UV light-induced duplex-to-duplex crosslinking of DNA molecules in aqueous ethanol solutions
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
9559582
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- bakteriofág phi X 174 MeSH
- DNA virů chemie účinky léků účinky záření MeSH
- ethanol farmakologie MeSH
- formamidy farmakologie MeSH
- kationty dvojmocné farmakologie MeSH
- kationty jednomocné farmakologie MeSH
- methanol farmakologie MeSH
- plazmidy chemie účinky léků účinky záření MeSH
- reagencia zkříženě vázaná MeSH
- restrikční mapování MeSH
- roztoky MeSH
- sekvence nukleotidů MeSH
- ultrafialové záření * MeSH
- voda MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- DNA virů MeSH
- ethanol MeSH
- formamide MeSH Prohlížeč
- formamidy MeSH
- kationty dvojmocné MeSH
- kationty jednomocné MeSH
- methanol MeSH
- reagencia zkříženě vázaná MeSH
- roztoky MeSH
- voda MeSH
Ultraviolet light is known to generate crosslinks between the complementary strands of DNA and between DNA and proteins. Here we demonstrate that the UV light also crosslinks DNA duplexes to other DNA duplexes. However, the duplex-to-duplex crosslinks only appear in the presence of about 75% (vol/vol) ethanol plus a millimolar or submillimolar concentration of monovalent or divalent cations, e.g. 2 mM Na+. Methanol or formamide are ineffective. The present observations provide a direct means to detect physical contacts of DNA molecules or their parts, e.g. during recombination. It is remarkable that the solution conditions leading to the duplex-to-duplex UV light-induced crosslink formation are the same as those inducing the B-to-A conformational transition of DNA.
Mapping the B-A conformational transition along plasmid DNA
