Importance of oligomerisation on Pseudomonas aeruginosaLectin-II binding affinity. In silico and in vitro mutagenesis
Jazyk angličtina Země Německo Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- MeSH
- bakteriální adheziny chemie genetika metabolismus MeSH
- Escherichia coli genetika MeSH
- fukosa chemie metabolismus MeSH
- kalorimetrie metody MeSH
- kinetika MeSH
- kompetitivní vazba MeSH
- krystalizace MeSH
- kvarterní struktura proteinů MeSH
- lektiny chemie genetika metabolismus MeSH
- molekulární modely MeSH
- multimerizace proteinu MeSH
- mutace * MeSH
- počítačová simulace MeSH
- Pseudomonas aeruginosa genetika metabolismus MeSH
- rekombinantní proteiny chemie metabolismus MeSH
- sekvenční delece MeSH
- terciární struktura proteinů MeSH
- termodynamika MeSH
- vazba proteinů MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- adhesin, Pseudomonas MeSH Prohlížeč
- bakteriální adheziny MeSH
- fukosa MeSH
- lektiny MeSH
- rekombinantní proteiny MeSH
The effect of terminal GLY114* deletion on the binding affinity of the PA-IIL lectin toward L: -fucose was investigated. Both experimental (isothermal titration calorimetry) and computational (molecular dynamics simulations) methods have shown that the deletion mutation decreases the L-fucose affinity. It implies that the PA-IIL saccharide binding affinity is influenced by the dimerization of the lectin. A detailed analysis of computational data confirms the key role of electrostatic interactions in the PA-IIL/saccharide binding.
Zobrazit více v PubMed
Anal Biochem. 1989 May 15;179(1):131-7 PubMed
J Comput Chem. 2004 Oct;25(13):1605-12 PubMed
Bioinformatics. 2008 Sep 1;24(17):1955-6 PubMed
Chem Rev. 2002 Feb;102(2):387-429 PubMed
FEBS Lett. 2006 Feb 6;580(3):982-7 PubMed
Proc Natl Acad Sci U S A. 2001 Sep 11;98(19):10541-5 PubMed
Biochem J. 2005 Jul 15;389(Pt 2):325-32 PubMed
Adv Exp Med Biol. 2003;535:17-32 PubMed
J Chem Inf Model. 2007 Jan-Feb;47(1):122-33 PubMed
Acc Chem Res. 2000 Dec;33(12):889-97 PubMed
Nature. 2007 Apr 26;446(7139):1038-45 PubMed
Proteins. 2005 Feb 15;58(3):735-46 PubMed
BMC Struct Biol. 2007 Jun 01;7:36 PubMed
Science. 2001 Mar 23;291(5512):2370-6 PubMed
Methods Enzymol. 1982;83:378-85 PubMed
Proteins. 2008 Jul;72(1):382-92 PubMed
