-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Selecting relevant information for medical decision support with application in cardiology [Výběr relevantních informací pro podporu rozhodování v medicíne s aplikací v kardiologii]
Jan Kalina, Libor Seidl, Karel Zvára, Hana Grünfeldová, Dalibor Slovák, Jana Zvárová
Jazyk angličtina, čeština Země Česko Médium elektronický zdroj
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- MeSH
- diagnostické techniky kardiovaskulární * přístrojové vybavení statistika a číselné údaje trendy MeSH
- exprese genu MeSH
- kardiologie * metody přístrojové vybavení statistika a číselné údaje MeSH
- kardiovaskulární nemoci diagnóza klasifikace MeSH
- klinické zkoušky jako téma MeSH
- počítače * využití MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
pro podporu rozhodování ve forme internetové klasifikacní služby. Protože u systému na podporu rozhodování casto nejsou jednotlivé cásti analýzy dat vhodné pro vysoce dimenzionální data, je treba venovat zvláštní pozornost sofistikovanému výberu nejduležitejších promenných ješte pred ucením klasifikacního pravidla. Metody: Vytvorili jsme prototyp systému pro podporu diagnostického rozhodování s názvem SIR. Systém je schopen ze souboru vysoce dimenzionálních merení vybrat ty nejpodstatnejší promenné pomocí dopredné procedury pro optimalizaci rozhodovacího kritéria, což umožnuje vytvorit spolehlivé klasifikacní pravidlo. Výsledky: Vytvorený prototyp byl testován na vzorku pacientu z kardiologické studie. Prostrednictvím systému SIR byla extrahována informace z kardiologické klinické studie, obsahující jak klinická data, tak i data genových expresí. Úroven klasifikace byla hodnocena pomocí krížové validacní studie. Záver: Navržený klasifikacní systém muže na základe informací získaných z dostupné klinické studie být užitecný pro lékare v primární péci jako podpora v jejich rozhodovací úloze. Velmi vhodný je také pro analýzu vysoce dimenzionálních dat, napr. merení genových expresí.
Objectives: The aim of our work was to implement a prototype of a decision support system which has the form of a web-based classification service. Because the data analysis component of decision support systems often happens to be unsuitable for high-dimensional data, special attention must be paid to the sophisticated selection of the most relevant variables before learning the classification rule. Methods: We implemented a prototype of a diagnostic decision support system called SIR. The system has the ability to select the most relevant variables based on a set of high-dimensional measurements by means of a forward procedure optimizing a decision-making criterion. This allows to learn a reliable classification rule. Results: The implemented prototype was tested on a sample of patients involved in a cardiology study. We used SIR to perform an information extraction from a cardiological clinical study containing both clinical and gene expression data. The classification performance was evaluated by means of a cross validation study. Conclusions: The proposed classification system can be useful for clinicians in primary care to support their decision-making tasks with relevant information extracted from any available clinical study. It is especially suitable for analyzing high-dimensional data, e.g. gene expression measurements.
Charles University Prague 1st Faculty of Medicine
European Center for Medical Informatics Statistics and Epidemiology
Institute of Computer Science of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Výběr relevantních informací pro podporu rozhodování v medicíne s aplikací v kardiologii
Selecting relevant information for medical decision support with application in cardiology [elektronický zdroj] /
Citace poskytuje Crossref.org
Literatura
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc14040304
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20180615084350.0
- 007
- cr|cn|
- 008
- 140105s2013 xr fs 000 0eng||
- 009
- eAR
- 024 7_
- $a 10.24105/ejbi.2013.09.1.2 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $d ABA008 $e AACR2 $b cze
- 041 0_
- $a eng $a cze
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Kalina, Jan. $7 xx0207698 $u European Center for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology; Institute of Computer Science of the Academy of Sciences of the Czech Republic
- 245 10
- $a Selecting relevant information for medical decision support with application in cardiology $h [elektronický zdroj] / $c Jan Kalina, Libor Seidl, Karel Zvára, Hana Grünfeldová, Dalibor Slovák, Jana Zvárová
- 246 31
- $a Výběr relevantních informací pro podporu rozhodování v medicíne s aplikací v kardiologii
- 504 __
- $a Literatura
- 520 3_
- $a pro podporu rozhodování ve forme internetové klasifikacní služby. Protože u systému na podporu rozhodování casto nejsou jednotlivé cásti analýzy dat vhodné pro vysoce dimenzionální data, je treba venovat zvláštní pozornost sofistikovanému výberu nejduležitejších promenných ješte pred ucením klasifikacního pravidla. Metody: Vytvorili jsme prototyp systému pro podporu diagnostického rozhodování s názvem SIR. Systém je schopen ze souboru vysoce dimenzionálních merení vybrat ty nejpodstatnejší promenné pomocí dopredné procedury pro optimalizaci rozhodovacího kritéria, což umožnuje vytvorit spolehlivé klasifikacní pravidlo. Výsledky: Vytvorený prototyp byl testován na vzorku pacientu z kardiologické studie. Prostrednictvím systému SIR byla extrahována informace z kardiologické klinické studie, obsahující jak klinická data, tak i data genových expresí. Úroven klasifikace byla hodnocena pomocí krížové validacní studie. Záver: Navržený klasifikacní systém muže na základe informací získaných z dostupné klinické studie být užitecný pro lékare v primární péci jako podpora v jejich rozhodovací úloze. Velmi vhodný je také pro analýzu vysoce dimenzionálních dat, napr. merení genových expresí.
- 520 9_
- $a Objectives: The aim of our work was to implement a prototype of a decision support system which has the form of a web-based classification service. Because the data analysis component of decision support systems often happens to be unsuitable for high-dimensional data, special attention must be paid to the sophisticated selection of the most relevant variables before learning the classification rule. Methods: We implemented a prototype of a diagnostic decision support system called SIR. The system has the ability to select the most relevant variables based on a set of high-dimensional measurements by means of a forward procedure optimizing a decision-making criterion. This allows to learn a reliable classification rule. Results: The implemented prototype was tested on a sample of patients involved in a cardiology study. We used SIR to perform an information extraction from a cardiological clinical study containing both clinical and gene expression data. The classification performance was evaluated by means of a cross validation study. Conclusions: The proposed classification system can be useful for clinicians in primary care to support their decision-making tasks with relevant information extracted from any available clinical study. It is especially suitable for analyzing high-dimensional data, e.g. gene expression measurements.
- 650 12
- $a kardiologie $x metody $x přístrojové vybavení $x statistika a číselné údaje $7 D002309
- 650 12
- $a počítače $x využití $7 D003201
- 650 12
- $a diagnostické techniky kardiovaskulární $x přístrojové vybavení $x statistika a číselné údaje $x trendy $7 D003935
- 650 _2
- $a kardiovaskulární nemoci $x diagnóza $x klasifikace $7 D002318
- 650 _2
- $a exprese genu $7 D015870
- 650 _2
- $a statistika jako téma $7 D013223
- 650 _2
- $a klinické zkoušky jako téma $7 D002986
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Seidl, Libor, $d 1978- $7 xx0134416 $u European Center for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology; Charles University in Prague, First Faculty of Medicine
- 700 1_
- $a Zvára, Karel, $d 1943- $7 jk01152879 $u European Center for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology; Charles University in Prague, First Faculty of Medicine
- 700 1_
- $a Grünfeldová, Hana $7 _BN004545 $u European Center for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology; Municipal Hospital in Cáslav
- 700 1_
- $a Slovák, Dalibor $7 xx0225345 $u European Center for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology; Institute of Computer Science of the Academy of Sciences of the Czech Republic; Charles University in Prague, First Faculty of Medicine
- 700 1_
- $a Zvárová, Jana, $d 1943-2017 $7 nlk19990074087 $u European Center for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology; Institute of Computer Science of the Academy of Sciences of the Czech Republic; Charles University in Prague, First Faculty of Medicine
- 773 0_
- $t European journal for biomedical informatics $x 1801-5603 $g Roč. 9, č. 1 (2013), s. 2-6 $w MED00173462
- 910 __
- $a ABA008 $z 0 $y 4
- 990 __
- $a 20140105160254 $b ABA008
- 991 __
- $a 20180615084606 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1004700 $s 838809
- BAS __
- $a 3 $a 4
- BMC __
- $a 2013 $b 9 $c 1 $d 2-6 $i 1801-5603 $m European Journal for Biomedical Informatics $n Eur. J. Biomed. Inform. (Praha) $x MED00173462
- LZP __
- $c NLK185 $d 20140206 $a NLK 2014-03/vt