorphic mutation in ent/sen enables the discrimination of early nEC strains and late nEC strains in clinical and environmental samples, thereby facilitating further investigations of their geographic distribution, prevalence, clinical significance and epidemiology.
- MeSH
- biologická evoluce * MeSH
- DNA bakterií MeSH
- enterohemoragická Escherichia coli klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- fylogeneze MeSH
- genetická variace * MeSH
- genom bakteriální * MeSH
- genomika MeSH
- infekce vyvolané Escherichia coli diagnóza epidemiologie mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- sekvenování celého genomu * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Proinflammatory cytokines play important roles in the pathogenesis of diseases caused by enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157, but the spectrum of bacterial components involved in the proinflammatory responses is not fully understood. Here, we investigated the abilities of outer membrane vesicles (OMVs), nanoparticles released by EHEC O157 during growth, to induce production of proinflammatory cytokines in human intestinal epithelial cells. OMVs from both EHEC O157:H7 and sorbitol-fermenting (SF) EHEC O157:H- induced production of interleukin-8 (IL-8) in Caco-2, HCT-8, and HT-29 intestinal epithelial cell lines. H7 flagellin was the key IL-8-inducing component of EHEC O157:H7 OMVs, whereas cytolethal distending toxin V and O157 lipopolysaccharide (LPS) largely contributed to IL-8 production elicited by flagellin-lacking OMVs from SF EHEC O157:H-. The H7 flagellin-mediated signaling via Toll-like receptor (TLR) 5, and O157 LPS-mediated signaling via TLR4/MD-2 complex, which were followed by activation of the nuclear factor NF-κB were major pathways underlying IL-8 production induced by EHEC O157 OMVs. The proinflammatory and immunomodulatory capacities of EHEC O157 OMVs have pathogenetic implications and support the OMVs as suitable vaccine candidates.
- MeSH
- buněčná membrána metabolismus MeSH
- buňky HT-29 MeSH
- Caco-2 buňky MeSH
- epitelové buňky metabolismus MeSH
- Escherichia coli O157 patogenita MeSH
- faktory virulence metabolismus MeSH
- flagelin metabolismus MeSH
- infekce vyvolané Escherichia coli mikrobiologie patologie MeSH
- interleukin-8 biosyntéza MeSH
- lidé MeSH
- nádorové buněčné linie MeSH
- NF-kappa B metabolismus MeSH
- proteiny vnější bakteriální membrány metabolismus MeSH
- proteiny z Escherichia coli metabolismus MeSH
- signální transdukce MeSH
- střevní sliznice cytologie mikrobiologie patologie MeSH
- toll-like receptor 4 metabolismus MeSH
- toll-like receptor 5 metabolismus MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- Klebsiella pneumoniae izolace a purifikace MeSH
- krev mikrobiologie MeSH
- mikrobiální testy citlivosti klasifikace metody MeSH
- moč mikrobiologie MeSH
- Pseudomonas aeruginosa izolace a purifikace MeSH
- testování odbornosti laboratoří * MeSH
- Yersinia enterocolitica izolace a purifikace MeSH
- Publikační typ
- tabulky MeSH
