-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Průkaz tuberkulózy pomocí molekulárně genetických metod: polymerázové řetězové reakce (PCR) a amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) testů
[Demonstration of tuberculosis using molecular genetic methods polymerase chain reaction (PCR) and amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) test]
Šárka Lásiková, M. Buncová, B. Sýkorová
Jazyk čeština, angličtina Země Česko
- MeSH
- bakteriologické techniky MeSH
- diagnostické techniky molekulární MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- lidé MeSH
- molekulární sondy - techniky MeSH
- Mycobacterium tuberculosis genetika izolace a purifikace růst a vývoj MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- tuberkulóza diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Úvod: Tuberkulóza je infekční onemocnění, které ve většině případů probíhá chronicky. Vyvolavatelem je bakterie Mycobacterium tuberculosis. Základem průkazu je mikroskopické a kultivační vyšetření. Mikroskopie je málo citlivá, kultivace zdlouhavá. Jednou z možností zrychlení diagnostiky je použití molekulárně genetických metod. Cíl práce: Porovnání molekulárně genetického průkazu mykobakterií s kultivací. Metoda: Na průkaz nukleové kyseliny Mycobacterium tuberculosis komplex byly použity dvě metody - polymerázová řetězová reakce (PCR) a Mycobacterium tuberculosis direct test (MTD). Vyšetřeno bylo 647 vzorků. Z toho 275 vzorků bylo testováno pomocí PCR a 372 materiálů bylo vyšetřeno setem MTD. Současně byla u každého vzorku založena paralelní kultivace. Výsledky: Z celkového počtu vzorků 275 testovaných pomocí PCR byla mykobakteriální DNA prokázána u 18 (6,5 %). Z 372 materiálů testovaných metodou MTD byla mykobakteriální RNA prokázána celkem u 27 (7 %). Z 18 PCR pozitivních nebyly současně mykobakterie vykultivovány u 6 (33 %) vzorků. Z 27 pozitivních průkazů RNA pomocí metody MTD nebylo s paralelní kultivací v souladu 17 (62 %) vzorků. Naopak kultivačně ověřená diagnóza tuberkulózy bez pozitivní PCR byla nalezena u 2 (0,7 %) pacientů. Neshoda MTD a kultivace nastala také u 2 vzorků (0,5 %). Závěr: Molekulárně genetické metody podstatně zrychluji diagnostiku tuberkulózy. Velký význam má tato metoda u paubacilárních materiálů a také u vzorků jedinečných a neopakovatelných (tkáňové biopsie, uzliny, mozkomíšní mok). Vzhledem k možným falešně pozitivním výsledkům musí však být vždy paralelně ověřena mikroskopickým a kultivačním vyšetřením.
Introduction: Tuberculosis is a communicable disease, in most instances with a chronic course. The aetiological agent is Mycobacterium tubercuiosis. Its demonstration is based on microscopic investigations and cultures. Microscopy is not sufficiently sensitive, while cultures are lengthy. One of the possibilities of speeding up diagnosis are molecular genetic methods. Purpose of the study. To compare the demonstration of mycobacteria using molecular genetic methods with the results of cultures. Methods: We used two methods to demonstrate the nucleic acid complex of Mycobacterium tuberculosis - the polymerase chain reaction (PCR) and the Amplified Mycobacterium tuberculosis direct test (AMTD). We investigated 647 samples. Out of these, 275 samples were tested with PCR and 372 were investigated with a AMTD set. At the same time we started for each sample a parallel culture. Results: In 275 samples, out of a total of 647, which were analysed with PCK mycobacterial DNA was demonstrated in 18 (6.5 %). Out of the 372 samples investigated with AMTD, mycobacterial RNA was demonstrated in 27 (7 %). Out of the 18 PRC positive sampies, 6 (13 %) did not yield a positive mycobacterial culture. Out of the 27 positive results RNA with the AMTD method 17 did not yield positive cultures. On the other hand, a diagnosis of tuberculosis verified by cultures without a positive PCR was found in 2 patients (0.7 %). Disagreement between the results of AMTD and cultures was also found in 2 samples (0.5 %). Conclusions: Molecular genetic methods substantially speed up the diagnosis of tuberculosis. These methods are particularly important in cases of paucibacillary material and of unique and unrepeatable samples (tissues biopsies, nodes, cerebrospinal fluid). Given the possibility of false positive results, parallel verification by microscopy and cultures is essential.
Demonstration of tuberculosis using molecular genetic methods polymerase chain reaction (PCR) and amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) test
Průkaz tuberkulózy pomocí molekulárně genetických metod: polymerázové řetězové reakce (PCR) a amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) testů = The demonstration of tuberculosis using molecular genetic methods polymerase chain reaction (PCR) and amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) test /
The demonstration of tuberculosis using molecular genetic methods polymerase chain reaction (PCR) and amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) test /
Lit. 24
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc07005756
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20180404102640.0
- 008
- 070504s2006 xr u cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $a eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Lásiková, Šárka $4 aut $7 xx0074078
- 245 10
- $a Průkaz tuberkulózy pomocí molekulárně genetických metod: polymerázové řetězové reakce (PCR) a amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) testů = $b The demonstration of tuberculosis using molecular genetic methods polymerase chain reaction (PCR) and amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) test / $c Šárka Lásiková, M. Buncová, B. Sýkorová
- 246 11
- $a Demonstration of tuberculosis using molecular genetic methods polymerase chain reaction (PCR) and amplified Mycobacterium tuberculosis direct (AMTD) test
- 314 __
- $a OKM FN Na Bulovce, Praha 8, CZ
- 504 __
- $a Lit. 24
- 520 3_
- $a Úvod: Tuberkulóza je infekční onemocnění, které ve většině případů probíhá chronicky. Vyvolavatelem je bakterie Mycobacterium tuberculosis. Základem průkazu je mikroskopické a kultivační vyšetření. Mikroskopie je málo citlivá, kultivace zdlouhavá. Jednou z možností zrychlení diagnostiky je použití molekulárně genetických metod. Cíl práce: Porovnání molekulárně genetického průkazu mykobakterií s kultivací. Metoda: Na průkaz nukleové kyseliny Mycobacterium tuberculosis komplex byly použity dvě metody - polymerázová řetězová reakce (PCR) a Mycobacterium tuberculosis direct test (MTD). Vyšetřeno bylo 647 vzorků. Z toho 275 vzorků bylo testováno pomocí PCR a 372 materiálů bylo vyšetřeno setem MTD. Současně byla u každého vzorku založena paralelní kultivace. Výsledky: Z celkového počtu vzorků 275 testovaných pomocí PCR byla mykobakteriální DNA prokázána u 18 (6,5 %). Z 372 materiálů testovaných metodou MTD byla mykobakteriální RNA prokázána celkem u 27 (7 %). Z 18 PCR pozitivních nebyly současně mykobakterie vykultivovány u 6 (33 %) vzorků. Z 27 pozitivních průkazů RNA pomocí metody MTD nebylo s paralelní kultivací v souladu 17 (62 %) vzorků. Naopak kultivačně ověřená diagnóza tuberkulózy bez pozitivní PCR byla nalezena u 2 (0,7 %) pacientů. Neshoda MTD a kultivace nastala také u 2 vzorků (0,5 %). Závěr: Molekulárně genetické metody podstatně zrychluji diagnostiku tuberkulózy. Velký význam má tato metoda u paubacilárních materiálů a také u vzorků jedinečných a neopakovatelných (tkáňové biopsie, uzliny, mozkomíšní mok). Vzhledem k možným falešně pozitivním výsledkům musí však být vždy paralelně ověřena mikroskopickým a kultivačním vyšetřením.
- 520 9_
- $a Introduction: Tuberculosis is a communicable disease, in most instances with a chronic course. The aetiological agent is Mycobacterium tubercuiosis. Its demonstration is based on microscopic investigations and cultures. Microscopy is not sufficiently sensitive, while cultures are lengthy. One of the possibilities of speeding up diagnosis are molecular genetic methods. Purpose of the study. To compare the demonstration of mycobacteria using molecular genetic methods with the results of cultures. Methods: We used two methods to demonstrate the nucleic acid complex of Mycobacterium tuberculosis - the polymerase chain reaction (PCR) and the Amplified Mycobacterium tuberculosis direct test (AMTD). We investigated 647 samples. Out of these, 275 samples were tested with PCR and 372 were investigated with a AMTD set. At the same time we started for each sample a parallel culture. Results: In 275 samples, out of a total of 647, which were analysed with PCK mycobacterial DNA was demonstrated in 18 (6.5 %). Out of the 372 samples investigated with AMTD, mycobacterial RNA was demonstrated in 27 (7 %). Out of the 18 PRC positive sampies, 6 (13 %) did not yield a positive mycobacterial culture. Out of the 27 positive results RNA with the AMTD method 17 did not yield positive cultures. On the other hand, a diagnosis of tuberculosis verified by cultures without a positive PCR was found in 2 patients (0.7 %). Disagreement between the results of AMTD and cultures was also found in 2 samples (0.5 %). Conclusions: Molecular genetic methods substantially speed up the diagnosis of tuberculosis. These methods are particularly important in cases of paucibacillary material and of unique and unrepeatable samples (tissues biopsies, nodes, cerebrospinal fluid). Given the possibility of false positive results, parallel verification by microscopy and cultures is essential.
- 650 _2
- $a tuberkulóza $x diagnóza $7 D014376
- 650 _2
- $a Mycobacterium tuberculosis $x genetika $x izolace a purifikace $x růst a vývoj $7 D009169
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
- 650 _2
- $a diagnostické techniky molekulární $7 D025202
- 650 _2
- $a bakteriologické techniky $7 D001431
- 650 _2
- $a senzitivita a specificita $7 D012680
- 650 _2
- $a molekulární sondy - techniky $7 D015336
- 650 _2
- $a finanční podpora výzkumu jako téma $7 D012109
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 700 1_
- $a Buncová, M. $4 aut
- 700 1_
- $a Sýkorová, B. $4 aut
- 700 1_
- $a Gabrielová, A. $4 aut
- 700 1_
- $a Horová, Blanka. $4 aut
- 700 1_
- $a Nyčová, E. $4 aut
- 700 1_
- $a Machová, A. $4 aut
- 700 1_
- $a Moravcová, L. $4 aut
- 773 0_
- $w MED00011029 $t Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $g Roč. 12, č. 5 (2006), s. 195-199 $x 1211-264X
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1913 $c 339 b $y 0 $z 0
- 913 __
- $a CZ $b MSM 0021620812 VZ
- 990 __
- $a 20070517 $b ABA008
- 991 __
- $a 20180404102720 $b ABA008
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2006 $b Roč. 12 $c č. 5 $d s. 195-199 $i 1211-264X $m Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $x MED00011029
- LZP __
- $b přidání abstraktu