Comparison of genetic variability between Czech and foreign isolates of phytopathogenic bacteria Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus by Rep-PCR technique
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print
Typ dokumentu srovnávací studie, časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
12422527
DOI
10.1007/bf02818707
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- Actinomycetales genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- DNA bakterií genetika izolace a purifikace MeSH
- genetická variace MeSH
- nemoci rostlin mikrobiologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- repetitivní sekvence nukleových kyselin MeSH
- Solanum tuberosum mikrobiologie MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Názvy látek
- DNA bakterií MeSH
Repetitive-sequence-based polymerase chain reaction (Rep-PCR) method was used for analysis of genetic variability among bacterial populations from different world locations. Collection of 26 Czech and 13 foreign strains of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus was amplified using BOX primer targeting to repetitive motif occurring in eubacterial genomes. Genetic fingerprints were visually compared and statistically evaluated by cluster analysis. Genetic similarity was estimated to be approximately 80% among all tested strains. Populations of these bacteria seem to be highly homogeneous; potential influence of geographic origin was not confirmed.
Zobrazit více v PubMed
J Bacteriol. 1992 Jul;174(14):4525-9 PubMed
Appl Microbiol. 1967 Nov;15(6):1523-4 PubMed
N Engl J Med. 1987 Oct 15;317(16):985-90 PubMed
World J Microbiol Biotechnol. 1996 Mar;12(2):163-74 PubMed
Annu Rev Phytopathol. 1999;37:81-125 PubMed
Phytopathology. 1998 Aug;88(8):862-8 PubMed
