Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Průzkumný vrt: jak správně připravit, provést a vyhodnotit séroprevalenční studii
[Exploratory drilling: how to set up, carry out, and evaluate a seroprevalence study]

Zuzana Krátká, Tomáš Fürst, Ondřej Vencálek, Věra Kůrková, Eva Šimečková, Jana Fleischmannová, Jan Strojil, Martin Kuba

. 2020 ; 159 (6) : 217-225.

Jazyk čeština Země Česko

Typ dokumentu práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc20024003

Digitální knihovna NLK
Zdroj
Zdroj

E-zdroje Online

NLK Medline Complete (EBSCOhost) od 2011-01-01

Séroprevalenční studie jsou významným nástrojem umožňujícím zjistit, jaká část populace již byla infikována (např. SARS-CoV-2). Bez těchto informací je pro státní instituce velmi obtížné přijímat správná protiepidemická opatření. Na jaře 2020 proběhla v jižních Čechách, v okresech Strakonice a Písek, středně velká séroprevalenční studie. Vyšetřeno bylo celkem 2011 lidí, a to ve skupině dobrovolníků z řad veřejnosti a vybraných profesních skupin. Stanovení protilátek IgA a IgG proti koronaviru bylo provedeno metodou ELISA Euroimmun. Zjistili jsme, že v květnu 2020 mělo protilátky proti koronaviru 2,9 % obyvatel okresu Strakonice a 1,9 % obyvatel okresu Písek. Na jednu osobu s pozitivním testem PCR tedy připadlo dalších nejméně 50 osob s protilátkami proti koronaviru. Při provádění séroprevalenčních studií je potřeba řešit 3 základní problémy. Je nutné dobře studii naplánovat a promyslet, jaké varianty výsledků lze očekávat. Také vybrat kvalitní testy známých parametrů, které umožnují kvalifikovaně odhadnout podíl falešně pozitivních a falešně negativních výsledků. V neposlední řadě musíme umět data rozumně vyhodnotit a vyvodit z nich správné závěry a zobecnění. Na konkrétním případě séroprevalenční studie z Jihočeského kraje dále ukazujeme, jak správně řešit případné komplikace, které mohou nastat při takto rozsáhlém testování.

Seroprevalence studies represent a very important tool to find out what fraction of population has already met with the new type of coronavirus (e.g. SARS-CoV-2). Without these data, it is almost impossible for the state authorities to manage the epidemic and adopt rational measures. This article brings the results of a medium-sized seroprevalence study which was carried out in the spring of 2020 in South Bohemia. In the Strakonice and Písek regions, the ELISA method was used to test the prevalence of IgA and IgG antibodies in 2011 subjects, volunteers from general public and selected professions working in areas with a higher exposure to the infection. The study showed that already in May 2020, 2.9% of inhabitants of the Strakonice region and 1.9% of inhabitants of the Písek region had antibodies against the coronavirus. These numbers imply that for each PCR positive person, there were at least fifty others who had probably already undergone the infection. The article points out three types of problems that might occur in such a study. First, the study must be planned correctly, and possible outcomes must be pre-assessed. Second, an appropriate test must be selected with known parameters. This enables us to correctly estimate the share of false positive and false negative results. Third, the data must be evaluated in a reasonable way and correct inference must be performed. We offer a set of recommendations how to manage these issues and how to solve problems that inevitably arise in such a large-scale testing.

Exploratory drilling: how to set up, carry out, and evaluate a seroprevalence study

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc20024003
003      
CZ-PrNML
005      
20210114175407.0
007      
ta
008      
201207s2020 xr d f 000 0|cze||
009      
AR
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a cze $b eng
044    __
$a xr
100    1_
$a Krátká, Zuzana $u Imunologická laboratoř GENNET, s. r. o., Praha; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $7 _AN108504
245    10
$a Průzkumný vrt: jak správně připravit, provést a vyhodnotit séroprevalenční studii / $c Zuzana Krátká, Tomáš Fürst, Ondřej Vencálek, Věra Kůrková, Eva Šimečková, Jana Fleischmannová, Jan Strojil, Martin Kuba
246    31
$a Exploratory drilling: how to set up, carry out, and evaluate a seroprevalence study
520    3_
$a Séroprevalenční studie jsou významným nástrojem umožňujícím zjistit, jaká část populace již byla infikována (např. SARS-CoV-2). Bez těchto informací je pro státní instituce velmi obtížné přijímat správná protiepidemická opatření. Na jaře 2020 proběhla v jižních Čechách, v okresech Strakonice a Písek, středně velká séroprevalenční studie. Vyšetřeno bylo celkem 2011 lidí, a to ve skupině dobrovolníků z řad veřejnosti a vybraných profesních skupin. Stanovení protilátek IgA a IgG proti koronaviru bylo provedeno metodou ELISA Euroimmun. Zjistili jsme, že v květnu 2020 mělo protilátky proti koronaviru 2,9 % obyvatel okresu Strakonice a 1,9 % obyvatel okresu Písek. Na jednu osobu s pozitivním testem PCR tedy připadlo dalších nejméně 50 osob s protilátkami proti koronaviru. Při provádění séroprevalenčních studií je potřeba řešit 3 základní problémy. Je nutné dobře studii naplánovat a promyslet, jaké varianty výsledků lze očekávat. Také vybrat kvalitní testy známých parametrů, které umožnují kvalifikovaně odhadnout podíl falešně pozitivních a falešně negativních výsledků. V neposlední řadě musíme umět data rozumně vyhodnotit a vyvodit z nich správné závěry a zobecnění. Na konkrétním případě séroprevalenční studie z Jihočeského kraje dále ukazujeme, jak správně řešit případné komplikace, které mohou nastat při takto rozsáhlém testování.
520    9_
$a Seroprevalence studies represent a very important tool to find out what fraction of population has already met with the new type of coronavirus (e.g. SARS-CoV-2). Without these data, it is almost impossible for the state authorities to manage the epidemic and adopt rational measures. This article brings the results of a medium-sized seroprevalence study which was carried out in the spring of 2020 in South Bohemia. In the Strakonice and Písek regions, the ELISA method was used to test the prevalence of IgA and IgG antibodies in 2011 subjects, volunteers from general public and selected professions working in areas with a higher exposure to the infection. The study showed that already in May 2020, 2.9% of inhabitants of the Strakonice region and 1.9% of inhabitants of the Písek region had antibodies against the coronavirus. These numbers imply that for each PCR positive person, there were at least fifty others who had probably already undergone the infection. The article points out three types of problems that might occur in such a study. First, the study must be planned correctly, and possible outcomes must be pre-assessed. Second, an appropriate test must be selected with known parameters. This enables us to correctly estimate the share of false positive and false negative results. Third, the data must be evaluated in a reasonable way and correct inference must be performed. We offer a set of recommendations how to manage these issues and how to solve problems that inevitably arise in such a large-scale testing.
650    12
$a COVID-19 $7 D000086382
650    12
$a séroepidemiologické studie $7 D016036
650    _2
$a SARS-CoV-2 $7 D000086402
650    _2
$a sérologické testování na COVID-19 $7 D000087124
650    _2
$a ELISA $7 D004797
650    _2
$a protilátky virové $x krev $7 D000914
650    _2
$a imunoglobulin G $x krev $7 D007074
650    _2
$a imunoglobulin A $x krev $7 D007070
650    _2
$a senzitivita a specificita $7 D012680
650    _2
$a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
650    _2
$a lidé $7 D006801
651    _2
$a Česká republika $7 D018153
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Fürst, Tomáš, $u Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky PřF UP v Olomouci; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $d 1978- $7 mzk2005286891
700    1_
$a Vencálek, Ondřej $u Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky PřF UP v Olomouci; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $7 xx0135535
700    1_
$a Kůrková, Věra $u Mikrobiologická laboratoř Nemocnice Písek, a. s. $7 xx0255294
700    1_
$a Šimečková, Eva $u Centrální laboratoř Nemocnice Strakonice, a. s. $7 xx0105229
700    1_
$a Fleischmannová, Jana $u Centrální laboratoř Nemocnice Strakonice, a. s. $7 xx0094373
700    1_
$a Strojil, Jan, $u Ústav farmakologie LF UP v Olomouci; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $d 1978- $7 xx0107792
700    1_
$a Kuba, Martin, $u OIG power, s. r. o., České Budějovice; Krajský úřad Jihočeského kraje, České Budějovice $d 1973- $7 pna2012693342
773    0_
$w MED00010976 $t Časopis lékařů českých $x 0008-7335 $g Roč. 159, č. 6 (2020), s. 217-225
856    41
$u https://www.prolekare.cz/casopisy/casopis-lekaru-ceskych/2020-6-6/pruzkumny-vrt-jak-spravne-pripravit-provest-a-vyhodnotit-seroprevalencni-studii-125123 $y plný text volně dostupný
910    __
$a ABA008 $b B 1 $c 1068 $y p $z 0
990    __
$a 20201207 $b ABA008
991    __
$a 20210114175413 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1604866 $s 1114680
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2020 $b 159 $c 6 $d 217-225 $i 0008-7335 $m Časopis lékařů českých $x MED00010976 $y 125123
LZP    __
$c NLK182 $d 20210114 $b NLK111 $a Meditorial-20201207

Najít záznam

Citační ukazatele

Pouze přihlášení uživatelé

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...