Porcine OGN and ASPN: mapping, polymorphisms and use for quantitative trait loci identification for growth and carcass traits in a Meishan x Piétrain intercross
Jazyk angličtina Země Velká Británie, Anglie Médium print
Typ dokumentu srovnávací studie, časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
16879361
DOI
10.1111/j.1365-2052.2006.01480.x
PII: AGE1480
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- glykoproteiny genetika MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus * MeSH
- křížení genetické MeSH
- lidé MeSH
- lokus kvantitativního znaku * MeSH
- mapování chromozomů MeSH
- mezibuněčné signální peptidy a proteiny MeSH
- mikrosatelitní repetice MeSH
- prasata genetika růst a vývoj MeSH
- proteoglykany genetika MeSH
- syntenie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
- Názvy látek
- glykoproteiny MeSH
- mezibuněčné signální peptidy a proteiny MeSH
- OGN protein, human MeSH Prohlížeč
- proteoglykany MeSH
The porcine orthologues of human chromosome HSA9q22.31 genes osteoglycin (OGN) and asporin (ASPN) were mapped to porcine chromosome SSC3 using linkage analysis and a somatic cell hybrid panel. This mapping was refined to SSC3q11 using fluorescence in situ hybridization. These results confirm the existence of a small conserved synteny group between SSC3 and HSA9. Polymorphisms were revealed in both genes, including a pentanucleotide microsatellite (SCZ003) in OGN and two single nucleotide polymorphisms (AM181682.1:g.780G>T and AM181682.1:g.825T>C) in ASPN. The two genes were included in a set of markers for quantitative trait loci (QTL) mapping on SSC3 in the Hohenheim Meishan x Piétrain F2 family. Major QTL for growth and carcass traits were centred in the ASPN-SW902 region.
Citace poskytuje Crossref.org
