Nitrogen fixation and assimilation processes are vital to the functioning of any ecosystem. Nevertheless, studying these processes using 15N-based stable isotope probing was so far limited because of technical challenges related to the relative rarity of nitrogen in nucleic acids and proteins compared to carbon, and because of its absence in lipids. However, the recent adoption of high-throughput sequencing and statistical modelling methods to SIP studies increased the sensitivity of the method and enabled overcoming some of the challenges. This chapter describes in detail how to perform DNA- and RNA-SIP using 15N.

• MeSH
• bakteriální RNA chemie   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• bakterie fixující dusík genetika   metabolismus   MeSH
• centrifugace - gradient hustoty MeSH
• DNA bakterií chemie   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• fixace dusíku genetika   fyziologie   MeSH
• izotopové značení metody   MeSH
• izotopy dusíku metabolismus   MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• bakteriální RNA izolace a purifikace   MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• králíci MeSH
• modely u zvířat MeSH
• regulace genové exprese u bakterií genetika   MeSH
• regulační geny genetika   MeSH
• Treponema pallidum genetika   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• králíci MeSH
• zvířata MeSH

• MeSH
• bakteriální RNA izolace a purifikace   MeSH
• Escherichia coli genetika   MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• genetická transkripce MeSH
• regulace genové exprese u bakterií MeSH
• Salmonella typhimurium genetika   patogenita   MeSH
• sigma faktor genetika   MeSH
• transkripční faktory genetika   MeSH

• MeSH
• bakteriální RNA izolace a purifikace   MeSH
• diethylpyrokarbonát MeSH
• fungální RNA izolace a purifikace   MeSH
• Saccharomyces cerevisiae genetika   MeSH
• Streptomyces aureofaciens genetika   MeSH

• MeSH
• agar MeSH
• aminokyseliny metabolismus   MeSH
• bakteriální proteiny biosyntéza   MeSH
• bakteriální RNA biosyntéza   farmakologie   izolace a purifikace   MeSH
• bezbuněčný systém MeSH
• časové faktory MeSH
• DNA bakterií MeSH
• Escherichia coli metabolismus   růst a vývoj   účinky léků   účinky záření   MeSH
• fenylalanin metabolismus   MeSH
• fluorouracil farmakologie   metabolismus   MeSH
• glukosa MeSH
• izotopy uhlíku MeSH
• kolorimetrie MeSH
• kultivační média MeSH
• leucin metabolismus   MeSH
• messenger RNA biosyntéza   MeSH
• nukleosidy metabolismus   MeSH
• radiační účinky MeSH
• replikace DNA MeSH
• ultrafialové záření MeSH
• uracil MeSH