The project aims at characterisation of the role of genetic variation in the immune genes including those of HLA complex in the development / clinical course of pulmonary sarcoidosis. Recent methods allowing detailed discrimination of HLA alleles/haplotypes (NGS) will be utilised and comparisons will be made between HLA and a range of patients ́clinical laboratory data. To complement HLA analyses, gene polymorphisms co-located within MHC on the 6th chromosome such as BTNL2, TNFA will be genotyped by MassArray together with other relevant variants nominated by previous GWAS. The project may result in identifying an association profile of specific sarcoidosis clinical phenotypes with particular combinations of HLA alleles and/or linked gene variants and thus represents major step in applying immunogenetics into management of sarcoidosis patients which still awaits personalised medicine approach. By providing NGS HLA data in sarcoidosis for the first time ever, the project will bring priority results and thus will be a cornerstone for expanded, international studies.

Projekt zamýšlí charakterizovat úlohu variability v genech imunitního systému včetně HLA na vývoji a klinickém průběhu plicní sarkoidózy. Použití recentních metod umožňujících detailní identifikaci HLA alel/haplotypů (NGS) umožní srovnání výsledků HLA genotypizace se spektrem klinických a laboratorních dat pacientů. Dále, polymorfismy genů lokalizovaných v MHC oblasti na 6.chromozomu (např. BTNL2, TNFA), společně s dalšími relevantními genovými variantami nominovanými předchozími GWAS studiemi, budou stanoveny metodou MassArray k doplnění HLA analýz. Výsledkem projektu může být identifikace profilu asociací jednotlivých klinických fenotypů sarkoidózy se specifickými kombinacemi HLA alel a/nebo dalších genových variant, což představuje zásadní krok v translaci poznatků imunogenetiky do péče o pacienty se sarkoidózou, tj. oblasti, kde je personalizovaná medicína na samém počátku. Navíc, vyšetřením HLA u pacientů se sarkoidózou na úrovni NGS (vůbec poprvé), projekt slibuje přinést prioritní výsledky a tak položit základní kámen návazným rozšířeným studiím mezinárodního charakteru.

Immunogenetic molecular profile of sarcoidosis: significance for disease course prediction

Doba řešení: 2018-2022

Obsahuje literaturu