In the previous project (GA CR #13-13458S) in newborns from Karvina compared to newborns from Ceske Budejovice (CB) were observed deregulation of gene expression in immune and brain development pathways. Therefore this cohort of children will be further followed. Pediatricians from the districts of Karvina and CB will fulfill the questionnaires about the morbidity of these children in the age of 3-5 years. These children will be examined by psychologist to follow their mental development. Outcome of this research should be information, if changes in gene expression affecting immunity increase the morbidity of children as well as if changes in gene expression affecting brain development affect mental development. Other cohort are newborns born in the districts of CB and Most, who were examined at delivery by the same methods. Pediatricians will fulfill the questionnaires about the morbidity of children up to 2 years of age and mothers questionnaire about the child. Outcome should be information, if air pollution in previous decades affects the morbidity of children.

V předchozí studii (GA ČR 13-13458S) byly u novorozenců z Karviné při srovnání s novorozenci z Českých Budějovic (ČB) pozorovány změny v expresi genů ovlivňujících imunitu a vývoj mozku. Proto budou tyto děti dále sledovány. U dětí ve věku 5 let z okresů ČB a Karviná budou pediatry vyplněny dotazníky o nemocnosti dětí ve věku 3-5 let. U dětí bude zajištěno psychologické vyšetření. Od každého dítěte bude získán vzorek moči. V moči budou stanoveny polycyklické aromatické uhlovodíky (PAU). Bude analyzován vztah mezi nemocností dětí a výsledky stanovení biomarkerů při narození. Výsledkem výzkumu by měla být informace, zda změny v expresi genů ovlivňujících imunitu zvyšují nemocnost dětí, a zda změny v expresi genů ovlivňujících vývoj mozku ovlivňují jejich psychický vývoj. Druhou kohortou jsou děti narozené v okrese ČB a Most, u kterých byla při narození provedena stejná vyšetření. Pediatry budou vyplněny dotazníky o nemocnosti dětí do věku 2 let a matkami dotazník o dítěti. Výsledkem bude informace, zda zátěž znečištěným ovzduším v předchozích desetiletích ovlivňuje nemocnost dětí.

• MeSH
• inhalační expozice MeSH
• morbidita MeSH
• nemoci dýchací soustavy epidemiologie   MeSH
• předškolní dítě MeSH
• regulace genové exprese MeSH
• rizikové faktory MeSH
• zdravotnické přehledy MeSH
• znečištění ovzduší MeSH
• Check Tag
• předškolní dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• environmentální vědy
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Growing incidence of Gram-negative bacteria resistant to drugs of last resort, carbapenems and colistin, represents one of the major issues of current medicine. Until recently, these bacteria were associated mainly with hospitalized patients, however, their spreading among animals and in the environment is being increasingly reported over last years. The project is focused on the evaluation of sources and transmission pathways of Enterobacteriace carrying plasmid-mediated genes for resistance to colistin and carbapenems in humans, food-producing animals, food, the environment and wildlife in the Czech Republic. Selective cultivation of resistant isolates will be followed by complex molecular-epidemiological typing, whole-genome sequencing and comparative plasmid analysis. The role of food chain and the environment as secondary reservoirs of clinically relevant resistance mechanisms and risks for public health will be determined. Factors favouring their selection and maintenance in human and non-human sources will be evaluated, and interventions to limit their spread will be proposed.

Rostoucí incidence gramnegativních bakterií rezistentních k antibiotikům poslední volby, karbapenemům a kolistinu, představuje jeden z nejzávažnějších problémů současné medicíny. Do nedávna byly tyto rezistentní bakterie nacházeny zejména u hospitalizovaných pacientů, v posledních letech je však pozorováno jejich šíření mezi zvířaty a v prostředí. Projekt je zaměřen na sledování zdrojů a cest šíření plazmidově kódované rezistence ke karbapenemům a kolistinu u Enterobacteriaceae z člověka, potravinových zvířat, potravin, prostředí a volně žijících živočichů v České republice. Selektivní kultivace rezistentních izolátů bude doplněna komplexní molekulárně-epidemiologickou typizací, celogenomovým sekvenováním a komparativní analýzou plazmidů. Bude zhodnocen význam potravinového řetězce a prostředí jako sekundárních zdrojů bakterií s klinicky významnými mechanizmy rezistence a rizika pro veřejné zdraví. Budou studovány faktory přispívající k jejich selekci a udržování v humánních i nehumánních zdrojích a navržena opatření k omezení jejich šíření.

• MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• bioznečištění MeSH
• Enterobacteriaceae účinky léků   MeSH
• karbapenemy MeSH
• kolistin MeSH
• One Health MeSH
• plazmidy MeSH
• rizikové faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• environmentální vědy
• bakteriologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Cardiopulmonary exercise testing is recommended for preoperative evaluation and risk stratification of lung resection candidates. Ventilatory efficiency (VE/VCO2 slope) has been shown to predict morbidity and mortality in lung resection candidates and has been shown superior to peak VO2. Patients with increased VE/VCO2 during exercise also exhibit increased VE/VCO2 ratio and decreased end-tidal CO2 at rest. Our first hypothesis is that rest ventilatory parameters predict morbidity and mortality in patients undergoing thoracic surgery. VE/VCO2 is well correlated with ventilation-perfusion mismatch, therefore it may be useful in hypoxemia prediction during one-lung ventilation during thoracic surgery. Our second hypothesis is that patients with high VE/VCO2 will be prone to hypoxemia development during one-lung ventilation. We plan to publish two peer reviewed papers and one abstract.

Zátěžová vyšetření jsou doporučena pro předoperační zhodnocení a stratifikaci rizika u pacientů podstupujích plicní resekční zákrok. Bylo prokázáno, že sklon VE/VCO2 predikuje morbiditu a mortalitu u pacientů podstupujících plicní resekční výkon a to dokonce lépe než pro tyto účely rutinně užívaný parametr VO2. Je známo, že pacienti s vysokým VE/VCO2 během a na vrcholu zátěže mají zvýšený VE/VCO2 a nízký vydechovaný CO2 i v klidu. Naší první hypotézou je, že klidové parametry ventilace predikují pooperační komplikace a mortalitu u pacientů podstupujících nitrohrudní výkon. Parametr VE/VCO2 také dobře koreluje s ventilačně-perfuzním nepoměrem a mohl by tak predikovat výskyt hypoxémie během selektivní ventilace u nitrohrudních výkonů. Naší druhou hypotézou je, že pacienti se zvýšenou hodnotou parametru VE/VCO2 budou mít častější výskyt hypoxémie během nitrohrudního výkonu. Jako výstup studie plánujeme publikovat dva recenzované články a jeden abstrakt.

• MeSH
• hypoxie MeSH
• plicní ventilace MeSH
• pooperační komplikace MeSH
• předoperační vyšetření MeSH
• rizikové faktory MeSH
• spirometrie MeSH
• torakotomie mortalita   MeSH
• zátěžový test MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• chirurgie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Phototherapy is a golden standard treatment of severe neonatal jaundice. However, this treatment modality might be associated with significant health issues including increased overall mortality, increased risk of certain cancers or type 1 diabetes mellitus, especially in very low weight birth neonates. Despite a widespread use of phototherapy in clinical neonatology, only little is known about bilirubin oxidation products generated during phototherapy, and almost no studies have been performed to systematically explore the whole process of bilirubin photooxidation. All these aspects may account for observed clinical side effects. Thus, these issues are the main aim of the current project which combines interdisciplinary approach between life and basic sciences.

Fototerapie je standardním léčebným postupem u zavážné novorozenecké žloutenky. Tato léčba však může být doprovázena závažnými zdravotními dopady, které zahrnují zvýšení celkové mortality, zvýšený výskyt některých nádorových onemocnění, diabetu mellitu 1. typu, obzvláště u novorozenců s velmi nízkou porodní hmotností. I přes široké používání fototerapie v klinické neonatologii je velmi málo známo o biologických účincích oxidačních produktů bilirubinu, které vznikají během fototerapie novorozenecké žloutenky, a zcela chybí studie, které by se systematicky zabývaly celým procesem fotooxidace bilirubinu. Všechny tyto aspekty přitom mohou vysvětlit pozorované nežádoucí účinky fototerapie. Cílem předkládaného projektu je tedy systematické studium procesu fotooxidace bilirubinu za použití interdisciplinárního přístupu, který kombinuje biologické a chemické vědní obory.

• MeSH
• bilirubin chemie   metabolismus   škodlivé účinky   účinky záření   MeSH
• fototerapie škodlivé účinky   MeSH
• hemoxygenasa-1 MeSH
• novorozenec MeSH
• novorozenecká žloutenka terapie   MeSH
• oxid uhelnatý MeSH
• oxidace-redukce účinky záření   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• Check Tag
• novorozenec MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• biochemie
• perinatologie a neonatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Use of left-ventricular assist devices (LVADs) for partial or full support of failing heart have become an important and, at this time, also leading therapeutic option for patients with end-stage heart failure. Currently, LVADs are mostly used as a bridge to heart transplant, but the lack of donor organs, design advancements and increasing reliability of LVADs are widening possibilities of their long-term use. Studying long-term use of LVADs offers opportunity of complex understanding of vascular changes in patients with LVADs and their modification by different flow patterns. Thirty patients with LVADs with different flow types will be examined prospectively every 3 months for one year. Status of vasculature will be assessed from peripheral blood (microRNA, endothelial progenitor cells, microparticles), histological samples (morphological changes in aortic wall) and non-invasively (endothelial reactivity–EndoPat, ultrasound of great vessels). Ten healthy volunteers will be examined as controls. The null hypothesis is that there is no difference between studied groups in these gro...

Použití levostranných mechanických srdečních podpor (MSP) s kontinuálním tokem, pro částečnou nebo úplnou náhradu funkce selhaného srdce, je důležitou a v současnosti také jednou z hlavních léčebných modalit v terapii srdečního selhání. Dnes jsou MSP používány nejčastěji v indikaci „most k transplantaci srdce“, ale nedostatek dárcovských orgánů, pokroky v dizajnu a zvyšující se spolehlivost MSP umožňují jejich dlouhodobé použití. Studium dlouhodobého použití MSP nabízí příležitost ke komplexnímu porozumění vaskulárních změn u pacientů s MSP a vliv různých typů průtoku na tyto změny. Třicet pacientů s MSP s různým typem flow bude vyšetřeno každé tři měsíce po dobou jednoho roku. Stav vaskulatury bude stanoven z periferní krve (mikro RNA, endoteliální progenitorové buňky, mikročástice), z histologických vzorků (morfologické změny aortální stěny) a neinvazivně (endoteliální reaktivita – EndoPat, ultrazvuk velkých cév). Současně bude vyšetřeno 10 zdravých dobrovolníků. Nulovou hypotézou je, že nebude rozdílu mezi studovanými skupinami pacientů.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• cévy * patofyziologie   MeSH
• endoteliální progenitorové buňky MeSH
• kontrolní skupiny MeSH
• krevní oběh MeSH
• lidé MeSH
• mikro RNA MeSH
• podpůrné srdeční systémy * MeSH
• rizikové faktory kardiovaskulárních chorob MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• srovnávací studie MeSH

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Multicentre, multidisciplinary (3 gastroenterology units; biostatistics department; cooperation with general practitioners), prospective study is focused on examination of individuals with average colorectal cancer (CRC) risk (asymptomatic, age 50-75 years). In years 2016 – 2019, there will be 230 persons with positive semi-quantitative immunochemical fecal occult blood tests (FIT; QuikRead, Orion Diagnostica Oy, Finland) with cut-off level 75 ng/ml involved. Every person will be examined by second generation colon capsule endoscopy (CCE2) and optical colonoscopy afterwards. Main objective is to show that the negative predictive value (NPV) of the CCE2 applied in patients with positive FIT result is sufficient to include this method in the National CRC screening as the “filter” test with aim to reduce the necessity of subsequent optical colonoscopy.

Multicentrická, multioborová (3 pracoviště z oboru gastroenterologie, pracoviště biostatistiky, spolupráce s praktickými lékaři) prospektivní studie je zaměřena na vyšetření osob s běžným rizikem kolorektálního karcinomu (KRK), tedy o asymptomatické jedince ve věku 50-75 let. V letech 2016 – 2019 bude do studie zařazeno 230 jedinců s pozitivním semikvantitativním imunochemickým testem na okultní krvácení do stolice (QuikRead, Orion Diagnostica Oy, Finland) s hranicí pozitivity (cut-off hodnota) 75 ng/ml. Každý vyšetřovaný absolvuje kolonickou kapslovou endoskopii druhé generace a následně optickou kolonoskopii. Primárním cílem je určit zda negativní prediktivní hodnota kolonické kapslové endoskopie je dostatečná, aby tato metoda mohla být realizována v rámci Národního screeningu KRK jako „filtrační“ test s cílem snížit nutnost následné optické kolonoskopie.

• MeSH
• imunochemie metody   MeSH
• kapslová endoskopie metody   MeSH
• kolonoskopie metody   MeSH
• kolorektální nádory chirurgie   diagnóza   MeSH
• lidé MeSH
• okultní krev MeSH
• prospektivní studie MeSH
• rizikové faktory MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• multicentrická studie MeSH
• srovnávací studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gastroenterologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The relationship of the content and proportion of pro-inflammatory M1 and anti-inflammatory M2 macrophages between the human artery and adjacent perivascular adipose tissue will be determined (tissues obtained in kidney transplantation procedure from living kidney donors - women). The proportion of the macrophage subpopulation will be correlated to traditional as well as non-traditional risk factors of atherosclerosis, including reproductive status and markers of subclinical inflammation in circulation. The direct effect of molecules released from adipose tissue on macrophage cholesterol efflux, monocyte adhesion, and migration will be determined in cell cultures.

Projekt je zaměřen na stanovení vztahu mezi množstvím a poměrem prozánětlivých M1 a protizánětlivých M2 makrofágů v lidské renální arterii a v přilehlé perivaskulární tukové tkáni u zdravých dárců ledvin - žen. Subpopulace makrofágů budou korelovány ke specifickým rizikovým faktorům aterosklerózy včetně reprodukčního statusu a plazmatických markerům subklinického zánětu. Přímý efekt nízkomolekulárních látek uvolňovaných tukovou tkání na efflux cholesterolu z makrofágů a adhezi a migraci monocytů bude stanoven v tkáňové kultuře.

• MeSH
• arteria renalis patologie   MeSH
• ateroskleróza epidemiologie   MeSH
• dárci tkání MeSH
• lidé MeSH
• makrofágy patologie   MeSH
• rizikové faktory kardiovaskulárních chorob MeSH
• tuková tkáň patologie   MeSH
• zánět MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• kardiologie
• angiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Borderline changes are quite common histological findings of kidney allografts, both early after transplantation and in protocol 3-months biopsies. Although this phenotype has been considered as non-rejection, its prognosis remains unclear and in a subgroup of patients subsequently develops chronic rejection. Prediction of chronic rejection after borderline changes diagnosis is currently impossible. The aim of this project is to correlate immunological and molecular markers associated with borderline changes with subsequent donor specific antibody formation and presence of other markers of chronic T cell mediated or antibody mediated chronic allograft rejection.

Hraniční změny jsou častým histologickým nálezem ledvinných štěpů, jak v období brzy po transplantaci, tak v tříměsíčních protokolárních biopsiích. Přestože tento nález není považován za rejekci, jeho prognóza je nejistá a u podskupiny pacientů dochází následně ke vzniku chronické rejekce. Predikce chronické rejekce v době diagnózy hraničních změn je v současné době problematická. Cílem tohoto projektu je korelovat imunologické a molekulární markery hraničních změn s následnou tvorbou donor specifických protilátek a přítomností dalších znaků chronické T buňkami či protilátkami zprostředkované rejekce.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• fenotyp MeSH
• lidé MeSH
• příjemce transplantátu MeSH
• prognóza MeSH
• rejekce štěpu diagnóza   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• T-lymfocyty MeSH
• transplantace ledvin MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• transplantologie
• alergologie a imunologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Atherosclerosis is the most common cause of stroke. The aims of the project are to compare the visual and digital analysis of ultrasonographic and MRI images of atherosclerotic plaque in carotids in vivo and in vitro with the histological composition of the plaque obtained from patients indicated for carotid endarterectomy, to compare the characteristics of symptomatic and asymptomatic plaques, subsequently to verify a hypothesis that ultrasound can identify the sonographic plaque characteristics associated with an increased risk of plaque progression and stroke onset patients with carotic atherosclerosis. Ti identify the value of MRI in this indication. Identification of the characteristics of "unstable" atherosclerotic plaque will allow to improve the indication criteria for carotid endarterectomy or stenting and also for a potential change of a medical therapy in patients with "unstable" atherosclerotic plaque in the future. The diagnostic tools could enable to improve diagnosis of “unstable“ plaque in carotids using this new plaque characteristics evaluation.

Ateroskleróza je nejčastější příčinou cévní mozkové příhody (CMP). Cílem projektu je srovnání vizuální a digitální analýzy ultrazvukového obrazu karotického aterosklerotického plátu in vivo a in vitro s histologickým složením plátu získaného od pacientů indikovaných ke karotické endarterektomii, srovnání charakteristik symptomatických a asymptomatických plátů a ověření, zda lze identifikovat charakteristiky ultrazvukem zobrazeného plátu spojené se zvýšeným rizikem jeho progrese a vzniku ischemické CMP (tzv. “nestabilní” plát). Identifikace ultrazvukové charakteristiky „nestabilního“ aterosklerotického plátu umožní v budoucnosti zlepšit indikační kritéria pro karotickou endarterektomii, stenting a event. změnu farmakoterapie u pacientů s „nestabilním“ aterosklerotickým plátem. Pro finanční nenáročnost a dostupnost sonografických přístrojů lze předpokládat, že by tuto možnost zlepšení diagnostiky rizikovosti aterosklerotického plátu bylo možno využít u většiny pacientů s aterosklerotickým plátem v karotidách. Dále bude provedena analýza MRI obrazu plátu a histologických nálezů.

• MeSH
• aterosklerotický plát diagnostické zobrazování   patologie   MeSH
• cévní mozková příhoda etiologie   MeSH
• lidé MeSH
• progrese nemoci MeSH
• rizikové faktory kardiovaskulárních chorob MeSH
• stenóza arteria carotis diagnostické zobrazování   patologie   MeSH
• ultrasonografie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• angiologie
• neurologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Nearly 40% of subjects with detectable certain autoantibodies, such as ACPA, in combination with clinically suspect arthralgia (CSA) without clinical signs for synovitis, are considered to be at high risk of progressing to rheumatoid arthritis (RA), usually within 18 months of symptom onset. It is largely unknown which symptoms/characteristics relate to subclinical joint inflammation as measured by MRI or ultrasound. Early therapeutic interventions in RA improve clinical outcomes and reduce the joint damage and disability. However, no therapeutic guidelines are available for CSA before the onset of arthritis as yet. We therefore aim to identify, follow up this at-risk population and to start treatment if the arthritis onset occurs. Clinical assessment, imaging, routine and exploratory laboratory techniques will enable to find a predictor of arthritis onset and stratify patients at imminent risk of developing RA. We may contribute to elucidate whether a targeted intervention is able to reduce the subclinical inflammation, and hypothetically delay the onset of arthritis.

Téměř 40% jedinců s určitým typem autoprotilátek, např. ACPA, v kombinaci s klinicky suspektními artralgiemi (CSA), avšak bez jakýchkoli klinických známek synovitidy, mají vysoké riziko vzniku revmatoidní artritidy (RA), obvykle do 18 měsíců od začátku příznaků. Z velké části neznáme přesné symptomy/charakteristiku, která má vztah k subklinickému zánětu dle MRI nebo ultrazvuku. Včasná léčba u pacientů s RA zlepšuje jejich prognózu, míru kloubního postižení a disabilitu. V současnosti ale neexistuje doporučení, jak přistupovat k pacientům s CSA a jejich léčbě ještě před manifestací artritidy. Našim cílem je identifikovat a poté sledovat tyto rizikové pacienty a v případě manifestace artritidy poskytnout okamžitou léčbu. Klinické vyšetření, zobrazovací, rutinní a experimentální laboratorní analýzy nám umožní najít prognostický ukazatel manifestace nemoci a stratifikovat pacienty v bezprostředním riziku vzniku RA. Mohli bychom také přispět k poznatkům, jestli cílená intervence v tomto preklinickém stadiu účinně sníží míru subklinického zánětu a hypoteticky tak oddálí rozvoj artritidy...

• MeSH
• artralgie komplikace   MeSH
• autoprotilátky MeSH
• časná diagnóza MeSH
• lidé MeSH
• prognóza MeSH
• revmatoidní artritida diagnóza   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• zánět MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• revmatologie
• algeziologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR