Chronická lymfocytární leukémie (CLL) se vyznačuje vysokou heterogenitou klinického průběhu a molekulárních vlastností maligních B lymfocytů. CLL má klonální charakter a díky tomu je možné popsat každý případ CLL jedinečnou přestavbou imunoglobulinových genů (IG), kódující B buněčný receptor. Publikované molekulárně-biologické analýzy dokládají význam antigenní stimulace u CLL, což je podpořeno také výsledky epidemiologických studií. Vysokokapacitní sekvenační technologie dosud nebyly široce využívány ve výzkumu IG kvůli řadě metodických nedostatků. Navrhovaný projekt si klade za cíl zavést moderní technologii vysokokapacitního sekvenování IG a provést národní screening nově diagnostikovaných CLL pacientů. Data generovaná pomocí sekvenování budou podrobně studována ve vztahu ke klinickému průběhu CLL, laboratorním parametrům a epidemiologickým nálezům. Abychom dosáhli vytyčených cílů, hodláme provést epidemiologickou studii nově diagnostikovaných CLL na národní úrovni. Jako prostředek plnění cílů také využijeme a dále rozšíříme národní databázi CLL pacientů CLLEAR.; Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is characterized by extraordinary heterogeneity concerning clinical presentation and molecular features. As the clonal disease of B lymphocytes, each case can be described by a specific immunoglobulin gene (IG) encoding for the B cell receptor. Extensive molecular evidence was provided on antigen stimulation operation in CLL, which is also supported by epidemiological studies. High-throughput sequence analysis has not been applied extensively in research focused on IG due to several limitations. The proposed project aims to expertly implement advanced methodology for the high-throughput IG sequence analysis to produce, manage and delve into extensive immunogenetic sequence datasets in CLL. Furthermore the obtained data will be associated with clinical, molecular and epidemiological features of CLL cases as these will be collected through the purpose-specific survey among Czech CLL patients. An extensive national-wide CLL database CLLEAR containing data on clinical course and molecular biomarkers will be used and extended during the project.

Analysis of clonal heterogeneity in chronic lymphocytic leukemia using next generation sequencing of B cell receptor. A national study

Doba řešení: 2015-2018

Obsahuje literaturu