-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Kvantitativní hmotnostní spektrometrie a její využití v onkologii
[Quantitative mass spectrometry and its utilization in oncology]
Hernychová L., Dvořáková P., Michalová E., Vojtěšek B.
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- Klíčová slova
- kvantitativní proteomika, SILAC,
- MeSH
- hmotnostní spektrometrie * metody MeSH
- izotopové značení MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery * analýza metabolismus MeSH
- nádorové buněčné linie MeSH
- nádorové buňky kultivované * MeSH
- nádorové proteiny * analýza metabolismus MeSH
- nádory diagnóza MeSH
- proteomika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Nádory jsou geneticky a klinicky velmi různorodá onemocnění, a proto se v poslední době řada proteomických studií zabývá hledáním biomarkerů, které by usnadnily prognostiku, diagnostiku či léčbu onkologických onemocnění. Účinným nástrojem je hmotnostní spektrometrie umožňující identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci biomolekul v komplexních biologických vzorcích. Prvním krokem vedoucím k selekci biomarkerů je tzv. discovery proteomika, jejímž cílem je detailní analýza vzorků směřující ke zmapování a porovnání přítomných proteinů a výběru vhodných kandidátů na potenciální biomarkery. V dalším kroku proteomické analýzy probíhá verifikace vybraných biomarkerů tzv. cílenou (targeted) proteomikou, jejímž úkolem je ověření přítomnosti a kvantity daného proteinu v analyzovaných, přesně klinicky definovaných vzorcích. Předložený článek je zaměřen na popis různých typů metod vhodných pro kvantitativní analýzu proteinů využívající hmotnostní spektrometrií.
Cancers are genetically and clinically very heterogeneous diseases; therefore, various proteomic studies have been trying to find biomarkers which can facilitate prognosis, diagnosis or treatment of these oncological diseases. The mass spectrometry is an effective tool for identification, quantitation, and characterization of biomolecules in the complex biological samples. The first step suitable for selection of biomarkers called discovery proteomics provides a detailed analysis of the samples contributing to the identification of proteins, comparison of their presence in the samples, and selection of the convenient candidates for the prospective biomarkers. The next step of proteomics analysis is directed towards verification of chosen biomarkers with the approach called targeted proteomics. This technique evaluates presence and quantity of the proteins (biomarkers) in clinically precisely defined samples. This article focuses on the description of various approaches suitable for the quantitative analysis of the proteins connected with mass spectrometry. Key words: quantitative proteomics – mass spectrometry – protein – biomarker – oncology – cancer This work was supported by the European Regional Development Fund and the State Budget of the Czech Republic (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101) and by MH CZ – DRO (MMCI, 00209805). The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 20. 1. 2014 Accepted: 7. 4. 2014
Quantitative mass spectrometry and its utilization in oncology
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc14062245
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20160426112122.0
- 007
- ta
- 008
- 140623s2014 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 024 __
- $a 10.14735/amko20141s98 $2 doi
- 035 __
- $a (PubMed)24945545
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hernychová, Lenka, $d 1965- $7 xx0073983 $u Regionální centrum aplikované molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno
- 245 10
- $a Kvantitativní hmotnostní spektrometrie a její využití v onkologii / $c Hernychová L., Dvořáková P., Michalová E., Vojtěšek B.
- 246 31
- $a Quantitative mass spectrometry and its utilization in oncology
- 520 3_
- $a Nádory jsou geneticky a klinicky velmi různorodá onemocnění, a proto se v poslední době řada proteomických studií zabývá hledáním biomarkerů, které by usnadnily prognostiku, diagnostiku či léčbu onkologických onemocnění. Účinným nástrojem je hmotnostní spektrometrie umožňující identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci biomolekul v komplexních biologických vzorcích. Prvním krokem vedoucím k selekci biomarkerů je tzv. discovery proteomika, jejímž cílem je detailní analýza vzorků směřující ke zmapování a porovnání přítomných proteinů a výběru vhodných kandidátů na potenciální biomarkery. V dalším kroku proteomické analýzy probíhá verifikace vybraných biomarkerů tzv. cílenou (targeted) proteomikou, jejímž úkolem je ověření přítomnosti a kvantity daného proteinu v analyzovaných, přesně klinicky definovaných vzorcích. Předložený článek je zaměřen na popis různých typů metod vhodných pro kvantitativní analýzu proteinů využívající hmotnostní spektrometrií.
- 520 9_
- $a Cancers are genetically and clinically very heterogeneous diseases; therefore, various proteomic studies have been trying to find biomarkers which can facilitate prognosis, diagnosis or treatment of these oncological diseases. The mass spectrometry is an effective tool for identification, quantitation, and characterization of biomolecules in the complex biological samples. The first step suitable for selection of biomarkers called discovery proteomics provides a detailed analysis of the samples contributing to the identification of proteins, comparison of their presence in the samples, and selection of the convenient candidates for the prospective biomarkers. The next step of proteomics analysis is directed towards verification of chosen biomarkers with the approach called targeted proteomics. This technique evaluates presence and quantity of the proteins (biomarkers) in clinically precisely defined samples. This article focuses on the description of various approaches suitable for the quantitative analysis of the proteins connected with mass spectrometry. Key words: quantitative proteomics – mass spectrometry – protein – biomarker – oncology – cancer This work was supported by the European Regional Development Fund and the State Budget of the Czech Republic (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101) and by MH CZ – DRO (MMCI, 00209805). The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 20. 1. 2014 Accepted: 7. 4. 2014
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 12
- $a nádorové biomarkery $x analýza $x metabolismus $7 D014408
- 650 12
- $a hmotnostní spektrometrie $x metody $7 D013058
- 650 _2
- $a proteomika $7 D040901
- 650 _2
- $a nádory $x diagnóza $7 D009369
- 650 _2
- $a nádorové buněčné linie $7 D045744
- 650 _2
- $a izotopové značení $7 D007553
- 650 12
- $a nádorové buňky kultivované $7 D014407
- 650 12
- $a nádorové proteiny $x analýza $x metabolismus $7 D009363
- 653 00
- $a kvantitativní proteomika
- 653 00
- $a SILAC
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Dvořáková, Petra $7 _AN078791 $u Regionální centrum aplikované molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno
- 700 1_
- $a Michalová, Eva $7 xx0190116 $u Regionální centrum aplikované molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno
- 700 1_
- $a Vojtěšek, Bořivoj, $d 1960- $7 xx0001694 $u Regionální centrum aplikované molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno
- 773 0_
- $w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 27, Supplementum 1 (2014), s. S98-S103
- 773 0_
- $t Postupy a metody v aplikované molekulární onkologii $g (2014), s. S98-S103 $w MED00188581
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2014-supplementum/kvantitativni-hmotnostni-spektrometrie-a-jeji-vyuziti-v-onkologii-48882 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20140623 $b ABA008
- 991 __
- $a 20160426112215 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1030053 $s 860908
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2014 $b 27 $c Supplementum 1 $d S98-S103 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 95383
- BMC __
- $a 2014 $d S98-S103 $m Postupy a metody v aplikované molekulární onkologii $x MED00188581
- LZP __
- $c NLK188 $d 20140711 $b NLK118 $a Meditorial-20140623
