Malignant melanoma represents the most aggressive type of skin cancer with high metastatic potential and poor prognosis. Better understanding of molecular mechanisms involved in pathogenesis of melanoma and identification of novel biomarkers is needed for precise diagnostic classification and prediction of therapeutical outcomes. Here we aim to perform a comprehensive study employing next-generation sequencing, in situ hybridisation and immunohistochemical analysis to identify new defects in oncogenes and tumour suppressor genes involved in melanoma, protein expression and characterization of stromal microenvironment. Selected mutations will be functionally tested in culture of melanocytes, focusing mainly on their role in DNA damage response and cell cycle checkpoints. Identified genetic changes will be correlated with histopathological findings, immunohistochemical profile and clinical data. We expect deepening of known and identification of new markers allowing better prediction, diagnosis and treatment of melanoma.

Maligní melanom (MM) představuje nejagresivnější typ kožních nádorů s vysokým metastatickým potenciálem a nepříznivou prognózou. Rozvoj poznatků týkajících se molekulárních mechanismů podmiňujících rozvoj MM a nalezení nových biomarkerů je potřebné pro přesnou diagnostiku a volbu léčebných postupů. V předkládaném projektu plánujeme provést komplexní studii založenou na sekvenování nové generace, in situ hybridizaci a imunohistochemické analýze se zaměřením na defekty v onkogenech a tumor supresorových genech zapojených do rozvoje MM, expresi proteinů a charakteristiku stromálního mikroprostředí. Funkční význam vybraných mutací bude dále testován na kulturách melanocytů, především se zaměřením na jejich roli v odpovědi na poškození DNA a regulaci buněčného cyklu. Nalezené změny na genetické úrovni budou korelovány s histopatologickým obrazem, imunohistochemickým profilem a s klinickými daty. Očekáváme prohloubení znalostí o známých a identifikaci nových biomarkerů umožňujících lepší predikci, diagnostiku a léčbu MM.

Analysis of stromal microenvironment, molecular and immunohistochemical aspects of malignant melanoma

Doba řešení: 2016-2019

Obsahuje literaturu