The structure of the Aneura pinguis mitochondrial genome (GenBank accession no. NC_026901) is similar to that of closely related Metzgeriales species: it has a total length of 165 603 bp, the base composition of the mitogenome is the following: A (26.2%), C(23.6%), G(23.8%), and T(26.4%). The A. piguis mitochondrial genome contains 69 genes. A complete mitochondrial genome sequence of A. pinguis will help better to understand mitogenome structure and content among Metzgeriales order.
- Klíčová slova
- Aneura, Metzgeriales, cryptic species, mitochondrial genome,
- MeSH
- délka genomu MeSH
- DNA rostlinná MeSH
- fylogeneze * MeSH
- genom mitochondriální * MeSH
- genom rostlinný MeSH
- genomika MeSH
- Marchantiophyta genetika MeSH
- mitochondriální DNA MeSH
- mitochondriální geny * MeSH
- sekvence nukleotidů MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- zastoupení bazí MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- DNA rostlinná MeSH
- mitochondriální DNA MeSH
The structure of the Fusarium culmorum mitogenome is similar to that of closely related Fusarium spp.: it has a total length of 103,844 bp, the base composition of the genome is the following: A (35.4%), T (32.9%), C (14.6%), and G (17.1%). The mitogenome contains 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA (rRNA), and 28 transfer RNA (tRNA) genes, all coded on the same strand of DNA. The gene order is identical to that of the other Fusarium and Hypocreales mitogenomes. Maximum likelihood and Bayesian analysis based on the concatenated amino acid dataset of mitochondrial protein-coding genes confirmed close genetic relationship of F. culmorum to the other type B trichothecene producers F. graminearum and F. gerlachii.
- Klíčová slova
- Fungi, Fusarium culmorum, mitogenome,
- MeSH
- délka genomu MeSH
- Fusarium klasifikace genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom mitochondriální * MeSH
- mitochondriální geny MeSH
- otevřené čtecí rámce MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- zastoupení bazí MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
The structure of the Fusarium gerlachii mitogenome is similar to that of closely related Fusarium graminearum; it has a total length of 93,428 bp, the base composition of the genome is: A (35.3%), T (32.8%), C (14.7%) and G (17.2%). The mitogenome contains 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA (rRNA) and 28 transfer RNA (tRNA) genes. The tRNA genes range in size from 62 bp to 88 bp. The gene order is identical to that of the other Fusarium mitogenomes.
- Klíčová slova
- F. gerlachii, fungi, mitogenome,
- MeSH
- anotace sekvence MeSH
- Fusarium genetika MeSH
- genom fungální * MeSH
- genom mitochondriální * MeSH
- mitochondriální DNA genetika MeSH
- párování bází genetika MeSH
- RNA transferová genetika MeSH
- zastoupení bazí genetika MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Názvy látek
- mitochondriální DNA MeSH
- RNA transferová MeSH
