Kardiomyopatie (CMP) jsou heterogenní skupinou onemocnění myokardu se značnou nemocností a úmrtností. Významná část CMP je dědičná. Drobné abnormality srdeční funkce mohou být detekovány 3D volumetrickou analýzou a analýzou globálního longitudiálního namáhání. Ve srovnání se standardní echokardiografií jsou tyto metody přesnější a mohou tak usnadnit včasnou detekci dysfunkce myokardu v rodinách s dědičnými CMP. Laboratorní diagnostika CMP se výrazně zdokonalila použitím sekvenačních metod nové generace (NGS). NGS však často identifikuje velké množství genetických variant neznámého klinického významu. K doplnění rozšířených klinických a bioinformatických validačních nástrojů navrhujeme vyvinout modely kardiomyocytů založené na indukovaných pluripotentních kmenových buňkách a testovat tyto kultury pomocí nového multimetodologického protokolu. Očekává se, že tento přístup zlepší interpretaci datových souborů NGS vytvořených ve studovaných rodinách s CMP a usnadní tak klinickou diagnostiku a celkové porozumění patogenezi CMP.; Cardiomyopathies (CMPs) are a heterogeneous group of myocardial diseases with substantial morbidity and mortality. A significant fraction of CMPs are hereditary. Subtle abnormalities of cardiac function can be detected by 3D volumetry and analyses of global longitudinal strain. Compared to standard echocardiography, these methods are more precise and may thus facilitate early detection of myocardial dysfunction in families with hereditary CMPs. CMP laboratory diagnostics recently substantially benefit(ed) from use of next-generation sequencing (NGS) techniques. However, NGS often identifies large numbers of genetic variants of unknown clinical significance. To complement the enhanced clinical and bioinformatic validation tools, we propose to develop cardiomyocyte models based on induced pluripotent stem cells and test these cultures using a novel multi-methodological protocol. This approach is expected to improve interpretation of the NGS datasets generated in studied CMP families and thus facilitate clinical diagnostics and the overall understanding of CMP pathogenesis.

Improved Interpretation of Next Generation Sequencing Datasets in Patients with Inherited Cardiomyopathy Using Functional Models Based on Induced Pluripotent Stem Cells and Advanced Cardiac Imaging in Families

Doba řešení: 2019-2023

Obsahuje literaturu