DicodonUse: the programme for dicodon bias visualization in prokaryotes
Jazyk angličtina Země Česko Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
12512801
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- Bacteria genetika MeSH
- bakteriální geny MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- otevřené čtecí rámce MeSH
- prokaryotické buňky fyziologie MeSH
- sekvence nukleotidů MeSH
- sekvenční analýza DNA metody MeSH
- software * MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
The DicodonUse programme is aimed at a fast and simple assessment of genes present in prokaryotic nucleotide sequences. It identifies open reading frames that are not genes, and it distinguishes the genes that inherently belong to the genome in question from the genes that were inserted into the genome in the course of evolution. The programme is based on frequencies of dicodons used by the organism.
Complete genome sequence of the haloaromatic acid-degrading bacterium Achromobacter xylosoxidans A8