Objevili jsme nový subtyp B prekurzorové leukémie s nestabilitou imunofenotypu směrem k monocytární linii (switching ALL – swALL). Pomocí celogenonomových metod budeme analyzovat epi/genetické pozadí swALL a vybraných případů leukémií smíšeného fenotypu (Mixed phenotype leukemia – MPAL). Detekce minimální reziduální nemoci orientovaná na B řadu typicky selhává u pacientů s swALL. Budou vyvíjeny nové přístupy, které zohlední výskyt maligních buněk ve více než jedné linii. U swALL jsme zjistili zvýšení exprese transkripčního faktoru C/EBP? a předpokládáme, že se jedná o klíčový faktor v liniovém přesmyku. Pomocí lentivirového systému zvýšíme expresi C/EBP? v leukemických liniích a primárních blastech. SwALL a MPAL leukémie představují jednotky s diagnostickou a léčebnou nejistotou. Centrální databáze pacientů s swALL a MPAL vytvořená v našem centru, která sbírá data o těchto pacientech z více než 10 zemí umožní definovat prognózu těchto pacientů. Optimalizace cytometrické reziduální nemoci a poznatky z celogenomových metod zpřesní diagnostiku leukémií s fenotypovou plasticitou.; We identified a new subtype of B cell precursor leukemia with remarkable immunophenotypic instability towards monocytic lineage (switching ALL – swALL). We will use high-throughput methods (methylome, exome and transcriptome sequencing) to unravel its epi/genetic background. As B cell oriented flow cytometric minimal residual disease (FC MRD) assessment often fails in swALLs we will develop an alternative FC MRD approach. Expression of transcription factor CEBPA is increased in swALLs and appears important in the lineage switch. We will alter CEBPA expression in vitro to test its impact on ALL cell lines and primary samples. SwALL as well as Mixed phenotype leukemias are associated with diagnostic and treatment uncertainty. We will use central database established in our center (recruiting samples from over 15 countries) to define the prognosis of these ALL subtypes. The improved FC MRD and whole genome screening will improve diagnosis, will assist in better treatment choices and possibly will also point to novel therapeutic targets in leukemic cases with phenotypic plasticity.

Phenotypic plasticity of leukemic cells and its genetic background - implication for therapy and minimal residual disease assessment

Doba řešení: 2015-2018

Obsahuje literaturu