-
Something wrong with this record ?
Úvod do problematiky lidského močového mikrobiomu
[An introduction to the study of human urinary microbiome]
Jan Hrbáček, Vítězslav Hanáček, Pavel Čermák, Daniel Morais, Roman Zachoval
Language Czech Country Czech Republic
Document type Review
- MeSH
- Culture Techniques MeSH
- Humans MeSH
- Microbiota * MeSH
- Urine microbiology MeSH
- Urogenital System * microbiology MeSH
- High-Throughput Nucleotide Sequencing MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Publication type
- Review MeSH
Předpoklad sterility zdravé moči byl v posledních letech vyvrácen průkazem existence močového mikrobiomu (MM). Rozšířená kvantitativní močová kultivace poskytuje inokulu delší čas k inkubaci za rozličných růstových podmínek a dokazuje přítomnost bakterií ve vzorcích hodnocených standardní kultivací jako negativní. Masivní paralelní sekvenování (NGS) s vysokou citlivostí detekuje bakteriální gen pro ribozomální 16S RNA a podle variabilních sekvencí tohoto genu lze daný mikroorganismus taxonomicky zařadit. Lidský MM tvoří převážně taxony spadající do kmenů Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes a Actinobacteria. U žen dominuje rod Lactobacillus, u mužů není rozdělení urotypů zatím zcela objasněno. Změny ve složení MM jsou dle dosavadních poznatků spojovány s funkčními poruchami urogenitálního traktu (symptomy dolních močových cest, urgentní inkontinence, neurogenní měchýř, chronická renální insuficience), syndromem chronické pánevní bolesti, intersticiální cystitidou a dokonce s nádory močového měchýře. MM může potenciálně plnit řadu úloh, které bude teprve třeba objasnit, a předpokládá se jeho diagnostické i terapeutické využití.
The assumption of healthy urine being sterile has been contradicted recently when the existence of urinary microbiota (UM) was revealed. Extended quantitative urine culture is based on longer incubation times in a wide selection of diverse growth conditions; bacteria are detected even in samples reported as negative by the standard urine culture protocol. Next‑generation sequencing helps with taxonomic assignment of prokaryotic DNA fragments according to the sequence in hypervariable regions of the 16S rRNA gene. Human UM is composed of the phyla Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes and Actinobacteria. Female UM is dominated by the genus Lactobacillus, male urotypes have not been assigned with certainty to date. Changes in UM have been associated with functional disorders of the genitourinary tract (lower urinary tract symptoms, urge urinary incontinence, neurogenic bladder dysfunction, chronic kidney disease), chronic pelvic pain syndrome, interstitial cystitis and even with urinary bladder cancer. UM may potentially play many a role; what they are is a matter of ongoing research. UM might be a useful tool in the diagnostics and therapy of disease.
Mikrobiologický ústav Akademie věd České republiky Praha
An introduction to the study of human urinary microbiome
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc21017259
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20210812195540.0
- 007
- ta
- 008
- 210719s2021 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hrbáček, Jan $u Urologická klinika 3. LF UK a Thomayerovy nemocnice, Praha $7 xx0208970
- 245 10
- $a Úvod do problematiky lidského močového mikrobiomu / $c Jan Hrbáček, Vítězslav Hanáček, Pavel Čermák, Daniel Morais, Roman Zachoval
- 246 31
- $a An introduction to the study of human urinary microbiome
- 520 3_
- $a Předpoklad sterility zdravé moči byl v posledních letech vyvrácen průkazem existence močového mikrobiomu (MM). Rozšířená kvantitativní močová kultivace poskytuje inokulu delší čas k inkubaci za rozličných růstových podmínek a dokazuje přítomnost bakterií ve vzorcích hodnocených standardní kultivací jako negativní. Masivní paralelní sekvenování (NGS) s vysokou citlivostí detekuje bakteriální gen pro ribozomální 16S RNA a podle variabilních sekvencí tohoto genu lze daný mikroorganismus taxonomicky zařadit. Lidský MM tvoří převážně taxony spadající do kmenů Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes a Actinobacteria. U žen dominuje rod Lactobacillus, u mužů není rozdělení urotypů zatím zcela objasněno. Změny ve složení MM jsou dle dosavadních poznatků spojovány s funkčními poruchami urogenitálního traktu (symptomy dolních močových cest, urgentní inkontinence, neurogenní měchýř, chronická renální insuficience), syndromem chronické pánevní bolesti, intersticiální cystitidou a dokonce s nádory močového měchýře. MM může potenciálně plnit řadu úloh, které bude teprve třeba objasnit, a předpokládá se jeho diagnostické i terapeutické využití.
- 520 9_
- $a The assumption of healthy urine being sterile has been contradicted recently when the existence of urinary microbiota (UM) was revealed. Extended quantitative urine culture is based on longer incubation times in a wide selection of diverse growth conditions; bacteria are detected even in samples reported as negative by the standard urine culture protocol. Next‑generation sequencing helps with taxonomic assignment of prokaryotic DNA fragments according to the sequence in hypervariable regions of the 16S rRNA gene. Human UM is composed of the phyla Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes and Actinobacteria. Female UM is dominated by the genus Lactobacillus, male urotypes have not been assigned with certainty to date. Changes in UM have been associated with functional disorders of the genitourinary tract (lower urinary tract symptoms, urge urinary incontinence, neurogenic bladder dysfunction, chronic kidney disease), chronic pelvic pain syndrome, interstitial cystitis and even with urinary bladder cancer. UM may potentially play many a role; what they are is a matter of ongoing research. UM might be a useful tool in the diagnostics and therapy of disease.
- 650 12
- $a urogenitální systém $x mikrobiologie $7 D014566
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 12
- $a mikrobiota $7 D064307
- 650 _2
- $a kultivační techniky $7 D046508
- 650 _2
- $a moč $x mikrobiologie $7 D014556
- 650 _2
- $a vysoce účinné nukleotidové sekvenování $7 D059014
- 655 _2
- $a přehledy $7 D016454
- 700 1_
- $a Hanáček, Vítězslav $u Urologická klinika 3. LF UK a Thomayerovy nemocnice, Praha $7 xx0246005
- 700 1_
- $a Čermák, Pavel, $u Oddělení klinické mikrobiologie, Thomayerova nemocnice, Praha $d 1956- $7 mzk2008464071
- 700 1_
- $a Morais, Daniel $u Mikrobiologický ústav Akademie věd České republiky, Praha
- 700 1_
- $a Zachoval, Roman, $u Urologická klinika 3. LF UK a Thomayerovy nemocnice, Praha $d 1967- $7 mzk2004248672
- 773 0_
- $w MED00011150 $t Česká urologie $x 1211-8729 $g Roč. 25, č. 1 (2021), s. 17-26
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/ceska-urologie/2021-1-29/uvod-do-problematiky-lidskeho-mocoveho-mikrobiomu-127566 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 2095 $c 916 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20210719 $b ABA008
- 991 __
- $a 20210812195536 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1676316 $s 1137694
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2021 $b 25 $c 1 $d 17-26 $i 1211-8729 $m Česká urologie $x MED00011150 $y 127566
- LZP __
- $c NLK109 $d 20210812 $b NLK111 $a Meditorial-20210719