The aim of the project is to evaluate the applicability of high throughput sequencing (HTS) as a tool for complex characterization of oral microbiome dynamics and thus for early diagnosis of risk and onset of periodontitis and for monitoring of treatment. The 7-year long-term study exploring the dynamics of changes in the oral microbiome composition in already established group of 20 initially healthy subjects and a control group of patients with chronic periodontitis will document in detail the transformation of "healthy" bacterial biofilm into the periodontal one. The HTS will be employed also for monitoring of oral microbiome during and after the therapy of a group of 60 patients with aggressive periodontitis treated by either of two standard procedures. Comparison of outputs of both experiments will reveal, whether the composition of subgingival biofilm differs in chronic and aggressive periodontitis. The complex methodological procedure for HTS integration into system of early diagnosis and treatment of patients with periodontitis will be developed.

Cílem projektu je posoudit využitelnost vysokoúčinných metod paralelního sekvenování (HTS – high-throughput sequencing) jako nástroje pro komplexní charakterizaci dynamiky mikrobiomu dutiny ústní a tím pro včasnou diagnózu rizika i nástupu parodontitidy a pro sledování postupu léčby. V dlouhodobé studii, sledující dynamiku změn složení orálního mikrobiomu v již ustaveném souboru 20 původně zdravých osob i kontrolní skupiny pacientů s chronickou parodontitidou, bude podrobně zdokumentována transformace „zdravého“ bakteriálního biofilmu na parodontální v průběhu celkem sedmiletého monitorovacího období. Na souboru 60 pacientů s agresivní parodontitidou léčených dvěma různými standartními postupy bude HTS využita pro monitorování orálního mikrobiomu v průběhu vlastní terapie i v následném období. Porovnání výstupů obou experimentů poskytne informaci, zda a jak se liší kompozice subgingiválního biofilmu u chronické a agresivní parodontitidy. Pro uživatelská medicínská pracoviště bude vypracován komplexní metodický postup pro včasnou diagnózu i monitorování průběhu léčby.

Use of parallel sequencing methods for monitoring of oral microbiome dynamics in the course of periodontal disease development and therapy

Doba řešení: 2017-2021

Obsahuje literaturu