-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Toxigenní profily a EMM typizace Streptococcus pyogenes v České republice v letech 2014 a 2012
[Toxigenic profiles and emm typing of Streptococcus pyogenes in the Czech Republic in 2011 and 2012]
Jana Alboková, Daniela Lžičařová, Jana Kozáková
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu tabulky
- MeSH
- antigeny bakteriální MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální genetika metody MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí * využití MeSH
- sérotypizace MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Streptococcus pyogenes * izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- tabulky MeSH
Streptococcus pyogenes, celosvětově rozšířený patogen, způsobuje celou řadu neinvazivních a invazivních onemocnění od akutní faryngitidy a impetiga po nekrotizující fascitidu a streptokokový syndrom toxického šoku. Cílem práce bylo stanovení toxigenních profilů metodou polymerázové řetězové reakce v reálném čase (RT-PCR) a emm typizace S. pyogenes pro epidemiologické účely a statistické vyhodnocení vztahu emm typu a genů toxigenního profilu k invazivitě onemocnění. V Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Praze bylo v letech 2011–2012 vyšetřeno celkem 111 izolátů S. pyogenes pětadvaceti různých emm typů a 37 toxigenních profilů (streptokokové pyrogenní exotoxiny A-C, F-M, Z, streptokokový superantigen ssa a streptokokový mitogenní exotoxin Z smeZ). 55 izolátů bylo invazivních a 56 neinvazivních. V uvedeném období prevaloval typ emm1 (31,5 %) následovaný typem emm28 (11,7 %) a typem emm12 (9,9 %). U všech izolátů byl potvrzen streptokokový pyrogenní exotoxin B a F (speB a speF). SpeG a smeZ měla většina kmenů (97,3 % a 92,8 %), ssa byl zjištěn u 8,1 % kmenů a speL u 3,6 % kmenů. Nebyla potvrzena statisticky významná souvislost mezi emm typem a invazivitou izolátů ani mezi toxigenním profilem a invazivitou izolátů.
Streptococcus pyogenes, a globally spread pathogen, is the cause of a wide range of invasive and non-invasive diseases, from acute pharyngitis and impetigo to necrotizing fasciitis and streptococcal toxic shock syndrome. The study objectives were toxigenic profiling of S. pyogenes isolates by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) and emm typing for epidemiological purposes and analysis of the relationships between emm types, toxigenesis, and disease invasiveness. In 2011-2012, the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections, National Institute of Public Health, analyzed 111 isolates of S. pyogenes assigned to 25 mm types and 37 toxigenic profiles (streptococcal pyrogenic exotoxins A-C, F-M, and Z, streptococcal superantigen ssa, and streptococcal mitogenic exotoxin Z smeZ). Fiftyfive isolates were invasive and 56 were non-invasive. The most prevalent emm type was emm1 (31.5%), followed by emm28 (11.7%) and emm12 (9.9%). All isolates carried genes for streptococcal pyrogenic exotoxin B and F (speB and speF), most isolates (97.3% and 92.8%) harboured speG and smeZ, respectively, 8.1% of isolates were ssa positive, and 3.6% encoded speL. No statistically significant association was found between emm type or toxigenic profile and invasiveness of isolates.
Toxigenic profiles and emm typing of Streptococcus pyogenes in the Czech Republic in 2011 and 2012
Literatura
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc15009865
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20170207135042.0
- 007
- ta
- 008
- 150313s2014 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $d ABA008 $e AACR2 $b cze
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Alboková, Jana $7 xx0115677 $u NRL pro streptokokové nákazy SZÚ-CEM
- 245 10
- $a Toxigenní profily a EMM typizace Streptococcus pyogenes v České republice v letech 2014 a 2012 / $c Jana Alboková, Daniela Lžičařová, Jana Kozáková
- 246 31
- $a Toxigenic profiles and emm typing of Streptococcus pyogenes in the Czech Republic in 2011 and 2012
- 504 __
- $a Literatura
- 520 3_
- $a Streptococcus pyogenes, celosvětově rozšířený patogen, způsobuje celou řadu neinvazivních a invazivních onemocnění od akutní faryngitidy a impetiga po nekrotizující fascitidu a streptokokový syndrom toxického šoku. Cílem práce bylo stanovení toxigenních profilů metodou polymerázové řetězové reakce v reálném čase (RT-PCR) a emm typizace S. pyogenes pro epidemiologické účely a statistické vyhodnocení vztahu emm typu a genů toxigenního profilu k invazivitě onemocnění. V Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Praze bylo v letech 2011–2012 vyšetřeno celkem 111 izolátů S. pyogenes pětadvaceti různých emm typů a 37 toxigenních profilů (streptokokové pyrogenní exotoxiny A-C, F-M, Z, streptokokový superantigen ssa a streptokokový mitogenní exotoxin Z smeZ). 55 izolátů bylo invazivních a 56 neinvazivních. V uvedeném období prevaloval typ emm1 (31,5 %) následovaný typem emm28 (11,7 %) a typem emm12 (9,9 %). U všech izolátů byl potvrzen streptokokový pyrogenní exotoxin B a F (speB a speF). SpeG a smeZ měla většina kmenů (97,3 % a 92,8 %), ssa byl zjištěn u 8,1 % kmenů a speL u 3,6 % kmenů. Nebyla potvrzena statisticky významná souvislost mezi emm typem a invazivitou izolátů ani mezi toxigenním profilem a invazivitou izolátů.
- 520 9_
- $a Streptococcus pyogenes, a globally spread pathogen, is the cause of a wide range of invasive and non-invasive diseases, from acute pharyngitis and impetigo to necrotizing fasciitis and streptococcal toxic shock syndrome. The study objectives were toxigenic profiling of S. pyogenes isolates by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) and emm typing for epidemiological purposes and analysis of the relationships between emm types, toxigenesis, and disease invasiveness. In 2011-2012, the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections, National Institute of Public Health, analyzed 111 isolates of S. pyogenes assigned to 25 mm types and 37 toxigenic profiles (streptococcal pyrogenic exotoxins A-C, F-M, and Z, streptococcal superantigen ssa, and streptococcal mitogenic exotoxin Z smeZ). Fiftyfive isolates were invasive and 56 were non-invasive. The most prevalent emm type was emm1 (31.5%), followed by emm28 (11.7%) and emm12 (9.9%). All isolates carried genes for streptococcal pyrogenic exotoxin B and F (speB and speF), most isolates (97.3% and 92.8%) harboured speG and smeZ, respectively, 8.1% of isolates were ssa positive, and 3.6% encoded speL. No statistically significant association was found between emm type or toxigenic profile and invasiveness of isolates.
- 650 12
- $a Streptococcus pyogenes $x izolace a purifikace $x klasifikace $x patogenita $7 D013297
- 650 _2
- $a sérotypizace $7 D012703
- 650 _2
- $a antigeny bakteriální $7 D000942
- 650 _2
- $a mikrobiální genetika $x metody $7 D005827
- 650 12
- $a polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí $x využití $7 D020133
- 650 _2
- $a statistika jako téma $7 D013223
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 655 _2
- $a tabulky $7 D020501
- 700 1_
- $a Lžičařová, Daniela $7 _AN069171 $u NRL pro streptokokové nákazy SZÚ-CEM
- 700 1_
- $a Kozáková, Jana $7 xx0191628 $u NRL pro streptokokové nákazy SZÚ-CEM
- 773 0_
- $t Zprávy Centra epidemiologie a mikrobiologie $x 1804-8668 $g Roč. 23, č. 10 (2014), s. 365-367 $w MED00174568
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1981 $c 564 b $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20150509065413 $b ABA008
- 991 __
- $a 20170207135217 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1067218 $s 892679
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2014 $b 23 $c 10 $d 365-367 $i 1804-8668 $m Zprávy Centra epidemiologie a mikrobiologie (2011, Print) $x MED00174568
- LZP __
- $c NLK183 $d 20150331 $a NLK 2015-09/pk