Aeromonas P2973 was isolated from the water of a brook in a cavern in the Czech Republic. This isolate could not be biochemically identified at the species level, considering all updated species descriptions. Subsequent extensive phenotypic characterisation, DNA-DNA hybridisation, 16S rRNA gene sequencing and a Multi-Locus Phylogenetic Analysis (MLPA) of the concatenated sequence of 7 housekeeping genes (gyrB, rpoD, recA, dnaJ, gyrA, dnaX and atpD; 4705 bp) was employed in an attempt to ascertain the taxonomy of this isolate. Based on this polyphasic approach, we describe a novel species of the genus Aeromonas, for which the name Aeromonas cavernicola sp. nov. is proposed, with strain CCM7641(T) (DSM24474(T), CECT7862(T)) as the type strain.

• MeSH
• Aeromonas klasifikace   genetika   izolace a purifikace   fyziologie   MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• DNA bakterií chemie   genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• hybridizace nukleových kyselin MeSH
• jeskyně MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• molekulární typizace MeSH
• ribozomální DNA chemie   genetika   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• shluková analýza MeSH
• sladká voda mikrobiologie   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• transmisní elektronová mikroskopie MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH
• Názvy látek
• bakteriální proteiny MeSH
• DNA bakterií MeSH
• ribozomální DNA MeSH
• RNA ribozomální 16S MeSH

Nine Aeromonas strains having a brown exopigment were isolated during the microbiological examination of river water. These brown-pigmented aeromonads were characterized by the phenotyping, fatty-acid methyl-ester analysis and ribotyping. All methods identically confirmed that the group of brown-pigmented aeromonads is quite heterogeneous. Apart from the Aeromonas media taxon, the brown-pigmented aeromonads in river water were represented also by strains of A. allosaccharophila and A. salmonicida subsp. pectinolytica.

• MeSH
• Aeromonas klasifikace   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• biologické pigmenty metabolismus   MeSH
• fylogeneze MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• sladká voda mikrobiologie   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Názvy látek
• biologické pigmenty MeSH