B. pertussis isolates from 1964-2015 obtained from CR will be analysed by the following molecular methods: multilocus variable-number tandem-repeat analysis, sequencing of the ptxA/C, prnA and fim genes, and multilocus sequence typing. The study set will include 190 isolates of B. pertussis. The data will be used for analysing clonal and antigenic shifts in BP following the countrywide vaccination with the whole-cell and later with acellular pertussis vaccines in the period 1964-2015. The project is expected to answer the question whether there are new lines of B. pertussis in CR, which have the ability to spread in the vaccinated population. If so, the results of the study would be served as a basis for the draft update of vaccination strategies in CR. The fifty-year span study design is significant worldwide. The providing of B. pertussis molecular characteristics to the international databases will be relevant to the development of a novel more efficient vaccine against pertussis

V navrhovaném projektu budou izoláty B. pertussis z celé ČR z období 1964-2015 studovány molekulárními metodami: multilocus variable number tandem repeat analysis (MLVA) a sekvenací genů ptxA, prnA, fim, promotoru ptxP, a vybrané izoláty metodou multilocus sequence typing (MLST). Předpokládaná velikost studovaného souboru je 190 izolátů B. pertussis. Bude sledováno, zda v ČR došlo ke genetickému a antigennímu posunu B. pertussis v průběhu plošného očkování celobuněčnou a později acelulární vakcínou v období 1964-2015. Projekt by měl zodpovědět otázku, zda se v ČR objevují nové linie B. pertussis, které mají schopnost šířit se i v proočkované populaci. V kladném případě by výsledky studie sloužily jako podklad pro návrh aktualizace vakcinační strategie v ČR. Pokrytí padesátiletého období je významné i z mezinárodního hlediska. Poskytnutí molekulárních charakteristik B. pertussis do mezinárodních databází rozšíří poznatky potřebné k vývoji nové účinnější vakcíny proti pertusi.

Doba řešení: 2013-2015

Obsahuje literaturu