Hedgehog-GLI (HH) signaling is indispensable during embryonic development and is aberrantly activated in many types of cancers. HH is important for initiation and all stages of tumor progression (proliferation, invasion, and metastasis). Only a limited number of genes activated by final GLI transcription factors is known and epigenetic mechanisms which participate in GLI-mediated activation are elusive. HH-targeted drugs are expected to be effective as anticancer drugs and many HH inhibitors are in clinical trials. Here, the HH pathway will be studied melanoma, lung cancer, and some others tumor types by the use of tissue culture and molecular techniques, mouse nu/nu models, and immunohistochemical staining. The aim will be focused on identifying new GLI target in these tumors, to determine an affective block of HH as a model for antitumor therapy, and to use these results, together with the results of immunohistochemistry for the improvement of prognosis, treatment and diagnostics.

Signální cesta Hedgehog-GLI (HH) je zcela nezbytná pro embryonální vývoj a je aberantně aktivována v mnoha typech nádorových buněk. HH aktivuje iniciaci i všechny projevy progrese nádoru (proliferace, invazivita, metastazování). Jsou známy jen některé gény aktivované výkonnými transkripčními faktory GLI (a tyto se mohou lišit u jednotlivých typů nádorů) a nejsou známy epigenetické mechanismy účastnící se aktivity faktorů GLI. HH cesta je slibným cílem protinádorové terapie a mnoho jejích inhibitorů je testováno (již i klinicky) jako léčiva. Budeme zkoumat HH u některých typů nádorů, zejména melanomu, karcinomů plic (v menší míře i u dalších typů nádorových buněk), a to v buněčné kultuře, na myších modelech nu/nu myší a v imunohistochemických barveních nádorových vzorků. Účelem bude zjistit další cílové geny GLI faktorů, využít stanovení exprese jejich proteinů pro určení prognozy, individualizaci léčby i diagnostiku a určit efektivitu zablokování HH cesty jako protinádorový therapeutický postup.

• MeSH
• cílená molekulární terapie MeSH
• inhibitory apoptózy MeSH
• MAP kinasový signální systém MeSH
• melanom MeSH
• nádory plic MeSH
• proliferace buněk MeSH
• proteiny hedgehog MeSH
• signální transdukce MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Transcription factor MITF (microphthalmia-associated transcription factor) is a key regulator of the development of embryonic melanocytes and activates about 30 genes among which are differentiation markers and genes maintaining the viability of melanocytes. Moreover, MITF is also required for the viability melanoma cells. Local chromatin remodeling at promoters is required for the expression of MITF and some of its targets. Blocking of the MITF expression could be therefore used to inhibit the viability and proliferation of melanoma cells. The aim of this project is to identify a suitable molecular approach to fully inhibit expression and/or activity of MITF and to detect additional MITF targets which are crucial for proliferation and maintenance of antiapoptotic signals in melanoma cells. The results will improve our understanding of the role of MITF in melanoma progression and may be a route to targeted gene therapy of this chemo- and radio-therapy resistant tumor.

Transkripční faktor MITF (microphthalmia-associated transcription factor) je klíčovým regulátorem embryonálního vývoje melanocytové linie a aktivuje transkripci asi 30 genů mezi kterými jsou geny specifické pro diferenciaci melanocytů, jejich proliferacia viabilitu. MITF je nutný i pro přežívání melanomových buněk. Lokální remodelace chromatinu specifickými komplexy je nutná pro expresi MITF i některých jeho cílových genů. Zablokováním transkripční aktivity faktoru MITF je možné docílit ztrátu proliferace a přežívání melanomových buněk v kultuře. Cílem projektu tedy bude identifikovat nejvhodnější molekulární postup úplné inhibice aktivity a/nebo exprese MITF a pomocí metody microarrays detekovat další cílové geny transkripčně závislé na MITF nutné kproliferaci a k blokování apoptozy u melanomových buněk. Výsledky ukáží na faktory účastnící se progrese melanomu a na mechanismus jejich exprese, a mohou být podkladem pro cílenou genovou terapii nádoru, jenž je rezistentní chemo- i radio-terapii.

• MeSH
• cílená molekulární terapie MeSH
• genetická terapie MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• malá interferující RNA MeSH
• melanom terapie   MeSH
• molekulární patologie MeSH
• restrukturace chromatinu MeSH
• sekvenční analýza RNA MeSH
• transkripční faktor spojený s mikroftalmií antagonisté a inhibitory   genetika   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• dermatovenerologie
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The SWI/SNF chromatin-remodeling complex functions as a tumor suppressor and several of its subunits (Brm, Brg1 a INI1) were found to be mutated in human tumors. We propose to study the expression of the SWI/SNF components in non-small cell lung cancer (NSCLC), small cell lung cancer (SCLC) and melanoma, and to investigate the role of an abrogated function of SWI/SNF in the progression of these three specific tumor types. We will further study how SWI/SNF participates in the differentiation program of melanoma cells. The results will indicate how the altered function or loss of subunits contribute to malignant behavior of the selected types of tumors with respect to invasion and formation of metastases.

Multiproteinový chromatin-remodelující komplex SWI/SNF je považován za nádorový supresor a jeho funkce je u několika typů nádorových buněk porušena tím, že některé jeho složky (Brm, Brg1 a INI1) jsou deletovány nebo mutovány. Bude zkoumána exprese komponent komplexu v buňkách malobuněčného (SCLC) i nemalobuněčného (NSCLC) karcinomu plic a maligního melanomu a vztah exprese k nádorové progresi. Dále bude zkoumána úloha tohoto komplexu při transkripci genů a markerů spojených s diferenciací melanomových buněk. Výsledky ukáží na možnou úlohu porušeného komplexu při patogenezi těchto nádorů zejména ve vztahu k invazivitě a metastasování a pomohou při prognose nádorového onemocnění.

• MeSH
• exprese genu MeSH
• genetická transkripce MeSH
• malobuněčný karcinom plic MeSH
• melanom MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• nádorové procesy MeSH
• nemalobuněčný karcinom plic MeSH
• prognóza MeSH
• restrukturace chromatinu MeSH
• transformované buněčné linie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

We propose to use multiple independent molecular approaches to elucidate the importance of the transcription factor MITF in the pathogenesis of human melanoma and the role of transcription factor HASH1 in small cell lung carcinoma. The quantitative estimation of MITF can also be helpful for the diagnosis of melanoma and HASH1 may help in prognostic consideration in small cell lung carcinoma.

Je navrženo několika nezávislými molekulárními přístupy studovat úlohu transkripčního faktoru MITF v patogenezi maligního melanomu a úlohu faktoru HASH1 v patogenezi malobuněčného karcinomu plic. Kvantitativní určení hladiny MITF u melanomu může pomoci při diagnoze a určení hladiny HASH1 při prognóze malobuněčného karcinomu plic.

• MeSH
• apoptóza MeSH
• autoimunitní tyreoiditida MeSH
• malobuněčný karcinom diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• melanom experimentální genetika   MeSH
• mikroftalmie genetika   MeSH
• transkripční faktory MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• pneumologie a ftizeologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

We propose to study mechanismus of transcription activation by microphthalmia (MITF) in normal and malignant melanocytes, the role of MITF in oncogenic transformation, and functional significance of its inteeraction with the retinoblastoma protein.

Bude studován mechanismus aktivace transkripce faktorem microphthalmia (MITF) v normálních i nádorových melanocytech, vztah MITF k nádorové transformaci melanocytů a funkční význam interakce MITF s retinoblastoma proteinem.

• MeSH
• buněčná diferenciace MeSH
• melanocyty MeSH
• melanom MeSH
• mikroftalmie MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• retinoblastomový protein MeSH
• transkripční faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Transcriptional coativators p300 and CBP are nuclear proteins that mediate the reponses to various differentia- tion stimuli. They may have tumour suppressor function and their role in malignancy and differentiation will be investigated.

Studovány budou funkce proteinů p300 a CBP ve vztahu k buněnčné diferenciaci a nádor.transform. jejich interakce s endogenními faktory které modulují koaktivátorovou aktivitu při transkripci genů důležitých pro buněčnou diferenciaci některých typů buněk.

• MeSH
• molekulární biologie metody   MeSH
• onkogenní proteiny MeSH
• regulace genové exprese MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The role of cell cycle regulators in the differentiation of tumor cells will be studied by methods of molecular and celluar biology. E1 a oncogene will be used and the links between the differentiation and expression of CDK inhibitors in tumors will be investigated.

Úloha regulátorů buněčného cyklu při diferenciaci nádorových buněk bude zkoumána metodami molekulární a buněčné biologie,s použitím onkopoteinu E1a, a bude sledován vztah stupně diferenciace a exprese inhibitorů CDK u nádorů.

• MeSH
• melanocyty MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí využití   metody   MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• transformované buněčné linie MeSH
• western blotting využití   metody   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• biologie
• experimentální medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Bude sledována regulace genové exprese genů specifických pro diferenciaci některých buněčných typů a mechanismus jejich deregulace u nádorů vycházejících z těchto buněk, zejména u maligního melanomu a malobuněčného karcinomu plic. V projektu budou zkoumány regulační mechanismy transkripce diferenciačně specifických genů, které jsou klíčové pro buněčnou diferenciaci- jejich deregulace u nádorů vycházejících z těchto buněk může mít vztah ke stupni malignity.

• MeSH
• buněčná diferenciace MeSH
• dekarboxylasy aromatických L-aminokyselin genetika   MeSH
• melanocyty MeSH
• melanom genetika   MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• transformované buněčné linie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• biologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Je zjišťována detekce větších chromosomových změn vybraných onkogenů a supresorových genů u plicních nádorů.Detekce je korelována s ostatními genetickými změnami zjištěnými v DNA, s klinickým průběhem a dalšími parametry.

• MeSH
• amplifikace genu MeSH
• delece genu MeSH
• nádory plic genetika   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• embryologie a teratologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt je zaměřen na detekci genetických změn v buňkách prekancerozních lézí bronchiálního epitelu,benigních nádorů i karcinomu plic,zejména mutace onkogenu K-ras.Informace mohou přispět k časné diagnose karcinomu plic a být podkladem pro prevenci.

• MeSH
• karcinom diagnóza   MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory plic diagnóza   MeSH
• onkogeny analýza   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR