-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Průzkumný vrt: jak správně připravit, provést a vyhodnotit séroprevalenční studii
[Exploratory drilling: how to set up, carry out, and evaluate a seroprevalence study]
Zuzana Krátká, Tomáš Fürst, Ondřej Vencálek, Věra Kůrková, Eva Šimečková, Jana Fleischmannová, Jan Strojil, Martin Kuba
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- MeSH
- COVID-19 * MeSH
- ELISA MeSH
- imunoglobulin A krev MeSH
- imunoglobulin G krev MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- protilátky virové krev MeSH
- SARS-CoV-2 MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- séroepidemiologické studie * MeSH
- sérologické testování na COVID-19 MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Séroprevalenční studie jsou významným nástrojem umožňujícím zjistit, jaká část populace již byla infikována (např. SARS-CoV-2). Bez těchto informací je pro státní instituce velmi obtížné přijímat správná protiepidemická opatření. Na jaře 2020 proběhla v jižních Čechách, v okresech Strakonice a Písek, středně velká séroprevalenční studie. Vyšetřeno bylo celkem 2011 lidí, a to ve skupině dobrovolníků z řad veřejnosti a vybraných profesních skupin. Stanovení protilátek IgA a IgG proti koronaviru bylo provedeno metodou ELISA Euroimmun. Zjistili jsme, že v květnu 2020 mělo protilátky proti koronaviru 2,9 % obyvatel okresu Strakonice a 1,9 % obyvatel okresu Písek. Na jednu osobu s pozitivním testem PCR tedy připadlo dalších nejméně 50 osob s protilátkami proti koronaviru. Při provádění séroprevalenčních studií je potřeba řešit 3 základní problémy. Je nutné dobře studii naplánovat a promyslet, jaké varianty výsledků lze očekávat. Také vybrat kvalitní testy známých parametrů, které umožnují kvalifikovaně odhadnout podíl falešně pozitivních a falešně negativních výsledků. V neposlední řadě musíme umět data rozumně vyhodnotit a vyvodit z nich správné závěry a zobecnění. Na konkrétním případě séroprevalenční studie z Jihočeského kraje dále ukazujeme, jak správně řešit případné komplikace, které mohou nastat při takto rozsáhlém testování.
Seroprevalence studies represent a very important tool to find out what fraction of population has already met with the new type of coronavirus (e.g. SARS-CoV-2). Without these data, it is almost impossible for the state authorities to manage the epidemic and adopt rational measures. This article brings the results of a medium-sized seroprevalence study which was carried out in the spring of 2020 in South Bohemia. In the Strakonice and Písek regions, the ELISA method was used to test the prevalence of IgA and IgG antibodies in 2011 subjects, volunteers from general public and selected professions working in areas with a higher exposure to the infection. The study showed that already in May 2020, 2.9% of inhabitants of the Strakonice region and 1.9% of inhabitants of the Písek region had antibodies against the coronavirus. These numbers imply that for each PCR positive person, there were at least fifty others who had probably already undergone the infection. The article points out three types of problems that might occur in such a study. First, the study must be planned correctly, and possible outcomes must be pre-assessed. Second, an appropriate test must be selected with known parameters. This enables us to correctly estimate the share of false positive and false negative results. Third, the data must be evaluated in a reasonable way and correct inference must be performed. We offer a set of recommendations how to manage these issues and how to solve problems that inevitably arise in such a large-scale testing.
BIN Centrum pro bayesovskou inferenci
Centrální laboratoř Nemocnice Strakonice a s
Imunologická laboratoř GENNET s r o Praha
Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky PřF UP v Olomouci
Krajský úřad Jihočeského kraje České Budějovice
Mikrobiologická laboratoř Nemocnice Písek a s
Exploratory drilling: how to set up, carry out, and evaluate a seroprevalence study
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc20024003
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20210114175407.0
- 007
- ta
- 008
- 201207s2020 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Krátká, Zuzana $u Imunologická laboratoř GENNET, s. r. o., Praha; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $7 _AN108504
- 245 10
- $a Průzkumný vrt: jak správně připravit, provést a vyhodnotit séroprevalenční studii / $c Zuzana Krátká, Tomáš Fürst, Ondřej Vencálek, Věra Kůrková, Eva Šimečková, Jana Fleischmannová, Jan Strojil, Martin Kuba
- 246 31
- $a Exploratory drilling: how to set up, carry out, and evaluate a seroprevalence study
- 520 3_
- $a Séroprevalenční studie jsou významným nástrojem umožňujícím zjistit, jaká část populace již byla infikována (např. SARS-CoV-2). Bez těchto informací je pro státní instituce velmi obtížné přijímat správná protiepidemická opatření. Na jaře 2020 proběhla v jižních Čechách, v okresech Strakonice a Písek, středně velká séroprevalenční studie. Vyšetřeno bylo celkem 2011 lidí, a to ve skupině dobrovolníků z řad veřejnosti a vybraných profesních skupin. Stanovení protilátek IgA a IgG proti koronaviru bylo provedeno metodou ELISA Euroimmun. Zjistili jsme, že v květnu 2020 mělo protilátky proti koronaviru 2,9 % obyvatel okresu Strakonice a 1,9 % obyvatel okresu Písek. Na jednu osobu s pozitivním testem PCR tedy připadlo dalších nejméně 50 osob s protilátkami proti koronaviru. Při provádění séroprevalenčních studií je potřeba řešit 3 základní problémy. Je nutné dobře studii naplánovat a promyslet, jaké varianty výsledků lze očekávat. Také vybrat kvalitní testy známých parametrů, které umožnují kvalifikovaně odhadnout podíl falešně pozitivních a falešně negativních výsledků. V neposlední řadě musíme umět data rozumně vyhodnotit a vyvodit z nich správné závěry a zobecnění. Na konkrétním případě séroprevalenční studie z Jihočeského kraje dále ukazujeme, jak správně řešit případné komplikace, které mohou nastat při takto rozsáhlém testování.
- 520 9_
- $a Seroprevalence studies represent a very important tool to find out what fraction of population has already met with the new type of coronavirus (e.g. SARS-CoV-2). Without these data, it is almost impossible for the state authorities to manage the epidemic and adopt rational measures. This article brings the results of a medium-sized seroprevalence study which was carried out in the spring of 2020 in South Bohemia. In the Strakonice and Písek regions, the ELISA method was used to test the prevalence of IgA and IgG antibodies in 2011 subjects, volunteers from general public and selected professions working in areas with a higher exposure to the infection. The study showed that already in May 2020, 2.9% of inhabitants of the Strakonice region and 1.9% of inhabitants of the Písek region had antibodies against the coronavirus. These numbers imply that for each PCR positive person, there were at least fifty others who had probably already undergone the infection. The article points out three types of problems that might occur in such a study. First, the study must be planned correctly, and possible outcomes must be pre-assessed. Second, an appropriate test must be selected with known parameters. This enables us to correctly estimate the share of false positive and false negative results. Third, the data must be evaluated in a reasonable way and correct inference must be performed. We offer a set of recommendations how to manage these issues and how to solve problems that inevitably arise in such a large-scale testing.
- 650 12
- $a COVID-19 $7 D000086382
- 650 12
- $a séroepidemiologické studie $7 D016036
- 650 _2
- $a SARS-CoV-2 $7 D000086402
- 650 _2
- $a sérologické testování na COVID-19 $7 D000087124
- 650 _2
- $a ELISA $7 D004797
- 650 _2
- $a protilátky virové $x krev $7 D000914
- 650 _2
- $a imunoglobulin G $x krev $7 D007074
- 650 _2
- $a imunoglobulin A $x krev $7 D007070
- 650 _2
- $a senzitivita a specificita $7 D012680
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 651 _2
- $a Česká republika $7 D018153
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Fürst, Tomáš, $u Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky PřF UP v Olomouci; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $d 1978- $7 mzk2005286891
- 700 1_
- $a Vencálek, Ondřej $u Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky PřF UP v Olomouci; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $7 xx0135535
- 700 1_
- $a Kůrková, Věra $u Mikrobiologická laboratoř Nemocnice Písek, a. s. $7 xx0255294
- 700 1_
- $a Šimečková, Eva $u Centrální laboratoř Nemocnice Strakonice, a. s. $7 xx0105229
- 700 1_
- $a Fleischmannová, Jana $u Centrální laboratoř Nemocnice Strakonice, a. s. $7 xx0094373
- 700 1_
- $a Strojil, Jan, $u Ústav farmakologie LF UP v Olomouci; BIN – Centrum pro bayesovskou inferenci $d 1978- $7 xx0107792
- 700 1_
- $a Kuba, Martin, $u OIG power, s. r. o., České Budějovice; Krajský úřad Jihočeského kraje, České Budějovice $d 1973- $7 pna2012693342
- 773 0_
- $w MED00010976 $t Časopis lékařů českých $x 0008-7335 $g Roč. 159, č. 6 (2020), s. 217-225
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/casopis-lekaru-ceskych/2020-6-6/pruzkumny-vrt-jak-spravne-pripravit-provest-a-vyhodnotit-seroprevalencni-studii-125123 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1 $c 1068 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20201207 $b ABA008
- 991 __
- $a 20210114175413 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1604866 $s 1114680
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2020 $b 159 $c 6 $d 217-225 $i 0008-7335 $m Časopis lékařů českých $x MED00010976 $y 125123
- LZP __
- $c NLK182 $d 20210114 $b NLK111 $a Meditorial-20201207