PRIMEX: rapid identification of oligonucleotide matches in whole genomes
Bioinformatics (Oxford, England).
2003 Dec 12 ;
19 (18) :
2486-8.
Jazyk angličtina Země Velká Británie, Anglie Médium print
Typ dokumentu srovnávací studie, hodnotící studie, časopisecké články, validační studie
Perzistentní odkaz
https://www.medvik.cz/link/pmid14668240
- MeSH
- algoritmy * MeSH
- genom * MeSH
- oligonukleotidy genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA metody MeSH
- sekvenční seřazení metody MeSH
- software * MeSH
- uživatelské rozhraní počítače MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
- srovnávací studie MeSH
- validační studie MeSH
- Názvy látek
- oligonukleotidy MeSH
SUMMARY: PRIMEX (PRImer Match EXtractor) can detect oligonucleotide sequences in whole genomes, allowing for mismatches. Using a word lookup table and server functionality, PRIMEX accepts queries from client software and returns matches rapidly. We find it faster and more sensitive than currently available tools. AVAILABILITY: Running applications and source code have been made available at http://bioinformatics.cribi.unipd.it/primex
Citace poskytuje Crossref.org
